Cyanobacterium synechocystis PCC 6803'de orf genlerinin rolünün aydınlatılması
Clarifying the significance of orf genes in cyanobacterium synechocystis PCC 6803
- Tez No: 112707
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL TÜRKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: S.6803, orf 62, deletion-inactivation mutasyon
- Yıl: 2001
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 57
Özet
ÖZET CYANOBACTERIUM SYNECHOCYSTIS PCC 6803'DE ORF GENLERİNİN ROLÜNÜN AYDINLATILMASI ULAŞ, Simin Doktora Tezi, Biyoteknoloji An ab ilim Dalı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. İsmail Türkan 18 Nisan 2001, 47 sayfa orf 62, 62 amino asit residüsünden oluşan bir hidrofobik proteini kodlamaktadır. Proteinin hidrofobisiti analizi bunun membrana bağlantılı iki bölgesi olduğunu ortaya çıkarmıştır. Synechocystis 6803'ün orf 62 gen ürününe homolog olan proteinler, bugüne kadar incelenmiş olan tüm fotosentetik organizmalarda bulunmuştur. Bilinen tüm orf 62 dizileri birbirlerine büyük oranda benzerlik göstermektedirler. Bu çalışmada amacımız yaygın olarak kullanılan model organizma Synechocystis 6803 de orf 62 geninin hücresel rolünü belirlemektir. Bu amaçla iki tip orf 62 mutantı (deletion, inactivation) yapılmıştır. Mutantlann ve wild type'm tilakoid polipeptidleri ve transkriptleri Western ve Northern blotting yöntemleri ile incelenmiştir. Sonuçlar mutantlarda fotosentetik polipeptidlerin ve tarnskriptlerin miktarının değişmediğini ortaya çıkarmıştır. Ancak solunumun ve oksijen evolüsyonunun mutantlarda wild type' a göre daha hızlı buna karşın büyüme hızının genellikle daha yavaş olduğu saptanmıştır. Bu durumda orf 52'nin fotosentez zincirinde elektron akışını kontrol eden düzenleyici bir gen olduğu söylenebilir.
Özet (Çeviri)
örf 62 encodes a hydrophobic protein with 62 amino acid residues. Hydrophobicity analysis of the protein points to two membrane-spanning regions. Proteins homologous to the örf 62 gene product of Synechocystis 6803 are found e.g. in the plastid genomes of ali organisms examined so far. Ali known örf 62 sequences show high degree of similarity to each other. in this study our aim is to reveal the cellular role of örf 62 in the widely used model organism Synechocystis PCC 6803. For this purpose, a deletion mutant as well as an inactivation mutant of örf 62 were constructed.The polypeptide content of the thylakoid membranes and the transcripts of some photosynthetic genes of the mutants compared to wild type were analyzed by Western and Northern blotting. The results showed that amounts of the photosynthetic polypeptides and transcripts are unaltered in mutants. The respiration and the oxygen evolution rates was higher in mutants where the growth rate was generally lower than in wild type. According to these results it can be concluded that, örf 62 might be a regulatory gene which controls electron flow in photosynthetic chain.
Benzer Tezler
- Exploration of photoautotrophic hydrogen production in Synechocystis sp. ATCC 27184
Başlık çevirisi yok
ARCA YILMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyoteknolojiBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BERAT ZEKİ HAZNEDAROĞLU
- Synechocystis sp. PCC6803 hücrelerinde opcA- mutasyonunun glukoz-6-fosfat dehidrogenaz aktivitesi üzerine etkileri
Effects of the opcA- mutation on the glucose-6-phosphate dehydrogenase activity in Synechocystis sp. PCC6803 cells
NESLİHAN AKSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAYDAR KARAKAYA
- Microalgal growth in anaerobic digestate
Anaerobik çıkış atıksuyunda mikroyosunun çoğaltılması
MEHMET SADIK AKCA
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MAHMUT ALTINBAŞ
- Fosfinotrisin N-asetiltransferaz (PAT) enzimini kodlayan siyanobakteriyel genlerin klonlanması, ekspresyonu ve enzim aktivitelerinin analizi
Cloning and expression of cyanobacterial genes that encode phosphinothricin N-acetyltransferase (PAT) enzyme
EBRU YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLIHAN KURT KIZILDOĞAN
- Synechocystıs sp. pcc 6803 zwf geninin sistein kodonlarının mutasyonu ve mutasyonların glukoz-6-fosfat dehidrogenaz (G6pdh) aktivitesine etkisi
Mutagenesis of the cysteine codons in the zwf gene of synechocystis sp. pcc 6803 and effect of the mutations onto glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6pdh) activity
KÜBRA ÖZKUL
Doktora
Türkçe
2014
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HAYDAR KARAKAYA