Alpha-galactosidase gene cloning from aspergillus fumigatus
Aspergillus fumigatus'tan alfa-galaktosidaz geni klonlaması
- Tez No: 119105
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖGEL, DOÇ. DR. UFUK BAKIR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: a-galaktosidaz, klonlama, Aspergillus fumigatus iv, a-galactosidase, cloning, Aspergillus fumigatus 111
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
oz ASPERGILLUS FUMTGATUSTAN ALFA-GALAKTOSIDAZ GENI KLONLANMASI Yalçındağ, Banu Yüksek Lisans, Gıda Mühendisliği Bölümü Tez Danışmanı: Doç. Dr. Zümrüt Begüm Ögel Yardımcı Tez Danışmam: Doç. Dr. Ufuk Bakır Ocak 2002, 88 sayfa Bu çalışmada Aspergillus fumigatus IMI 385708 a-galaktosidaz geni üzerinde moleküler klonlama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Enzimin amino asit dizilimi ve Aspergillus ve Penicillium suşları a-galaktosidazları arasında korunmuş dizilimler kullanılarak dejenere primerler tasarlanmıştır. Bu primerler polimeraz zincir tepkimesinde kullanılarak alfa-galaktosidaz gen fragmanları çoğaltılmıştır. Elde edilen 900 baz çiftlik bir PCR ürünü ilerki çalışmalarda kullanılmak üzere sonda olarak seçilmiştir. RNA nokta blot analizi, en yüksek a-galaktosidaz mRNA ifadesinin keçi boynuzu sakızı üzerindeki beşinci büyüme gününde gerçekleştiğini göstermiştir. Bu bilgi cDNA sentezinde kullanılmıştır. Birincil cDNA kütüphanesinin hazırlanması için, sentezlenen cDNA, Lambda ZAP Express® vektörüne bağlanmıştır. Birincil kütüphane çoğaltıldıktan sonra tarama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Birincil ve ikincil tarama sonrasında, ilerki karakterizasyon çalışmalarında kullanılmak üzere olası pozitif plaklar elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT ALPHA-GALACTOSIDASE GENE CLONING FROM ASPERGILLUS FÜMTGA TUS Yalçındağ, Banu M.S., Department of Food Engineering Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Zümrüt Begüm Ögel Co-Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Ufuk Baku- January 2002, 88 pages In this study, molecular cloning studies were performed on the o> galactosidase gene of Aspergillus fumigatus IMI 385708. Degenerate primers were designed based on amino acid sequence of the enzyme and conserved sequences among a-galactosidases of Aspergillus and Penicillium species. These primers were used in PCR to amplify alpha-galactosidase gene fragments. A 900 bp PCR product was selected as a probe for further studies. RNA dot blot analysis showed that the highest expression of a-galactosidase mRNA was on the fifth day of growth on locust bean gum. This information was employed in cDNA synthesis. The synthesized cDNA was ligated onto Lambda ZAP Express® vector to construct the primary cDNA library. After amplification of the primary library, screening studies were performed. At the end of primary and secondary screening, a number of putative positive plaques were obtained for further characterization studies.
Benzer Tezler
- Cloning and characterization of industrially important alpha-galactosidase genes from the human pathogen aspergillus fumigatus
Alfa-galatosidaz genlerinin insan patojeni aspergillus fumigatusdan klonlaması ve karakterizasyonu
BETÜL SÖYLER
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK BAKIR
- Heterologous expression, characterization, and optimization of production of alpha-galactosidase from aspergillus fumigatus in aspergillus sojae
Aspergillus fumigatus alfa-galaktosidazinin aspergillus sojaede heterolog üretimi, karakterizasyonu ve üretiminin optimizasyonu
SÜMEYRA GÜRKÖK
Doktora
İngilizce
2012
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖGEL
PROF. DR. UFUK BÖLÜKBAŞI
- İdiyopatik proteinürisi olan çocuk hastalarda alfa-galaktosidaz a eksikliğinin (fabry hastalığının) taranması
Screening alpha-galactosidase A deficiency(fabry disease) in children who have idiopathicproteinuria
MELTEM AKGÜL ERDAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLYAS OKUR
- Alfa-galaktozidaz a eksikliği tanı ve takibinde kullanılmak üzere lizo-globotriozilseramid (LYSO-GB3) düzeyi ölçümü için likit kromatografisi -ardışık kütle spektrometrisi (LC-MS/MS) metodu geliştirilmesi ve validasyonu
Development and validation of liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method for measurement of LYSO-globotriaosylceramide (LYSO-GB3) level for use in diagnosis and follow-up of ALPHA-galactosidase a deficiency
ELİF ERKAN KURDOĞLU
- 50 yaş altı genç iskemik inmeli hastalarda fabry hastalık sıklığının araştırılması
Başlık çevirisi yok
NESRİN ATİŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
NörolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiNöroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYLİN ÖCAL YAMAN