Geri Dön

Consequences of site-directed mutations in the helicase domains of the cockayne syndrome group B gene

Başlık çevirisi mevcut değil.

  1. Tez No: 107648
  2. Yazar: MELTEM MÜFTÜOĞLU
  3. Danışmanlar: DR. VİLHELM A. BOHR, PROF.DR. NAZMİ ÖZER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Cockayne sendromu, CSB protein, Transkripsiyona kenetlenmiş tamir, Nükleotit eksizyon tamiri, 4-Nitrokinolin, Cockayne syndrome, CSB protein, Transcription-coupled repair, Nucleotide Excision repair, 4-Nitroquinoline
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 119

Özet

IV ÖZET Mttftüoğlu, M., Cockayne sendromu B grubu geni helikaz domainlerindeki bölge-yönelimli mutasyonların sonuçları, Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya Programı Doktora Tezi, Ankara, 2001. Cockayne sendromu çeşitli nörolojik ve gelişim anamolileri ile karakterize kalıtsal bir hastalıktır. Cockayne sendromunun CS-A and CS-B olmak üzere iki genetik komplementasyon grubu tanımlanmıştır. CSB proteini helikaz protein ailesinin 2. grubuna ve spesifik olarak da SWI/SNF protein ailesine aittir. CSB poteininin transkripsiyona kenetlenmiş tamirde, transkripsiyonda, kromozomun yeniden yapılanmasında ve apoptozda rolü olduğu bildirilmiştir. Fakat CSB proteininin spesifik motiflerinin bu biyolojik yollardaki rolü henüz kesinlik kazanmamıştır. Bu çalışmada, CSB proteininin UV ile muameleden sonra canlılık, RNA sentezi ve yeniden başlaması ve apoptozdaki genetik fonksiyonunu araştırmak üzere, proteinin la, III, V ve Vl'ncı helikaz motiflerinin ve ikinci putatif nükleotit bağlanma motifinin korunmuş rezidularında bölge yönelimli mutagenez ile tek amino asit değişiklikleri oluşturuldu. UV ışığının indüklediği lezyonlar (siklobütan primidin dimerleri) transkripsiyona-kenetlenmiş tamir mekanizması ile tamir edilirken kimyasal karsinojen 4-Nitrokinolin 1 -oksit (4-NQO)'in indüklediği lezyonlar (büyük adüktler) global genom tamiri ile tamir edilmektedir. Bu nedenle, CSB mutant hücre hatlarının canlılığı 4-NQO ile muameleden sonra da analiz edilmiştir. Bu çalışma sonucunda, helikaz motiflerinin (motif la, III, V and VI) korunmuş rezidularında oluşturulan nokta mutasyonlan, UV ile muameleden sonra, CSB proteininin canlılıkta, RNA sentezi ve yeniden başlamasında ve apoptozdaki genetik fonksiyonunu engellediği gösterilmiştir. Benzer bir şekilde, aynı mutantlann 4- NQO'ya da duyarlılığı belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu helikaz motiflerinin bütünlüğü CSB proteininin biyolojik fonksiyonu için önem taşımaktadır. Öte yandan CSB proteinin ikinci putatif nükleotit bağlanma motifi proteininin tamir fonksiyonunda rol oynamamaktadır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Müftüoğlu, M., Consequences of site-directed mutations in the helicase domains of the Cockayne syndrome group B gene, Hacettepe University, Institute of Health Sciences, Biochemistry Programme, Doctor of Philosophy Thesis, Ankara, 2001. Cockayne syndrome (CS) is a human genetic disorder characterized by several neurological and developmental abnormalities. Two genetic complementation groups, CS-A and CS-B, have been identified. The CSB protein belongs to helicase superfamily 2, and more specifically, the SWI/SNF family of proteins. The CSB protein is implicated in transcription-coupled repair (TCR), transcription, chromosome remodeling, and apoptosis. However, the role of specific domains of the CSB protein in these biological pathways has remained unclear. In this study, single amino acid changes in highly conserved residues of helicase motifs la, III, V, VI and a second putative nucleotide-binding motif of the CSB protein were generated by site-directed mutagenesis to analyze the genetic function of the CSB protein in survival, RNA synthesis recovery and apoptosis after UV treatment. The lesions induced by UV light, cyclobutane pyrimidine dimers, are known to be repaired by transcription coupled repair whereas the lesions (bulky adducts) induced by the chemical carcinogen 4-nitroquinoline-l -oxide (4-NQO) are repaired by global genome repair. Therefore, the survival analysis of these CS-B mutant cell lines was also performed after treatment with 4-NQO. The results of this study demonstrated that the point mutations in highly conserved residues of helicase motifs la, III, V and VI abolished the genetic function of the CSB protein in survival, RNA synthesis recovery and apoptosis after UV treatment. Similarly, the same mutants failed to complement the sensitivity toward 4-NQO. Thus, the integrity of these helicase motifs is important for the biological function of the CSB protein. On the contrary, the second putative nucleotide-binding motif of CSB protein does not play a role in the repair function.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    651014

    Diabetes insipidus tanılı hastaların AVP-NPII geninde tanımlanan mutasyonların fonksiyonel analizleri

    Functional analyses of mutations found in AVP-NPII gene of patients diagnosed with diabetes insipidus

    MERVE ÖZCAN TÜRKMEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HATİCE MERGEN

  2. Tez No

    910452

    Functional characterization and reclassification of genomic variants of uncertain significance in hereditary cancers

    Kalıtsal kanserlerde klinik önemi bilinmeyen genomik varyantların fonksiyonel karakterizasyonu ve yeniden sınıflandırılması

    SEVDİCAN ÜSTÜN YILMAZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    GenetikAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UĞUR ÖZBEK

    PROF. DR. MELTEM MÜFTÜOĞLU

  3. Tez No

    222605

    Binding domain analysis of phage display selected peptides

    Faj gösterim yöntemi ile seçilmiş peptidlerin bağlanma bölgelerinin analizi

    ANIL CEBECİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. CANDAN TAMERLER BEHAR

    Y.DOÇ.DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER

  4. Tez No

    419921

    Galaktoziltransferaz-ı etkileşim yüzeyinin yönlendirilmiş mutagenez ve in vivo FRET (förster rezonans enerji transfer) analizi yöntemiyle karakterizasyonu

    Identification of galactosyltransferase-i interaction surface by site directed mutagenesis and i̇n vi̇vo FRET (förster resonance energy transfer) analysis

    BATUHAN YEŞİLYURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    FizyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKHAN CESUR

  5. Tez No

    856069

    Okullarda afet tahliye planı hazırlama: Kaynaşlı örneği

    Disaster evacuation plan preparation in schools: The case of Kaynaşlı

    ALİ KURU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Halk SağlığıSakarya Üniversitesi

    Afet Yönetimi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ NEVRA KAZANCI

Geri Dön