Toplum kaynaklı metisilin dirençli staphylococcus aureus (CA-MRSA) suşlarında kromozomal kaset tiplerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemleri ile araştırılması
Investigation of cassette chromosome types with polimerase chain reaction (PCR) in community-associated methicillin resistant staphylococcus aureus (CA-MRSA) strains
- Tez No: 242607
- Danışmanlar: PROF. DR. A. MURAT AKSOY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 171
Özet
S. aureus tüm dünyada toplum ve hastane kaynaklı enfeksiyonlara yol açan en önemli patojenlerden birisidir. Toksik şok sendromu, gıda zehirlenmesi, haşlanmış deri sendromu gibi toksikojenik hastalıklara; impetigo, follikülit, fronkül, karbonkül, sellülit, blefarit, mastit, cerrahi yara enfeksiyonları gibi lokal piyojenik hastalıklara ve endokardit, osteomiyelit, artrit, sepsis, pnömoni, idrar yolu enfeksiyonları, metastatik abseler ve menenjit gibi sistemik enfeksiyonlara yol açmaktadır. Nazal taşıyıcılık S. aureus enfeksiyonları için önemli bir risk faktörüdür. Önceleri bir nozokomiyal enfeksiyon etkeni olarak kabul edilen metisilin dirençli S. aureus (MRSA)'lar, 1980'lerden itibaren toplum kaynaklı enfeksiyonlardan da izole edilmeye başlamıştır. Çalışmanın amacı, konvansiyonel ve moleküler yöntemler kullanarak, çeşitli klinik örneklerden ve çeşitli yaş gruplarındaki sağlıklı taşıyıcılardan izole edilen S. aureus suşlarının direnç profillerinin ve virulans faktörlerinin belirlenmesi ve CA-MRSA suşların kromozomal kaset tiplerinin (SCCmec ve ccr gen kompleks) PCR yöntemleriyle araştırılmasıdır.Bu çalışma Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı'nda yürütülmüştür. Enfeksiyon etkeni olmayan CA-MRSA suşlarının elde edilmesi amacıyla, Ekim 2007-Mayıs 2008 tarihleri arasında, yaşları 4 ile 85 arasında değişen toplam 1040 sağlıklı bireyden burun ve koltuk altı örnekleri alınmıştır. Steril nemlendirilmiş eküvyonlar kullanılarak alınan burun ve koltuk altı örnekleri stuart taşıma besiyeri içerisine alınarak %5 koyun kanlı agar, EMB besiyeri ve antibiyotikli-SDA besiyerlerine inoküle edilerek rutin bakteriyolojik incelemeler yapılmıştır. Enfeksiyon etkeni olan 31 CA-MRSA suşu, 2004-2005 yılları arasında, İstanbul Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nin çeşitli polikliniklerine başvuran ve yaşları 4 ile 76 arasında değişen hastalardan alınan örneklerden (idrar, üretral akıntı, burun, püy, yara, eklem sıvısı) enfeksiyon etkeni olarak izole edilmiştir. S. aureus'u düşündüren gram pozitif koklardan katalaz, koagülaz, tüpte koagülaz testleri, mannitol salt agar ve DNaz testi yapılmıştır. Tüm S. aureus suşlarından fenol kloroform yöntemiyle DNA ekstraksiyonu yapılmış, PCR ve multipleks PCR yöntemleriyle mecA, PVL, SCCmec ve ccr gen kompleksi araştırılmıştır.1040 sağlıklı bireyde S. aureus taşıyıcılığı oranı %27,1 olarak hesaplanırken, bu oran erkeklerde (%32,1), kadınlara göre (%21,2) daha yüksek bulunmuştur (p
Özet (Çeviri)
S. aureus is one of the major causes of infections in both communities and hospitals worldwide. It is associated with toxigenic diseases such as toxic shock syndrome, food poisoning, scalded skin syndrome; local pyogenic diseases such as impetigo, folliculitis, furuncles, carbuncles, cellulites, blepharitis, mastitis, surgical wound infections; and systemic infections such as endocarditis, osteomyelitis, arthritis, sepsis, pneumonia, urinary tract infections, metastatic abscesses and meningitis. Nasal carriage is an important risk factor for S. aureus infections. Formerly known to be a nosocomial pathogen, methicillin resistant S. aureus (MRSA) has begun to be isolated from community associated infections since the 1980s. The aim of this study is to determine the resistance profiles and virulance factors of S. aureus strains isolated from various clinical specimens and healthy carriers of different age groups, and to investigate the cassette chromosome types (SCCmec ve ccr gen complex) with PCR methods.This study was carried out at Ankara University Faculty of Medicine, Department of Microbiology and Clinical Microbiology. In order to obtain CA-MRSA strains, nasal and axillary specimen were taken from 1040 healthy individuals of ages from 4 to 85, between October 2007 and May 2008. Taken using sterile moistured swabs and carried in Stuart?s transpor media, nasal and axillary specimen were inoculated on to 5% sheep blood agar, EMB media and SDA (including antibiotics) for routine bacteriological examinations. 31 CA-MRSA strains as infectious agents were isolated from urine, uretral discharge, nasal, pus, wound, joint fluid samples of outpatients of ages from 4 to 76 who applied to Istanbul Haydarpaşa Numune, Teaching and Research Hospital between 2004-2005. For all S. aureus strains, DNA extraction was performed by phenol chloroform method and mecA, PVL, SCCmec genes and ccr gene complex was investigated by PCR and multiplex PCR methods.The rate of S. aureus carriers among 1040 healthy individuals was found to be 27,1%, while carriage rates in males and females were found to be 32,1% and 21,2% respectively (p
Benzer Tezler
- Yoğun bakım ünitesinde yatan hastalardan üretilen staphylococcus aureus'lar için konak risk faktörlerinin S.aureus virulans faktörlerinden olan Panton- Valentine Lökosidin(PVL)geninin araştırılması
Investigation of host risk factors and PVL gene which is one of virulence factors for Staphylococcus aureus grown in nasal smear cultures of patients hospitalized in the intensive care unit
ZEYNEP KARLIBAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıDokuz Eylül ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. NUR YAPAR
- Çocuk yaş grubunda burun sürüntüsünde MRSA (metisiline dirençli staphylococcus aureus) taşıyıcılığının ve risk faktörlerinin belirlenmesi ile mrsa genotiplendirmesi
Determination of MRSA(methicillin resistance staphylococcus aureus) nasal colonization and risk factors in 1-15 age group in children and mrsa genotyping
AYŞE PERVANLAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMaltepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLHAN ASYA TANJU
- Toplum kaynaklı deri ve yumuşak doku infeksiyonlarından izole edilen staphylococcus aureus suşlarında, meca geni, panton-valentıne lökosidin geni varlığının ve sccmec gen kaseti tiplerinin incelenmesi, izolatların genotipik özelliklerinin pfge yöntemi ile belirlenmesi
The analysis of meca gene, panton-valentine leukocidin gene existence and sccmec gene cassette types in the staphylococcus aureus strains isolated from community originated infections of skin or sotf tissue
BEKİR CANER BARAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK ÇOLAK
- Kars yöresindeki sığırlarda metisilin dirençli staphylococcus aureus (MRSA) nazal taşıyıcılığının kültürel ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of nasal methicillin-resistant staphylococcus aureus (MRSA) carriage in cattle with cultural and molecular methods in Kars, Turkey
KADİR YILMAZ
Doktora
Türkçe
2024
MikrobiyolojiKafkas ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZGÜR ÇELEBİ
- Staphylococcus aureus klinik izolatlarında panton-valentin lökosidin varlığının araştırılması
Investigation of panton-valentine leukocidine presence in the clinical strains of Staphylococcus aureus
OSMAN SEZER CİRİT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET YILMAZ ÇOBAN