Ailevi Akdeniz Ateşi hastası çocukların remisyon ve ateşlenme dönemlerindeki kan mikrobiyotalarının hastalık periyotları ile ilişkisi
The relationship between blood microbiota of juvenile Familial Mediterranean Fever disease during remission and attack periods with disease episodes
- Tez No: 1025197
- Danışmanlar: PROF. DR. BEKİR SAMİ KOCAZEYBEK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Romatoloji, Microbiology, Rheumatology
- Anahtar Kelimeler: Ailevi akdeniz ateşi, Familial mediterranean fever
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA), tekrarlayan ateş ve serözit atakları ile karakterize, immünogenetik temelli, immünopatogenez seyirli otoenflamatuvar bir hastalıktır. Hastalığın genetik temeli iyi tanımlanmış olmakla birlikte, atakların başlangıcını ve tekrarlama paternini etkileyen faktörler tam olarak aydınlatılamamıştır. Son yıllarda mikrobiyota ve dolaşımdaki mikrobiyal nükleik asitlerin sistemik enflamatuvar hastalıklarla ilişkisi giderek daha fazla araştırılmaktadır. Bu çalışmada, AAA hastası çocuklarda hastalığın atak dönemi sırasında ve takip eden remisyon döneminde, kan ve bağırsak mikrobiyotalarının 16S rRNA amplikon sekanslama yöntemiyle belirlenmesi temelinde karşılaştırmalar yapılarak, bu ataklarda sıklık olarak öne çıkan mikroorganizmaların belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya yaşları 8 ile 18 arasında değişen toplam 25 AAA hastası çocuk dahil edilmiştir. Her olgudan atak döneminde ve takip eden remisyon döneminde kan örneği alınmış, ayrıca atak döneminde dışkı örneği toplanmıştır. Klinik örneklerden DNA ekstraksiyonu yapıldıktan sonra bakteriyel 16S rRNA gen bölgesini hedefleyen amplikon dizileme metodu kullanılmıştır. Elde edilen dizileme verileri biyoinformatik analizlerden geçirilmiş; alfa çeşitlilik, taksonomik dağılım ve göreceli bolluk analizleri elde edilmiştir. Alfa çeşitlilik analizinde kan atak ve kan remisyon örnekleri arasında tüm olgular için ortak ve tutarlı bir artış ya da azalış paterni saptanmamıştır. Dışkı örneklerinde ise genel olarak kan örneklerine kıyasla daha yüksek çeşitlilik değerleri tespit edilmiştir. Taksonomik dağılım analizinde dışkı örneklerinde Bacillota, Bacteroidota ve Actinomycetota şubelerine ait farklı takımların değişken oranlarda bulunduğu belirlenmiştir. Kan örneklerinde ise Burkholderiales takımının atak döneminde remisyon dönemine göre daha yüksek göreceli bollukta olduğu saptanmıştır. Burkholderiales göreceli bolluğu atak döneminde ortalama %40,44, remisyon döneminde ise ortalama %15,69 olarak bulunmuş ve bu fark Wilcoxon signed-rank testi ile istatistiksel olarak anlamlı saptanmıştır (p<0,001). Alt taksonomik değerlendirmede bu farklılığın, özellikle Burkholderiaceae familyası, Ralstonia cinsi ve Ralstonia insidiosa türü üzerinden oluştuğu görülmüştür. Aile, cins ve tür düzeyinde atak ve remisyon arasında yapılan karşılaştırmalarda görülen düşüş, istatistiksel açıdan anlamlı olarak belirlenmiştir (p<0,001) Sonuç olarak bu çalışma, AAA hastası çocuklarda atak ve remisyon dönemlerinde kan mikrobiyotasını eşleştirilmiş örnekler üzerinden değerlendirmesiyle uluslararası düzeyde ilk çalışma olması yönüyle özgün bir yaklaşım sunmaktadır. Verilerimiz, Burkholderiales takımına ve Ralstonia insidiosa türüne ait mikrobiyal DNA sinyallerinin AAA atak dönemlerinde remisyona göre belirgin şekilde artabileceğini göstermektedir. Bununla birlikte kan düşük biyokütleli bir örnek olduğundan, elde edilen sonuçlar canlı mikroorganizma varlığı veya doğrudan nedensellik olarak yorumlanmamalıdır. AAA atakları ile dolaşımdaki mikrobiyal moleküller arasındaki ilişkinin daha geniş örneklemli, kontrollü ve prospektif çalışmalarla değerlendirilmesi önerilmektedir.
Özet (Çeviri)
Familial Mediterranean Fever (FMF) is an immunogenetically based autoinflammatory disease with an immunopathogenic course, characterized by recurrent episodes of fever and serositis. Although the genetic basis of the disease has been well defined, the factors influencing the onset and recurrence pattern of attacks have not yet been fully elucidated. In recent years, the association between the microbiota, circulating microbial nucleic acids, and systemic inflammatory diseases has increasingly become a subject of scientific investigation. In this study, we aimed to identify microorganisms that are more frequently detected during FMF attacks by comparing the blood and intestinal microbiota of pediatric FMF patients during the attack period and the subsequent remission period using 16S rRNA amplicon sequencing A total of 25 pediatric patients with FMF, aged between 8 and 18 years, were included in the study. Blood samples were obtained from each patient during the attack period and the subsequent remission period, and stool samples were additionally collected during the attack period. Following DNA extraction from the clinical samples, an amplicon sequencing method targeting the bacterial 16S rRNA gene region was employed. The sequencing data obtained were subjected to bioinformatic analyses, and alpha diversity, taxonomic distribution, and relative abundance profiles were evaluated. Alpha diversity analysis revealed no consistent or uniform pattern of increase or decrease between blood samples collected during attack and remission periods across all cases. In contrast, stool samples generally exhibited higher diversity values compared with blood samples. Taxonomic distribution analysis demonstrated that different orders belonging to the phyla Bacillota, Bacteroidota, and Actinomycetota were detected in stool samples at varying proportions. In blood samples, the relative abundance of the order Burkholderiales was found to be higher during the attack period than during the remission period. The mean relative abundance of Burkholderiales was 40.44% during the attack period and 15.69% during the remission period, and this difference was statistically significant according to the Wilcoxon signed-rank test (p<0.001). Subtaxonomic evaluation revealed that this difference was mainly driven by the family Burkholderiaceae, the genus Ralstonia, and the species Ralstonia insidiosa. Comparisons performed at the family, genus, and species levels between attack and remission periods demonstrated a statistically significant decrease during remission (p<0.001). In conclusion, this study presents a novel approach as, to the best of our knowledge, the first study at the international level to evaluate the blood microbiota of pediatric patients with FMF using paired samples collected during attack and remission periods. Our findings indicate that microbial DNA signals belonging to the order Burkholderiales and the species Ralstonia insidiosa may be markedly increased during FMF attacks compared with remission. Nevertheless, since blood is a low-biomass sample type, these findings should not be interpreted as evidence of viable microorganisms or direct causality. Further large-scale, controlled, and prospective studies are warranted to evaluate the relationship between FMF attacks and circulating microbial molecules.
Benzer Tezler
- Gaziantep ili ve çevresinde ailevi akdeniz ateşi hastalığı olan çocukların retrospektif değerlendirilmesi
A retrospective evaluation of children with familial mediterranean fever in the province of Gaziantep and the surrounding area
ALPER DOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGaziantep ÜniversitesiDahili Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. AYŞE BALAT
- Henoch-schönlein purpurası nefriti olan çocukların retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of children with henoch-schonlein purpura nephritis
ESRA ÖZPINAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVGİ YAVUZ
- Ailevi akdeniz ateşli çocuk hastalarda ısı şok protein 90 (HSP 90) ve vitamin düzeylerindeki değişim
The changes of heat shock protein 90 (HSP 90) and vitamin levels in pediatric patients with familial mediterranean fever
SERKAN KUTLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıNecmettin Erbakan ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BÜLENT ATAŞ
- Çocukluk çağında görülen ailevi akdeniz ateşi dışı diğer az bilinen periyodik ateş sendromlarının demografik, klinik, laboratuvar özellikleri, tedavi ve prognozlarının retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of demographic, clinical, laboratory characteristics, treatment and prognosis of other less known periodic fever syndromes other than familial mediterranean fever in childhood
EMİNE İZGİ SEZER AYAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıOndokuz Mayıs ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM AYDOĞ
- Çocuklarda ailevi Akdeniz ateşinde trombosit ilişkili değişkenlerin önemi
The importance of platelet-related variables in familial mediterranean disease in children
BESİM HACIOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAydın Adnan Menderes ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERAH SÖNMEZ