Metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarında mecA geninin PCR (polimeraz zincir reaksiyonu) metodu ile saptanması
Detection of mecA gene of methicillin resistant Staphylococcus aureus strains by PCR (polymerase chain reaction) method
- Tez No: 135824
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. GÜLGÜN TINAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Staphylococcus aureus, Metisilin direnci, mecA geni, PCR, Staphylococus aureus, Meticillin resistance, mecA gene, PCR
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
IV ÖZET Bu çalışmada, çeşitli hastanelerden temin edilen 133 adet metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarında mecA geninin varlığı, Polimeraz Chain Reaction (PCR) metodu ile araştırılmıştır. Çalışmada öncelikle çeşitli hastanelerden temin edilen suşlar, muhafaza ve rutin kullanım için uygun besi yeri ortamlarına ekim yapılarak çalışmaya alınmıştır. Bu suşlara, klasik fenotipik tiplendirme metotlarından okzasilin antibiyotiğine karşı disk difüzyon metodu ve Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu (MİK) Epsilometre testi (E testi) uygulanmış ve okzasiline karşı hassasiyet testleri gerçekleştirilmiştir. Daha sonra her suş için, koloni PCR metodu kullanılarak mecA geninin varlığı araştırılmıştır. PCR sonucunda oluşması beklenen 533 bp büyüklüğündeki mecA geni, %1 agaroz jelde incelenmiştir. Koloni PCR sonucunda 127 suş için rnecA pozitif ve 6 suş için de mecA negatif olarak tespit edilmiştir. Ayrıca fenotipik testler sonucunda, 14 suş okzasiline hassas olarak tespit edilmesine rağmen, bu suşlar için PCR sonucunda mecA pozitif olarak tespit edilmiştir. Bu sonuç da S. aureus'un antibiyotik direncinin PCR ile daha hassas olarak tespit edildiğini ortaya koyar. Moleküler teknikler, özellikle PCR metodu stafilokokların metisilin direnç tipinin hızlı, spesifik ve doğru tespiti için gereklidir. Ve mecA geninin moleküler metotlarla tespiti metisilin direncini doğrulamak için referans metottur. Klasik metotlar az güvenilirdir ve en azından 24 saat gerektirir. Ayrıca klasik metotlar, büyük oranda büyüme ortamı şartlarına bağlıdır ve bu yüzden yeterli ayırımı sağlayamazlar. PCR S. aureus" un antibiyotik direnç genlerinin hassas ve spesifik tespitini sağlar.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT In this study, the 133 methicillin resistant strains of Staphylococcus aureus (S. aureus) obtained from various hospitals were tested for presence of the mecA gene using Polymerase Chain Reaction (PCR) method. First, these strains were streak on to appropriate medium for routine use and long term storage. The strains were then analysed using conventional phenotypic methods such as disk diffusion method, minimum inhibition concentration (mic) epsilometer test (E test). After these phenotypic tests, detection of the mecA gene for each strain carried out using colony PCR method. The PCR products were then analysed for the 533 bp mecA gene product in a %1 agarose gel. The analyses of the PCR products showed that from the 133 strain tested, 127 were the mecA positive, 6 were the mecA negative 14 strains were both oxacillin susceptible and mecA positive. The latter indicates that PCR is more sensitive method for determination of S.aureus antibiotic resistance. Molecular techniques, especially PCR method, are necessary for fast, specific and accurate detection of Staphylococcus meticillin resistance pattern. The confirmation of presence of the mecA gene by molecular methods is a reference method. The conventional phenotypic methods are less accurate and take at least 24 hours. In addition, the conventional methods are easily affected by environmental conditions such as temperature and medium osmolality. Therefore, the PCR method represents a sensitive, specific and powerful method for detection of S. aureus antibiotic resistance.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının metisilin dirençlilik genlerinin belirlenmesi
Determination of methicillin resistance genes of Staphylococcus aureus strains isolated from clinical specimens
ELİF BAYTAROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyoteknolojiGazi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEHRA NUR YÜKSEKDAĞ
- Klinik örneklerden izole edilen MRSA suşlarında Panton-Valentine Lökosidin virülans faktörünün moleküler yöntemlerle belirlenmesi
The detection of panton-valentine leukocidine virulans factor in MRSA strains isolated from clinical specimens by molecular methods
MÜGE ŞİMŞEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURAN DELİALİOĞLU
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen S.aureus suşlarında Panton-Valentin lökosidin toksininin polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılması
Investigation of Panton- Valentin leukocidin toxin by using polymerase chain reaction in staphylococcus aureus strains wich are isolated from various clinical samples
ÖZGÜR YİĞİT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELEK DEMİR
- Cumhuriyet Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Uygulama ve Araştırma Hastanesi sağlık çalışanlarında S. aureus ve MRSA taşıyıcılığının saptanması ve MRSA tanı yöntemlerinin karşılaştırılması
Determination of MRSA and S.aureus carriage amoung health care personnel of Cumhuriyet University Health Service Practice and Research Hospital and comparision of MRSA diagnosis methods
SERPİL KOŞUM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP SÜMER
- Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) suşlarında MecA geninin tespitinde Evigene Testi,Latex Aglütinasyon Testi ve PZR Yönteminin karşılaştırılması
Tha comparison of Evigene Test,Latex Agglutination Test and PCR Metods for detecting of mecA Gene in Methicilline Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains
EMİN ÖZEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSüleyman Demirel ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ONUR KAYA