Fare genomunda bulunan bazı oksidatif fosforilasyon yolu enzimleri ve bazı antioksidan enzim genlerinin cDNA'ların üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve in situ hibridizasyon ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some antioxidant and oxidative phosphorlytion patway genes in mouse genome, production of antisense mRNA and gen expression analysis by in situ hybridization
- Tez No: 170630
- Danışmanlar: PROF.DR. ÖMER İRFAN KÜFREVİOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: In situ hibridizasyon, mRNA, cDNA, gen ekspresyonu, antisens mRNA, In situ hybridization, mRNA, cDNA, gene expression, antisense mRNA u
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
ÖZET Yüksek Lisans Tezi FARE GENOMUNDA BULUNAN BAZI OKSİDATÎF FOSFORÎLASYON YOLU ENZİMLERİ ve BAZI ANTİOKSİDAN ENZİM GENLERİNİN cDNA'LARININ ÜRETİLMESİ, ANTİSENS mRNA ÜRETİMİ ve İN SİTU HİBRÎDİZASYONU İLE GEN EKSPRESYON ANALİZİ Veysel ÇOMAKLI Atatürk Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Kimya Anabilim Dalı Danışman: Prof. Dr. Ö. İrfan KÜFREVİOĞLU Hayvan genomları, 15.000 (Drosophila) ve 30.000 (insan, fare) arasında gen ihtiva ederler. Bu genlerin büyük çoğunluğunun sekanslarının bulunması, biyolojik regülasyonun temelini teşkil eden kompleks genetik ve protein etkileşmelerini araştırma imkanlarına neden olmuştur. Birçok bileşen ihtiva eden düzenleyici metabolik ağın anlaşılması için, her bir komponentin ekspresyon zamanının ayrıntılı bir şekilde bilinmesi önemli bir avantaj sağlar. Gen ekspresyon örnekleri, RNA in situ hibridizasyonu ile kolaylıkla belirlenebilir. Değişik dokularda gen ekspresyon örneklerinin tayini ve gösterilmesine izin veren tamamen otomatik olarak düzenlenmiş sistemler Hannover Max-Planck Enstitüsünde geliştirilmiştir. Ayrıca RNA in situ hibridizasyonu vasıtasıyla elde edilen gen ekspresyon verilerinin otomotik mikroskopik taranması için bilgisayar programı oluşturulmuştur. Bu çalışmada fare metabolizmasında bulunan bazı antioksidan ve oksidatif fosforilasyon yolu enzim genleri (Sod3, Gsta3, Gstm2, Gstm4, Gstol, Gsttl, G6pd2, Nosl, Por, Txnrd3, Gpx4, Ndufs2, Uqcrcl, Atp9a, AtplOa) seçildi.Bu enzimler için spesifik primerler düzenlendi.Bu spesifik primerler kullanılarak spesifik cDNA kalıpları hazırlandı. cDNA kalıpları ile antisens mRNA' lar (in vitro transkripsiyon) üretildi. Bu antisens mRNA problanyla 14,5 günlük fare embriyosu üzerinde in situ hibridizasyon yapıldı. Ekspresyon sonuçları mikroskopta incelenerek internet ortamına (www.genepaint.org) aktarıldı. 2005, 93 sayfa
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Master Thesis cDNA'S PRODUCTION OF SOME ANTIOXIDANT AND OXIDATIVE PHOSPHORLYTION PATHWAY GENES IN MOUSE GENOME, PRODUCTION OF ANTISENS mRNA AND GEN EXPRESSION ANALYSIS BY IN SITU HYBRIDIZATION Veysel ÇOMAKLI Atatürk University Graduate School of Natural and Applied Sciences Department of Chemistry Supervision Prof. Dr. Ö.İrfan KÜFREVİO?LU Genomes of animals contain between 15 000 (e.g.Drosophila) and 30 000 (human, mouse) genes. The availability of sequence data for many of these genes opens up opportunities to study complex genetic and protein interactions that underlie biological regulations. Many examples demonstrate that an understanding of regulatory networks consisting of multiple components is significantly advanced by a detailed knowledge of the spatiotemporal expression pattern of each of the components. Gene expression patterns can readily be determined by RNA in situ hybridization. To achieve this goal have been developed high-throughput technologies in a fully automated fashion that allow the determination and visualization of gene expression patterns by RNA in situ hybridization on tissue sections at cellular resolution. In addition, they have put together hardware and software for automated microscopic scanning of gene expression data that are produced by RNA in situ hybridization In this study, gene of some enzymes (Sod3, Gsta3, Gstm2, Gstm4, Gstol, Gsttl, G6pd2, Nosl, Por, Txnrd3, Gpx4, Ndufs2, Uqcrcl, Atp9a and AtplOa) was selected in antioxidant and oxidative phosphorylation way. Specific primers was arranged. Specific cDNA templates was prepared with these specific primers. Antisense mRNAs (in vitro transcription) was produced with specific cDNA templates, in situ hybridization in which was used these antisense mRNAs on mouse embryo (14,5 days) was made. Automated microscopic scanning of gene expression datas were investigate and these results were transfered with software in internet (www.genepaint.org). 2005, 93 pages
Benzer Tezler
- Fare genomunda bulunan bazı glikoliz yolu genlerinin cDNA''larının üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve İn Situ hibridizasyon ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some glycolysis patway genes in mouse genome, production of antisens mRNA and gen expression analysis by In Situ hybridization
MURAT ÇANKAYA
- Fare genomunda bulunan bazı TCA devri enzim genlerinin cDNA'larının üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some TCA cycle enzyme genes in mouse genome, production of antisense mRNA and gene expression analysis by in situ hybridization
HARUN BUDAK
- Fare genomunda bazı yağ asitleri yıkım ve sentez enzim genlerinin cDNA'larının üretilmesi, antisens mRNA sentezi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some fatty acids synthase and catabolism enzyme genes in mouse genome, production of antisens mRNA and gen expression analysis by in situ hybridization
TUFAN EMİRÇUPANİ
- Fare genomunda bulunan kolesterol ve safra asitleri sentezinde görev alan bazı enzim genlerinin cDNA'larının üretilmesi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA?s production of cholesterol and biile acid synthesis genes encoding enzymes in mouse genome and analysis of genes expression by in situ hybridization
MELDA ŞİŞECİOĞLU
- Fare genomunda bulunan glutamat metabolizması genlerinin cDNA'larının üretilmesi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA?s production of glutamate metabolism genes in mouse genome and analysis of gen expression by in situ hybridization
MURAT ÇANKAYA
