Investigation of cloning strategies for A.thaliana G protein α-subunit gene in Pichia pastoris
A.thaliana G-proteini α-alt birimi geninin pichia pastoris'de klonlama yöntemlerinin incelenmesi
- Tez No: 152830
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEHRA SAYERS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2004
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tezde A. thaliana heterotrimerik G-proteini a alt birimi geninin klonlanması ve ifadesi için yapılan çalışmalar sunulmuştur. Bu amaç doğrultusunda bol miktarda ve yüksek saflıkta rekombinant protein üretimi için uygun bir ökaryotik ifade hücresi seçilmiştir. Polimeraz zincir reaksiyonu sonucu elde edilen GPAl'nın Pichia Pastoris ifade vektörlerine takılmasıyla iki değişik plazmit pPICZC+GPAl ve pPICZaB+GPAl ' oluşturulmuştur. pPICZC+GPAl hücre içi ifade için tasarlanmıştır, öte yandan pPICZaB+GPAl' ise ifade edilen proteine eklenen sinyal dizisi aracılığıyla proteinin hücrenin dışına salgılanmasını sağlamaktadır. Değişik türdeki maya hücrelerinin kullanılmasıyla ifadeyi optimize etme imkanları üzerinde çalışılmıştır. Rekombinant GPAİ pPICZC+GPAl plazmiti ve GS115 hücrelerinin kullanılması sonucu sentezlenmiş ve protein ifadesi maya büyüme eğrileri ve western blot analizleri ile gözlenmiştir. Bu çalışma A. thaliana GPAİ geninin bir ökaryotik hücrede ifadesini gösteren ilk çalışmadır. Saflaştınlmış rekombinant GPAİ biyokimyasal incelemeleri, memeli sistemlerden eş değer proteinler ile karşılaştırmaları ve yapı analizlerini mümkün kılacaktır.
Özet (Çeviri)
In this thesis a strategy was developed to clone and express the gene of the A. thaliana heterotrimeric G-protein a subunit (GPA1). For this purpose an appropriate eukaryotic expression system was chosen to produce large quantities of high purity recombinant protein. GPA1 was amplified by PCR and cloned using a Pichia pastoris expression system. Two different plasmids pPICZC+GP^i and pPICZaB+GP^i ' were constructed. pPICZC+G/Mi was designed for intracellular expression whereas pPICZaB+GP/47 ' contained a signal peptide facilitating secretion of the recombinant protein into the extracellular medium. The possibility of using different yeast strains that may improve expression was explored. Recombinant synthesis of GPA1 was achieved with the pPICZC+GiMi construct using the strain GS1 15, which shows Mut+ phenotype. Expression was followed by monitoring growth of yeast as well as western blots of cellular extracts at different time points during induction. This study describes the first report of expression of A. thaliana GPA1 gene in a eukaryotic system and constitutes a critical step forward in studies of G-proteins in plants. It follows to reason that the availability of purified recombinant GPA1 will enable biochemical characterization, comparison with its mammalian counterparts and facilitate structural studies.
Benzer Tezler
- Koyunlarda haemonchus contortus'un moleküler karakterizasyonu ve benzimidazol dirençliliğinin moleküler olarak araştırılması
Molecular characterization of haemonchus contortus in sheep and molecular investigation of benzimidazole resistance
ZUHAL ÖNDER
Doktora
Türkçe
2014
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPARSLAN YILDIRIM
- Bio-immunoinformatik yaklaşımlarla in silico olarak leishmaniasis'e karşı çok peptitli aġı adayının tasarlanması ve immun simülasyon yöntemiyle etkinliğinin değerlendirilmesi
In silico design of multi-peptide vaccine candidate against leishmaniasis using BİO-immunoinformatic approaches and investigation of its effect by immune simulation methods
ARZUV CHARYYEVA
Doktora
Türkçe
2022
ParazitolojiErciyes ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. Alparslan YILDIRIM
- Rekombinant faj tail proteinlerinin bakterilere adezyonundaki rollerinin araştırılması
Investigation of the role of recombinant phage tail proteins in adhesions to bacteria
ABDULKERİM KARAYNİR
Doktora
Türkçe
2025
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT BOZDOĞAN
- Zymomonas mobilis levansukraz geninin Lactococcus Lactis konakçısına klonlama çalışmaları
Cloning strategies of Zymomonas mobilis levansucrase gene into Lactococcus lactis expresson host
İREM YAPANMIŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURCU KAPLAN TÜRKÖZ
- A numerical investigation of valve timing and variable compression ratio (vcr) strategies in a stroke volume modulated (svm) spark ignition (si) engine
Değişken strok hacmine sahip buji ateşlemeli motorda subap zamanlaması ve değişken sıkıştırma oranı yöntemlerinin sayısal olarak incelenmesi
AHMET YAPMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2026
Otomotiv Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BARIŞ DOĞRU