Dekarboksilaz aktivitesine sahip poliklonal antikor elde edilmesi
Production of polyclonal catalytic antibodies displaying decarboxylase activity
- Tez No: 126509
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE OGAN, YRD. DOÇ. DR. MÜŞERREF ÖZEREN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2002
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
ÖZET DEKARBOKSİLAZ AKTİVİTESİNE SAHİP POLİKLONAL ANTİKOR ELDE EDİLMESİ Bu çalışmada tavşanlarda dekarboksilaz aktivitesine sahip poliklonal katalitik antikorlar, abzimler, N-(3-Karboksipropil)-4-Siklopentilmetilpiridin haptenine karşı üretilmiştir. Seçilen hapten, N-(3-Karboksipropil)-4-Siklopentilmetilpiridin yeni bir yöntemle sentezlenerek, taşıyıcı protein olarak tiroglobulin'e konjuge edilmiştir. Hazırlanan hapten-protein konjugatı kullamlarak, iki adet yetişkin albino cinsi erkek tavşan immunize edilmiştir. Bu hayvanlardan alman serumdan Protein G-Agaroz kolon kromatografisi metodu ile IgG'ler saf olarak Tavşan 1 ve Tavşan 2 için sırasıyla % 7.19 ve % 7.87 verimle elde edilmiştir. Yapılan Davis-PAGE analizinde gözlenen tek bant; SDS-PAGE ve Western Blot analizlerinde gözlenen iki bant, IgG'lerin saflığım kalitatif olarak doğrulamıştır. Ayrıca IgG'lerin oluşumu immünodifuzyon ve immünoelektroforez metodlan ile takip edilmiş ve gözlenen tek bir presipitin çizgisi, spesifik saf bir poliklonal karışım oluştuğunu kanıtlamıştır. Hazırlanan abzimlerin haptene spesifikliğinin kantitatif tayini direkt ELISA metodu ile yapılmış ve Kd değerleri sırasıyla Tavşan 1 ve Tavşan 2 için 7.8x1 0“8 M ve 8.2xl0”8 M bulunmuştur. Abzimin, DOPA'dan dopamin oluşum reaksiyonu katalizinin, kinetik analiz sonuçları Tavşan 1 için Km=3.85x10“4 mM, kkat=0,293 s”1, ve Tavşan 2 için Km=3.74 x 10“4 mM, kkat=0.295 s”1 olarak hesaplanmıştır. Hesaplanan kkat/kunkat değerleri sırasıyla Tavşan l'de 1.64 ve Tavşan 2'de 1.63 olarak bulunmuştur. Reaksiyon hızı düşük olmasına rağmen abzimin DOPA'dan dopamin oluşum reaksiyonunu katalizlediği gösterilmiştir. Düşük reaksiyon hızı beklenen bir sonuçtur zira literatürde şimdiye kadar abzim aktivitelerinin nadiren enzim aktivitelerine yaklaşabildikleri kaydedilmiştir. Ekim, 2002 Özlem GENCER ÖNDER vı
Özet (Çeviri)
ABSTRACT PRODUCTION OF POLYCLONAL CATALYTIC ANTIBODIES DISPLAYING DECARBOXLASE ACTIVITY In this study, polyclonal catalytic antibodies, abzymes, displaying decarboxylase activity were raised against N-(3-Carboxypropyl)-4- Cyclopentylmethylpyridine hapten in rabbits. Selected hapten, N-(3-Carboxypropyl)- 4-Cyclopentylmethylpyridine, synthesized by a new method, was conjugated to tyroglobulin. Two mature albino rabbits were immunized against this hapten-protein conjugate. The purification of the serums of the rabbits 1 and 2 by protein G-agarose column chromatography yielded 7.19 % and 7.87 % immunoglobulin G (IgG), respectively. The single band in Davis-PAGE analysis and two bands in SDS-PAGE and Western Blot analyses qualitatively confirmed the purity of the IgGs. Furthermore; the production of the IgGs were followed-up by immunodiffusion and immunoelectrophoretic methods. The single precipitation band proved the purity of a single specific polyclonal mixture produced. The specificity of the prepared abzymes were quantitatively assayed by direct ELISA method and K0 values of 7.8xl0“8 M and 8.2xl0”8 M were determined for the Rabbits 1 and 2, respectively. From the kinetic analysis data of the catalysis of the reaction of dopamine formation from DOPA by the abzyme, the values of KM=3.85xlO“4 mM, kcat=0,293 s”1 and Km=3.74 x lO-4 mM, kcat=0.295 s'1 were calculated for Rabbits 1 and 2, respectively. The respective kcat/kuncat values of 164 and 163 were calculated for Rabbits 1 and 2. Although the reaction rate displayed by the abzyme is low, it catalyzes the reaction of dopamine formation from DOPA. The low reaction rate was an expected result since to date, in literature the reaction rates of the abzymes seldom are comparable to the enzymes. October, 2002 Özlem GENCER ÖNDER vii
Benzer Tezler
- Geleneksel olarak üretilen şalgam suyundan laktik asit bakterilerinin izolasyonu, tanımlanması ve fenolik asit dekarboksilaz enzim üreten suşların seçimi
Identification of lactic acid bacteria isolated from traditionally produced şalgam juice and the selection of the strains producing the phenolic acid decarboxylase enzymes
GÖZDE OKCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KAMURAN AYHAN
- Tulum peynirinden izole ve identifiye edilen bazı laktik asit bakteri suşlarının starter kültür özellikleri ve peynirlerin bazı özelliklerinin tespiti
The Determination of starter culture properties of some isolated and identified lactic acid bacteria strains from tulum cheese and some properties of the cheeses
MUSTAFA ŞENGÜL
Doktora
Türkçe
2001
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. SONGÜL ÇAKMAKÇI
- Gıda kaynaklı laktik asit bakterilerinin bazı güvenilirlik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of some safety characteristics of foodborne lactic acid bacteria
EBRU DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLDEN BAŞYİĞİT KILIÇ
- Bozada laktik asit bakterisi ve maya starter kültürü kullanımının mineral, biyoaktif madde ve protein biyoerişilebilirliğine etkisi
Effect of using lactic acid bacteria and yeast starter culture on mineral, bioactive substance and protein bioaccessibility of boza
MERVE USAL
Doktora
Türkçe
2024
Gıda MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH TÖRNÜK
- Molecular evolution and population genetics of acid resistant pathway glutamate decarboxylase in lactic acid bacteria
Laktik asit bakterilerinde aside dirençli yol glutamat dekarboksilazın moleküler evrimi ve populasyon genetiği
BURCU TEKİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EFE SEZGİN