Cyanobacterium synechocystis PCC 6803'de orf genlerinin rolünün aydınlatılması
Clarifying the significance of orf genes in cyanobacterium synechocystis PCC 6803
- Tez No: 112707
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL TÜRKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: S.6803, orf 62, deletion-inactivation mutasyon, Cyanobacterium synechocystis, Genler, Mutasyon, Cyanobacterium synechocystis, Genes, Mutation
- Yıl: 2001
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET CYANOBACTERIUM SYNECHOCYSTIS PCC 6803'DE ORF GENLERİNİN ROLÜNÜN AYDINLATILMASI ULAŞ, Simin Doktora Tezi, Biyoteknoloji An ab ilim Dalı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. İsmail Türkan 18 Nisan 2001, 47 sayfa orf 62, 62 amino asit residüsünden oluşan bir hidrofobik proteini kodlamaktadır. Proteinin hidrofobisiti analizi bunun membrana bağlantılı iki bölgesi olduğunu ortaya çıkarmıştır. Synechocystis 6803'ün orf 62 gen ürününe homolog olan proteinler, bugüne kadar incelenmiş olan tüm fotosentetik organizmalarda bulunmuştur. Bilinen tüm orf 62 dizileri birbirlerine büyük oranda benzerlik göstermektedirler. Bu çalışmada amacımız yaygın olarak kullanılan model organizma Synechocystis 6803 de orf 62 geninin hücresel rolünü belirlemektir. Bu amaçla iki tip orf 62 mutantı (deletion, inactivation) yapılmıştır. Mutantlann ve wild type'm tilakoid polipeptidleri ve transkriptleri Western ve Northern blotting yöntemleri ile incelenmiştir. Sonuçlar mutantlarda fotosentetik polipeptidlerin ve tarnskriptlerin miktarının değişmediğini ortaya çıkarmıştır. Ancak solunumun ve oksijen evolüsyonunun mutantlarda wild type' a göre daha hızlı buna karşın büyüme hızının genellikle daha yavaş olduğu saptanmıştır. Bu durumda orf 52'nin fotosentez zincirinde elektron akışını kontrol eden düzenleyici bir gen olduğu söylenebilir.
Özet (Çeviri)
örf 62 encodes a hydrophobic protein with 62 amino acid residues. Hydrophobicity analysis of the protein points to two membrane-spanning regions. Proteins homologous to the örf 62 gene product of Synechocystis 6803 are found e.g. in the plastid genomes of ali organisms examined so far. Ali known örf 62 sequences show high degree of similarity to each other. in this study our aim is to reveal the cellular role of örf 62 in the widely used model organism Synechocystis PCC 6803. For this purpose, a deletion mutant as well as an inactivation mutant of örf 62 were constructed.The polypeptide content of the thylakoid membranes and the transcripts of some photosynthetic genes of the mutants compared to wild type were analyzed by Western and Northern blotting. The results showed that amounts of the photosynthetic polypeptides and transcripts are unaltered in mutants. The respiration and the oxygen evolution rates was higher in mutants where the growth rate was generally lower than in wild type. According to these results it can be concluded that, örf 62 might be a regulatory gene which controls electron flow in photosynthetic chain.
Benzer Tezler
- The Effect of selected pesticides on the gravth and nitrogen fixation in cynobacteria
Başlık çevirisi yok
SİMA GÜNER SIVACI
- Regulation of CO2 fixation by phosphate pulser as the adaptation of blu green algae Anacystis Nidulas to environmental phosphate fluchations
Mavi yeşil alglerden Anacystis Nidulas'ın çevresel fosfat değişimine adaptasyonu olarak CO2 fiksasyonun fosfat pulslarıtla ayarlanması
EMEL ŞAHAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1997
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
SARGUN A. TANT
- Contemporary limnology of Çubuk II Dam Lake
Çubuk II Baraj Gölü'nün güncel limnolojisi
MURAT KILLI
Yüksek Lisans
İngilizce
1999
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERYEM BEKLİOĞLU
- Temporal variability in synechococcus spp, abundances in the northern levantine basin as inferred from weekly time series observations in 1998
Kuzey levantin basen'indeki synechococcus spp, bolluğundaki zamana karşın değişimlerin 1998 yılı boyunca haftalık olarak gözlenmesi
HATİCE İREM KÖKSALAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2000
Su ÜrünleriOrta Doğu Teknik ÜniversitesiDeniz Biyolojisi ve Balıkçılık Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZAHİT UYSAL
- Bazı cyanobacteria'nın PHB (poly-beta-hydroxybutyrate) üretimi ve antimikrobiyal aktivitelerinin incelenmesi
Studies on PHB (poly-beta-hydroxybutyrate) production and antimicrobial activities of some cyanobacteria
MUHAMMED AKBAR YOLDAŞ