Geri Dön

Utilization of Scytalidium Thermophilum phenol oxidase in biorganic syntheses

Scytalidium Thermophilum fenol oksidazının biyoorganik sentezlerde kullanılması

  1. Tez No: 153425
  2. Yazar: YELDA KAPTAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZÜMRÜT ÖGEL, PROF. DR. UFUK BAKIR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Fenol oksidaz, Scytalidium thermophilum, Humicola insolens, lakkaz, biyoorganik sentez vıı, Phenol oxidase, Scytalidium thermophilum, Humicola insolens, laccase, bioorganic synthesis
  7. Yıl: 2004
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 107

Özet

oz SCYTALIDIUM THERMOPHILUM FENOL OKSİD AZININ BİYOORGANİK SENTEZLERDE KULLANILMASI Kaptan, Yelda Yüksek Lisans, Biyoteknoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Zümrüt B. Ögel Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Ufuk Bakır Eylül 2004, 90 sayfa Bu çalışmada temel amaç, Scytalidium thermophilum fenol oksidazlanmn biyoorganik sentezlerde kullanılmasıdır. Bu amaçla yapılan çalışmalar, Scytalidium thermophilum fenol oksidazımn üretiminin arttırılması, lakkaz aktivitesi tayin yöntemlerinin geliştirilmesi, organik çözgenlerin fenol oksidaz aktivitesi üzerine etkilerinin analiz edilmesi ve Scytalidium thermophilum fenol oksidazımn bir çok organik substratın biyotransformayonundaki rolünün analiz edilmesine yöneliktir. Fenol oksidaz üretiminin arttırılması amacıyla, gallik asit, klorojenik asit ve siringaldazinin indükleyici etkileri araştırılmış ve gallik asit fenol oksidaz üretimi için en uygun indüktör olarak belirlenmiştir. Yenilebilir mantar Agaricus bisporus' un Scytalidium thermophilum fenol oksidazı üzerine etkisi araştırılmış ancak herhangi bir indükleyici etki saptanmamıştır. Aktivite ölçümlerinde katekol, ABTS ve siringaldazin substratlan denenmiş ve katekol en uygun substrat olarak saptanmıştır. Katekolün 420 nm deki molar ekstinksiyon katsayısı (s),“substrat vikoru”kullanılarak 3450 M“1 cm”1,“enzim koru”kullanılarak 3700 M“1 cm”1 olarak hesaplanmıştır. Kinetik parametreler, Km ve Vmax değerleri, katekolün substrat olarak kullanıldığı enzimatik deneyler için, Lineweaver-Burk grafiğinden sırasıyla 52.03 mM ve 0.253 U/ml olarak, Hanes-Woolf grafiğinden ise sırasıyla 41.25 mM ve 0.2055 U/ml olarak bulunmuştur. Bazı organik çözgenlerin bu enzimler üzerine etkisi incelenmiş ve DMSO, enzim üzerindeki aktivator etkisi sebebiyle organik substratlar için daha uygun çözgen olarak saptanmıştır. Kültür ortamında bulunan Fenol oksidazlann benzoin, hidrobenzoin ve benzoil benzoini oksitleyebildikleri saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT UTILIZATION OF SCYTALIDIUM THERMOPHILUM PHENOL OXIDASE IN BIOORGANIC SYNTHESES Kaptan, Yelda M.S., Department of Biotechnology Supervisor: Prof. Dr. Zümrüt B. Ögel Co-supervisor: Prof Dr. Ufuk Bakır September 2004, 90 pages In this study, the ultimate aim was to utilize phenol oxidases of Scytalidium thermophilum in bioorganic syntheses. For this purpose, studies were conducted towards enhancing the production of phenol oxidases by Scytalidium thermophilum, developing a suitable method for laccase activity assays, analyzing the effects of organic solvents on phenol oxidase activity and analysis of the biotransformation of a number o f o rganic s ubstrates b y p henol o xidases o f S cytalidium t hermophilum. hi order to enhance the production of phenol oxidases, induction experiments were carried out with gallic acid, syringaldazine and chlorogenic acid. Gallic acid was found as the most effective inducer for phenol oxidase production. Inductive effect of edible mushroom Agaricus bisporus was also assayed, however, the phenolic compounds released by mushroom did not represent any induction for phenol oxidase activity of Scytalidium thermophilum. Different substrates were tested and ivcatechol was determined as the most suitable substrate rather than syringaldazine and ABTS. Molar extinction coefficient (s) of catechol was calculated as 3450 M“1 cm”1 and 3700 M'1 cm“1 by using ”substrate blank“ and ”enzyme blank" respectively at 420 ran. Kinetic parameters, Km and Vmax for the enzymatic reactions in which catechol was used as substrate were calculated as 52.03 mM and 0.253 U/ml respectively from Lineweaver-Burk plot and as 41.25 mM and 0.2055 U/ml from Hanes-Woolf plot. Effect of some organic solvents on phenol oxidases of Scytalidium thermophilum was assayed and DMSO was found as an appropriate solvent for the organic substrates. Phenol oxidase containing culture supernatant could oxidize benzoin, hydrobenzoin and benzoyl benzoin.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    313684

    Characterization and analysis of the antioxidant capacity of functional phenolics oxidized by Scytalidium thermophilum catalase phenol oxidase (CATPO)

    Scytalidium thermophilum katalaz fenol oksidazı (KATFO) tarafından okside olan fonksiyonel fenoliklerin karakterizasyonu ve antioksidan kapasitelerinin belirlenmesi

    ULVİYE BETÜL SÖYLER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖGEL

    YRD. DOÇ. DR. İLKAY ŞENSOY

  2. Tez No

    172300

    Morphine biotransformations by microbial phenol oxidases

    Mikrobiyal fenol oksidazlar ile morfin biyo-dönüşümleri

    BERİL ERDURAL KORKMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    Kimya MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Bölümü

    PROF.DR. AYHAN SITKI DEMİR

    PROF.DR. UFUK BAKIR

  3. Tez No

    82573

    Utilization of lignacellulosic compounds for the production of cellulases by torula thermophila

    Lignoselülozik maddelerin torula thermophilea tarafından selülaz üretimi amacı ile kullanılması

    HALİL DÜNDAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZÜMRÜT B. ÖGEL

  4. Tez No

    82593

    Utilization of artificial neural networks in building damage prediction

    Bina hasar tahminlerinde yapay sinir ağlarının kullanılması

    BARIŞ ERKUŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    İnşaat MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. POLAT GÜLKAN

  5. Tez No

    84208

    Beyaz peynir üretiminde sodyum klorürü düşürülmüş salamura kullanımının kalite üzerine etkileri

    Utilization of sodium chloride reduced brine in the production of white cheese and the effects on the quality

    ELİF BETÜL BAYRAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Gıda MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLBİLGE SALDAMLI

Geri Dön