Değişik kaynaklardan izole edilen mycobacterium bovis suşlarının moleküler tiplendirilmesi
Molecular typing of mycobacterium bovis strains isolated from varied origins
- Tez No: 131822
- Danışmanlar: PROF. DR. HAKAN YARDIMCI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Mycobacterium bovis, Moleküler Tiplendirme, PCR, Molecular typing, Mycobacterium bovis, PCR
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
56 ÖZET Değişik Kaynaklardan İzole Edilen Mycobacterium bovis Suşlarmm Moleküler Tiplendirilmesi Bu çalışmanın amacı değişik kaynaklardan izole edilen Mycobacterium bovis suşlarmm genotiplendirilmesinde PCR tabanlı iki moleküler yöntemin rutin kullanıma uygun olup olmadığının araştırılmasıdır. Mycobacterium bovis'in sebep olduğu“sığır tüberkülozu”uygulanmakta olan kontrol programlarına rağmen bir çok ülkede sığırlarda hastalık etkeni olarak önemini korumaktadır. Tüberkülozun moleküler tiplendirme teknikleri hastalığın kontrol ve korunmasında etkili yardımcı bir araç olarak umut verici görülmektedir. Çalışmada iki farklı PCR tabanlı tiplendirme yöntemi kullanılmıştır. Yöntemlerden biri IS6110 elementine yönelik spesifik ters yön tek primerin (OUT-primer) kullanıldığı OUT-PCR, diğeri ise Gram negatif bakterilerin genomunda bulunduğu saptanan bölgeye özel ERIC (enterobacterial repetitive intergenic concensus) primerlerinin seçildiği ERIC-PCR olarak uygulanmıştır. ERIC dizileri M. bovis genomunda da saptanmıştır. Her iki tiplendirme RAPD (random amplified polymorphic DNA) yöntemi olarak bilinmektedir. Bu çalışmada Ankara çevresi ve bazı diğer yerlerden toplanmış 21 M. bovis susu tiplendirilmiştir. Suşlardan 16'sı sığırlardan 5 'i ise insanlardan izole edilmiştir. ERIC-PCR yönteminin standardizasyonu zor ve yeterli ayrım yapamadığı saptanmıştır. OUT-PCR yönteminin ise kolay uygulanabildiği ve az sayıdaki laboratuvar susunun ayrımı amacıyla yararlı olduğu saptanmıştır. Ayrıca yöntemin fazla sayıdaki susun hızlı tarama amacıyla kullanılabileceği bulunmuştur. Ancak her iki tiplendirme yönteminin de geniş çaplı epidemiyolojik analiz çalışmalarında kullanılması uygun değildir.
Özet (Çeviri)
57 SUMMARY Molecular Typing of Mycobacterium bovis Strains Isolated From Varied Origins The aim of this study was to investigate whether or not useful for the rutin use of two PCR based molecular methods for genotyping of Mycobacterium bovis strains isolated different clinical sources. Bovin tuberculosis caused by M. bovis remains a significant disease of farmed cattle in many countries despite ongoing control programs. Molecular typing techniques of tuberculosis offers promise as a powerful aid in the prevention and control of disease. In this study the role of two rapid PCR- based typing methods was evaluated by performing with one spesific for amlifying IS6110 in the outward direction primer (OUT-primer) and two ERIC (enterobacterial repetitive intergenic concensus) primers. ERIC sequenses have been found in the transcribed regions of the cromosomes of Gram-negative bacteria and it was demostrated in the genom of M. bovis. Both typing methods are RAPD (random amplified polymorphic DNA) techniques. This study comprised 21 M. bovis strains collected from Ankara region and some others cities. Of 16 strains were isolated from cattle and others was human strains. Standardization of ERIC-PCR was difficult and was found not usefull for determining genetic diversity. OUT-PCR was found rapid, easy and useful for typing of M. bovis in order to invastigate rapid differantiations small number of laboratory strains. This method also would be useful for rapid screening large number of strains. However both of them were found that couldn't be applied to study of the wide range epidemiological analysis.
Benzer Tezler
- Isolation of novel Quorum quenching bacteria for the control of membrane biofouling and the effect of Bacillus sp. T5 and Delftia sp. T6 on microbial community structure in membrane bioreactor
Membran biyotıkanmasının kontrolü amacıyla yeni Quorum quenching bakterilerinin izolasyonu ve Bacillus sp.T5/Delftia sp. T6 türlerinin membran biyoreaktördeki mikrobiyal komüniteye etkisinin belirlenmesi
BAHAR YAVUZTÜRK GÜL
Doktora
İngilizce
2018
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL KOYUNCU
- Değişik kaynaklardan izole edilen pseudomonas aeruginosa suşlarının virulans faktörleri, biyofilm formasyonu ve quorum sensing yönünden değerlendirilmesi
Analysis of pseudomonas aeruginosa strains from different sources for virulance factors, biofilm formation and quorum sensing
DENİZ DÜZGÜN
Doktora
Türkçe
2009
MikrobiyolojiUludağ ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SUNA GEDİKOĞLU
- Değişik kaynaklardan izole edilen stafilokok suşlarının biyotiplendirilmesi ve metisilin direncinin araştırılması
Biotyping of staphylococcus strains isolated from various sources and investigations on the methicillin resistance
SELDA UYSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ŞÜKRÜ KIRKAN
- Değişik kaynaklardan izole edilen pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının tespiti ve biofilm oluşumunun araştırılması
The detection of antibiotic susceptibility of pseudomonas aeruginosa strains and investigation of biofilm formation
BİRGÜL ÜNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. OSMAN KAYA
- İzmir yöresinde değişik kaynaklardan izole edilen patojen staphylococcus'ların değişik kemoterapötik ajanlara karşı duyarlılık durumları
The sensivity of pathogenic staphylococci isolated from various specimens against methicillin and other chemomens against methicillin and other chemotherapeutic agents in İzmir
ÖZLEM YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
MikrobiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MELAHAT OKUYAN