Chlamydomonas reinhardtii sec23a ve sec23b mutantlarının fenotipik analizi
Phenotypic analysis of chlamydomonas reinhardtii sec23a and sec23b mutants
- Tez No: 1024249
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MÜNEVVER AKSOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Ziraat, Biyoteknoloji, Genetics, Agriculture, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
COPII vezikülleri, proteinlerin endoplazmik retikulumdan Golgi aygıtına taşınmasında görev alan temel hücre içi taşıma sistemini oluşturmakta; bu sürecin kilit düzenleyicisi olan SEC23 proteini farklı organizmalarda birden fazla paralog olarak bulunmaktadır. Bu çalışmada, Chlamydomonas reinhardtii'de yalnızca %18,9 amino asit dizisi benzerliğine sahip iki SEC23 paraloğunun CrSEC23A ve CrSEC23B işlevsel farklılıklarını ortaya koymak amacıyla sec23a ve sec23b i8 insersiyonel mutant hatları incelenmiştir. Mutant hatlar PCR analizi ile doğrulanmış; yabanıl tip suşlarla gerçekleştirilen çaprazlamalar aracılığıyla eşeyli üreme kapasiteleri değerlendirilmiştir. Miksotrofik (TAP) ve ototrofik (HS) koşullarda büyüme hızı, hücre morfolojisi ve fotosentetik pigment içerikleri (klorofil a/b ve karotenoid) karşılaştırmalı olarak analiz edilmiştir. sec23a mutantında flagellar aglütinasyon son derece düşük düzeyde gerçekleşmiş, hücre morfolojisi bozulmuş ve test edilen kombinasyonların büyük bölümünde canlı proje elde edilememiştir. Büyüme analizlerinde bu mutant, TAP koşullarında dahi yabanıl tipe kıyasla belirgin kısıtlanma sergilemiştir. sec23b i8 BC1 mutantında ise eşeyli üreme kapasitesi büyük ölçüde korunmuş; büyüme gerilimi ağırlıklı olarak ototrofik ve düşük ışık koşullarında belirginleşmiştir. Her iki mutantta da stres koşullarında küme gözlemlenmiş; pigment içerikleri ise genel büyüme farklılıklarına karşın büyük ölçüde korunmuştur. Bu sonuçlar, fotosentetik ökaryotlarda COPII trafiğinin paralog-spesifik düzenlenişine ilişkin literatüre özgün katkı sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
COPII vesicles constitute the primary intracellular transport system responsible for shuttling proteins from the endoplasmic reticulum (ER) to the Golgi apparatus, with the SEC23 protein serving as the key regulator of this process. SEC23 exists as multiple paralogs across different organisms, and whether these paralogs are functionally interchangeable remains an active area of investigation. In this study, the sec23a and sec23b i8 insertional mutant lines of Chlamydomonas reinhardtii were characterized to examine the functional divergence between CrSEC23A and CrSEC23B, two paralogs sharing only 18.9% amino acid sequence identity. Both mutant lines were confirmed by PCR analysis, and their sexual reproduction capacity was evaluated through crosses with wild-type strains. Growth rate, cell morphology, and photosynthetic pigment contents (chlorophyll a/b and carotenoids) were comparatively analyzed under mixotrophic (TAP medium) and autotrophic (HS medium) conditions at normal and low light intensities. The sec23a mutant exhibited severely impaired flagellar agglutination, abnormal cell morphology, and failed to yield viable progeny in most crossing combinations. This mutant also displayed significant growth retardation even under optimal TAP conditions. In contrast, the sec23b i8 BC1 mutant largely retained sexual reproduction capacity, producing three viable progeny from a cross with CC1009, while growth impairment was predominantly observed under autotrophic and low-light conditions. Cell aggregation was detected in both mutants under stress conditions, whereas photosynthetic pigment profiles remained largely preserved despite growth differences. These findings demonstrate that CrSEC23A and CrSEC23B are functionally distinct and cannot substitute for one another in C. reinhardtii. The results contribute original insights into the paralog-specific regulation of COPII-mediated vesicular trafficking in photosynthetic eukaryotes.
Benzer Tezler
- Chlamydomonas reinhardtii'de SEC24B insersiyonel mutantlarının genetik bağlantı ve fenotipik analizleri
Genetic linkage and phenotypic analysis of Chlamydomonas reinhardtii SEC24B insertional mutants
SİBEL KALA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜNEVVER AKSOY
- Yeşil alg Chlamydomonas reinhardtii'de sec23b insersiyonel mutantlarının genetik bağlantı ve fenotipik analizleri
Genetic connection and phenotypic analysis of sec23b insersional mutants in green alg Chlamydomonas reinhardtii
ÖZGÜN MUSUL
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜNEVVER AKSOY
- Chlamydomonas reinhardtii'de COPII vezikül altbirimi SEC24A insersiyonel mutantlarının genetik linkaj ve fenotipik analizleri
Genetic linkage and phenotypic analyses of COPII vesiclesubunit SEC24A insertion mutants in Chlamydomonas reinhardtii
SEVİNÇ EVREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜNEVVER AKSOY
- Chlamydomonas reinhardtii yeşil alginde ağır metal stresi varlığında ısı şoku proteini ve metallotiyonin ekspresyonunun incelenmesi
Expression analysis of heat shock protein and metallothionein against heavy metal stress in Chlamydomonas reinhardtii green algae
GÜNSELİ KURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEZHUN GÖREN
PROF. DR. ABDUL REZZAK MEMON
- Chlamydomonas reinhardtii'de rekombinant protein üretimi
The recombinant protein production in chlamydomonas reinhardtii
ÖZNUR CAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyoteknolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KÖKSAL PABUÇCU