Geri Dön

Pseudomonas izolatlarının çeşitli polihidroksialkanoatları biyoparçalama yeteneklerinin incelenmesi

Investigation of biodegradibilities of some polyhydroxyalkanoates by Pseudomonas isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 109850
  2. Yazar: AHMET ÇOLAK
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. SADETTİN GÜNER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Polihidroksibutirat, Depolimeraz, Biyobozunma, Pseudomonas VI, Polyhydroxybutyrate, Depolymerase, Biodegradability, Pseudomonas VII
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 80

Özet

ÖZET Bu çalışmada, topraktan izole edilen ve daha önce fizyolojik ve biyokimyasal özellikleri açısından Pseudomonas oldukları belirlenen bazı izolatlann polihidroksialkanoat (PHA) parçalama yetenekleri incelendi. 24 saat boyunca izolatlara maruz bırakılan polihidroksibutirat (PHB) filmleri ile kontrol filmlerinin yüzey morfolojisi taramalı elektron mikroskobu ile incelendiğinde, izolatlara maruz bırakılmış filmlerde kontrole göre, çok sayıda düzensiz çukurların ve yüzey erozyonunun olduğu gözlendi. Hem jel geçirgenlik kromatografisi ile tayin edilen molekül kütlesi azalmasının hem de kütle kaybının %30'lara varması bu izolatlann PHB filmlerini parçalayabildiğim göstermektedir. Katı besiyeri ortamı üzerine yayılan polihidroksioktanoat, polihidroksinonanoat ve kopolimer (PHB-co-HV) filmlerinin parçalanması, bu polimer filmleri üzerine izolatlann uygulanması sonucu berrak bölgelerin oluşumu ile de belirlendi. 50-60 kDa molekül kütleli bazı peptidlerin elektroforetik olarak gözlenmesi diğer Pseudomonas türlerinde benzer molekül kütleli bir depolimerazın varlığı ile ilgili önceki gözlemlerle oldukça uyumludur. Depolimeraz aktivitesinin karakterizasyonu ise />-nitrofenilbutirat substratı varlığında gerçekleştirildi ve bazı kinetik değerler daha önce bildirilen değerlerle karşılaştınldı. Elde edilen verilerden, bu aktiviteden sorumlu enzim için bu substrat varlığında Km ve Vmaks değerleri sırasıyla 2.3 raM ve 2.8 Ünite olarak hesaplandı. Belirlenen depolimeraz aktivitesinin belirli konsantrasyonlardaki Na~, K“ ve Mg+2 iyonlan varlığında arttığı, yüksek konsantrasyonlarında ise azaldığı gözlenmiştir. Ca”2 durumunda ise aktivasyon, artan iyon konsantrasyonlannda bile belirli düzeylerde sabit kalabilmiştir Fenilmetilsülfonilflorür, ditiyotreitol, siyanür, sodyum azid, deoksikolik asit sodyum tuzu ve etilen diamin tetraasetikasit sodyum tuzu gibi kimyasalların test edilen izolatlarda mevcut olabilecek depolimeraz aktivitesi için inhibisyon davranışları incelendiğinde, elde edilen veriler diğer depolimerazlarda bildirildiği gibi benzer bir depolimerazın çalışılan izolatlarda bulunabileceği sonucunu ortaya koymaktadır. 16S rRNA genlerinin dizi analizlerinden PHA parçalama yetenekleri karakterize edilen bu izolatlann Pseudomonas türü olduktan belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

SUMMARY Investigation of biodegradibilities of some polyhydroxyalkanoates by Pseudomonas isolates In this study, polyhydroxyalkanoate biodegradation capabilities of some species isolated from soil and identified previously as Pseudomonas sp. in terms of some physiological and biochemical properties were investigated. Surface morphologies of solution-cast PHB films at the end of 24 h of incubation with the isolates were monitored by Scanning Electron Microscopy. Several irregular pits and erosion on film surfaces exposured to Pseudomonas isolates were observed. Both decrease in molecular weight determined by GPC and weight loss up to 30% have shown that the isolates are able to degrade the films. Degradation of polyhydroxyoctanoate, polyhydroxynonanoate or copolymer (PHB-co-HV) films poured on a solid medium was also observed by clear zone formation after incubation of isolates. The presence of some peptides with molecular weight of 50-60 kDa was electrophoreticly identified. This result is consistent with the earlier observations that a depolymerase with similar molecular weight is present in other Pseudomonas species. Characterization of depolymerase activity was assayed in the presence of /Miitrophenylbutyrate as a substrate and some kinetic data were compared with the reported values. From the data, Km and Vmax values in the presence of the substrate were calculated as 2.3 mM and 2.8 Units, respectively, for the enzyme responsible for this activity. It was also observed that depolymerase activities were stimulated by Na“\ K~ or Mg+2 at specific concentrations but decreased at their greater concentrations. On the contrary, the activation of enzyme in the presence of Ca”2 stay constant even in the presence its higher concentrations. The inhibition behaviour of some chemicals such as phenylmethylsulfonylfluoride, dithiothreitol, cyanide, sodium azide, deoxycholic acid sodium salt and ethylenediamine tetraacetic acid sodium salt on the observed depolymerase activity has evidenced the presence of an enzyme in the isolates similar to depolymerase reported earlier. Moreover, the isolates with PHA degradation properties were identified as Pseudomonas sp. from the 16S rRNA gene analyses.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    78094

    Fuel oil ile kirlenmiş topraklarından bazı Pseudomonas türlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu

    Isolation and characterisation of some pseudomonas species from soil contaminated with fuel oil

    İSMAİL DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ

  2. Tez No

    569776

    Ankara'da tüketime sunulan et ve süt ürünlerinden izole edilen Pseudomonas türlerinin bazı virulans özelliklerinin araştırılması

    The investigation of some virulence properties of Pseudomonas species isolated from meat and dairy products consumed in Ankara

    EZGİ NUR GELGÖR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESLİHAN GÜNDOĞAN BAKIRCI

  3. Tez No

    326189

    Non-fermentatif gram negatif bakterilerde metallo-beta-laktamaz varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of metallo-beta-lactamase presence by phenotypic and genotypic methods in nonfermentative gram negative bacteria

    FATMA TUĞBA DİNÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜHER GÖRAL

  4. Tez No

    880154

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen pseudomonas aeruginosa'nınkarbapenemaz üretimi ve tiplendirilmesinde fenotipik ve genotipik yöntemlerin değerlendirilmesi

    Evaluation of phenotypi̇c and genotypic methods for carbapenemaseproduction and typing in pseudomonas aeruginosa isolates from various clinical samples

    HATİCE KARALİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET BURAK AKSU

  5. Tez No

    311331

    Klinik pseudomonas aerugınosa izolatlarının antibiyotiklere duyarlılık durumu ve serotiplendirilmesi

    Antibiotic susceptibilities and serotyping of clinical pseudomonas aeruginosa isolates

    PINAR EKİNCİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DUYGU PERÇİN

Geri Dön