Candida albicans (Robin) Berkhout'un species-specific PCR ile DNA düzeyinde tanısının standardizasyonu
Standardization of identification of Candida albicans (Robin) Berkhout based on DNA by species-specific PCR
- Tez No: 134607
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ALEV HALİKİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: C.albicans, DNA, Standardizasyon, Species-Specific PCR, Candida albicans, DNA, Standardization, Species-Specific PCR
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Bu çalışmada C. albicans 'in Species-Specific PCR ile tanısının yapılması amaçlanmıştır. Bu amaç ile 5 C.albicans referans straini, 9 farklı Candida türü (referans strainler ve klinik izolatlar), Cyrptococcus neoformans, 4 filamentöz fungus (referans strainler ve klinik izolatlar), 3 bakteri referans straininden DNA izolasyonu yapılmıştır. İnsan DNA 'sı hazır olarak elde edilmiştir.Ca/fo'cörcs,'ın büyük alt birim rDNA gen bölgesinde yer alan D1/D2 bölgesine spesifik primer seti (CAL5,NL4CAL,NL5CAL) kullanılmış ve Species-Specific PCR'ın standardizasyonu yapılmıştır. Bu amaç ile farklı MgCİ2 konsantrasyonları, agaroz konsantrasyonları, farklı PCR döngü profilleri, farklı DNA konsantrasyonlarının PCR'a etkisi denenmiştir. Bu primerlerin 19 pg kromozomal DNA' yi saptadığı bulunmuştur. Bu PCR 'da bu primerler sadece C.albicans kromosomal DNA'sı mevcut iken 175 bç'lik (baz çifti)'lik ürün oluşturmuştur ve fenotipik olarak C.dubliniensis ve C.tropicalis olarak tanılanmış iki klinik izolat hariç diğer DNA 'lar mevcut olduğunda hiçbir ürün oluşmamıştır. C.albicans DNA' sim içeren ve 2 farklı Candida (CDU2,NL4CAL ve CW02,L4LEL) türüne ait primerler ile bir seri PCR gerçekleştirilmiş ve hiçbir çoğaltım gözlenmemiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, we aimed identification of C.albicans by Species- Specific PCR chromosomal DNA of 5 reference strains of Candida albicans, 9 different Candida species (clinical isolates and reference strains), Cyrptococcus neoformans (clinical isolate), 4 micelial fungi (clinical isolate and reference strains), 3 reference strains of bacteria was extracted and purified. And human DNA was available. We used primer set (CAL5,NL4CAL,NL5CAL) for the D1/D2 region in the large-subunit rDNA gene of C.albicans and standardization of Species- Specific PCR. For this aim different MgC^and agarose concentration, different profile of PCR cycle was tested. The detection limit of these primers was found 19 pg chromosomal DNA. In this PCR, these primers yielded DNA fragments of 175 bp (base pair) when the C.albicans DNA was present and didn't yield any product with the any other DNA except C.dubliniensis (clinical isolate) and C.tropicalis (clinical isolate) which were identified phenotypically. Furthermore, series PCRs with two different primer pairs are specific two different Candida species (CDU2,NL4CAL and CW02,L4LEL) contained chromosomal DNA of C.albicans not yield any product.
Benzer Tezler
- Antifungal effect of green tea and curcumin against oral Candida albicans
Başlık çevirisi yok
BILAL HUSSAIN MOTLAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyomühendislikAltınbaş ÜniversitesiBiyomedikal Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUĞÇE NAİME GEDİK KAPANCIK
- Candida ve Aspergillus enfeksiyonlarının real time PCR yöntemi ile hızlı tanısının kültür yöntemi ile karşılaştırılması ve antifungal direncin kolorimetrik yöntemle tayini
Real time PCR for rapid diagnosis of Candida and Aspergillus infections with comparison of culture method and determination of antifungal resistance colorimetric method
İSKENDER KARALTI
- Candida albicans suşlarının proteinaz enzim aktivitelerinin araştırılması ve çeşitli olgu gruplarında proteinaz enzimine karşı serumda antikor aranması
Proteinase enzyme activity detection in candida albicans strains and investigation of antiproteinase antibody in sera of various case groups
SEVİM AKÇAĞLAR
- Candida Albicans'ın fare modelinde kan ve çeşitli organlarda PCR (polymerase chain reaction) ile gösterilmesi
The Determination of candida albicans in the whole blood and various organs of mause model by PCR (polymerase chain reaction)
HALİL MANSUROĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA KUŞTİMUR
- Candida albicans ile ağız florasında bulunan bazı fakültatif anaerop bakterilerin ilişkilerinin in vitro deneylerle araştırılması
In vitro research of interactions between candida albicans and some facultative anaerobic bacteria of the mouth flora
EMİNE HOŞAF
Yüksek Lisans
Türkçe
1998
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU