Candida albicans (Robin) Berkhout'un species-specific PCR ile DNA düzeyinde tanısının standardizasyonu
Standardization of identification of Candida albicans (Robin) Berkhout based on DNA by species-specific PCR
- Tez No: 134607
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ALEV HALİKİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: C.albicans, DNA, Standardizasyon, Species-Specific PCR, Candida albicans, DNA, Standardization, Species-Specific PCR
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Bu çalışmada C. albicans 'in Species-Specific PCR ile tanısının yapılması amaçlanmıştır. Bu amaç ile 5 C.albicans referans straini, 9 farklı Candida türü (referans strainler ve klinik izolatlar), Cyrptococcus neoformans, 4 filamentöz fungus (referans strainler ve klinik izolatlar), 3 bakteri referans straininden DNA izolasyonu yapılmıştır. İnsan DNA 'sı hazır olarak elde edilmiştir.Ca/fo'cörcs,'ın büyük alt birim rDNA gen bölgesinde yer alan D1/D2 bölgesine spesifik primer seti (CAL5,NL4CAL,NL5CAL) kullanılmış ve Species-Specific PCR'ın standardizasyonu yapılmıştır. Bu amaç ile farklı MgCİ2 konsantrasyonları, agaroz konsantrasyonları, farklı PCR döngü profilleri, farklı DNA konsantrasyonlarının PCR'a etkisi denenmiştir. Bu primerlerin 19 pg kromozomal DNA' yi saptadığı bulunmuştur. Bu PCR 'da bu primerler sadece C.albicans kromosomal DNA'sı mevcut iken 175 bç'lik (baz çifti)'lik ürün oluşturmuştur ve fenotipik olarak C.dubliniensis ve C.tropicalis olarak tanılanmış iki klinik izolat hariç diğer DNA 'lar mevcut olduğunda hiçbir ürün oluşmamıştır. C.albicans DNA' sim içeren ve 2 farklı Candida (CDU2,NL4CAL ve CW02,L4LEL) türüne ait primerler ile bir seri PCR gerçekleştirilmiş ve hiçbir çoğaltım gözlenmemiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, we aimed identification of C.albicans by Species- Specific PCR chromosomal DNA of 5 reference strains of Candida albicans, 9 different Candida species (clinical isolates and reference strains), Cyrptococcus neoformans (clinical isolate), 4 micelial fungi (clinical isolate and reference strains), 3 reference strains of bacteria was extracted and purified. And human DNA was available. We used primer set (CAL5,NL4CAL,NL5CAL) for the D1/D2 region in the large-subunit rDNA gene of C.albicans and standardization of Species- Specific PCR. For this aim different MgC^and agarose concentration, different profile of PCR cycle was tested. The detection limit of these primers was found 19 pg chromosomal DNA. In this PCR, these primers yielded DNA fragments of 175 bp (base pair) when the C.albicans DNA was present and didn't yield any product with the any other DNA except C.dubliniensis (clinical isolate) and C.tropicalis (clinical isolate) which were identified phenotypically. Furthermore, series PCRs with two different primer pairs are specific two different Candida species (CDU2,NL4CAL and CW02,L4LEL) contained chromosomal DNA of C.albicans not yield any product.
Benzer Tezler
- Antifungal effect of green tea and curcumin against oral Candida albicans
Başlık çevirisi yok
BILAL HUSSAIN MOTLAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyomühendislikAltınbaş ÜniversitesiBiyomedikal Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUĞÇE NAİME GEDİK KAPANCIK
- Candida ve Aspergillus enfeksiyonlarının real time PCR yöntemi ile hızlı tanısının kültür yöntemi ile karşılaştırılması ve antifungal direncin kolorimetrik yöntemle tayini
Real time PCR for rapid diagnosis of Candida and Aspergillus infections with comparison of culture method and determination of antifungal resistance colorimetric method
İSKENDER KARALTI
- Klinik candida albicans izolatlarının virulans faktörleri ve antifungal duyarlılıkları
Virulance factors and antifungal susceptibility of clinical candida albicans isolates
EZGİ DOĞDUAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERKAN RAYAMAN
- Detection of candida albicans pathogen by electrochemical methods with metal nanoparticle modified molecular imprinted polymer
Candida albicans patojeninin metal nanopartikül modifiye moleküler baskılı polimer ile elektrokimyasal yöntemlerle tespiti
HASAN İŞBİLİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Bilim ve Teknolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiNanobilim ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDA NUR TOPKAYA ÇETİN
- Candida albicans genetiği ile ilgili olarak DNA izolasyonu, DNA transformasyonu ve beyaz-opak koloni değişimi
DNA isolation, DNA transformation and white-opaque colony transition related to candida albicans genetics
SEVİM GÖNEN (ARSLAN)