Yeni bir termofilik bakterinin, Anoxybacillus gonensis A4, hücredışı lipaz/esteraz yeteneğinin incelenmesi ve karakterizasyonu
Investigation of lipase/esterase capabilities of a novel bacteriım, Anoxybacillus gonensis A4
- Tez No: 171013
- Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. AHMET ÇOLAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Termofilik, Isıl Kararlı, Anoxybacillus, Lipaz, Esteraz V, Thermophilic, Thermostable, Anoxybacillus, Lipase, Esterase VI
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
ÖZET Bu çalışmada yeni bir termofilik bakteri olan Anoxybacillns gonensis A4 (A. gonensis A4) susunun esterolitik aktivitesi incelendi. Ester bağlarını hidrolizleyen hücre dışı bir enzimin varlığı tributirin-agar testi ile belirlendi. Tributirinli petrilerde büyütülen A. gonensis A4 izolatı etrafında berrak bölgelerin oluşması bu termofilde bir esterazm varlığını desteklemektedir. %0,3 karboksimetilselüloz Luria-Bertani (LB) besiyerinde büyümeyi ve spektrofotometrik olarak belirlenen esteraz aktivitesini artırdı. Substrat özgünlük çalışmaları, A. gonensis A4 susundan hazırlanan hücredışı enzim özütünün, kısa zincirli /?-nitrofenil (PNP) esterlerini hidrolizleme kabiliyetinin uzun zincirli p-nitrofenil (PNP) esterlerini hidrolizleme kapasitesine göre daha yüksek olduğu saptandı. A. gonensis A4 susu hücredışı esterazının optimum sıcaklığı yaklaşık 80 °C, optimum pH'ı ise 5,5 olarak belirlendi. Isıl kararlılık eğrisi incelendiğinde, enzimin 30 dakika 30-70 °C arasındaki sıcaklıklarda inkübasyonuyla aktivitesinin yaklaşık %20 oranında arttığı gözlendi. Metal iyonlarının A. gonensis A4 susu hücredışı esteraz enzimi aktivitesi üzerine etkisini incelemek amacıyla nihai konsantrasyonu 1 mM olacak şekilde 11 farklı metal klorür tuzu kullanıldı. Enzim aktivitesi K+ varlığında %15 artış gösterdi ve diğer metal iyonlarının bazıları aktivite üzerinde hiçbir etki göstermezken diğer bazılarının aktiviteyi düşürdüğü gözlendi. Fenilmetilsülfonilflorür tarafından inhibisyon katalitik aktivitede önemli bir rol oynayan kritik bir serin amimoasidinin varlığını desteklemektedir. Elde edilen sonuçlar, A. gonensis AA susunun, genel olarak önceden belirtilen esterazlara benzer özelliklere sahip yüksek derecede ısıl kararlı bir gerçek esteraz salgıladığını göstermektedir.
Özet (Çeviri)
SUMMARY Investigation of Esterase Capabilities of a Novel Bacterium, Anoxybacillus gonensis A4 In this study, esterolytic activities of a novel thermophilic bacterium, Anoxybacillus gonensis A4 strain, were investigated. Occurence of an extracellular enzyme that hydrolyzes ester bonds was dedected by tributyrin agar assay. Formation of clear zones around A. gonensis A4 isolates on agar plates containing tributyrin also supported the presence of an esterase in this thermophile. 0.3% Carboxymethylcellulose stimulated both the growth in Luria-Bertani (LB) medium and the esterase activities determined spectrophotometrically using /7-nitrophenylbutyrate as substrate. The extracellular crude enzyme prepared from A. gonensis cultures showed greater substrate specicifities for short chain /7-nitrophenylesters than those for long chain /7-nitrophenylesters. The temperature optimum of A. gonensis A4 extracellular esterase was found to be nearly 80 °C and its pH optimum was dedected to be 5.5. When thermostability data was examined, it was seen that the esterolytic activity was stimulated at about 20% levels at temperatures ranging from 30 to 70 °C after 30 minutes of incubation. The effectiveness of various metal ions on the enzyme activity was tested for chloride salts of 1 1 metal ions at final concentration of 1 mM. In the presence of K+, the activity was enhanced at about 15%. The other ions had either no effect on esterase activities or possessed different inhibition profiles. Inhibition by phenylmethylsulphonylfluoride supported the presence of a critical serine residue thought to be significant for catalytic activity. All these results support that Anoxybacillus gonensis A4 strain excretes a highly thermostable true esterase possesing interesting characteristics some of which are similar to esterases reported earlier.
Benzer Tezler
- Yeni bir termofilik bakterinin, Anoxybacillus gonensis, polihidroksibutirat parçalama yeteneğinin incelenmesi
Investigation of polyhydroxybutyrate degradation capabilities of a novel bacterium, Anoxybacillus gonensis
DENİZ ŞİŞİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
KimyaKaradeniz Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SADETTİN GÜNER
- Sıcak su kaynaklarından bakteri izolasyonu, tanımlanması ve Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. Rittmanii'nin b-galaktozidaz enziminin saflaştırılması
Identification, isolation of bacteria from the hot spring and the purification of ß-galactosidase in Alicyclobacillus acidocaldarius subspecies Rittmanii
REYHAN GÜL GÜVEN
- Yeni türler oldukları öngörülen amilaz üreticisi termofilik Anoxybacillus izolatlarının fenotipik, kemotaksonomik ve moleküler taksonomik yaklaşımlar kullanılarak teşhisi
Identification of thermophilic amylase producing Anoxybacillus isolates proposed as novel bacterial species by using phenotypic, chemotaxonomic and molecular taxonomic approaches
EMİNE DEREBAY YILDIZ
Doktora
Türkçe
2017
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARZU ÇÖLERİ CİHAN
- Discovery of novel enzymes using proteomic approaches
Proteomik yaklaşımlar kullanılarak yeni enzimlerin keşfi
MERVE ÖZTUĞ KILINÇ
Doktora
İngilizce
2021
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
DOÇ. DR. MÜSLÜM AKGÖZ
- Türkiye'nin çeşitli kaplıcalarından Anoxybacillus türlerinin izolasyonu, karakterizasyonu ve tanımlanması
Isolation, characterization and identification of the Anoxybacillus species from varied hot springs of Turkey
KADRİYE İNAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ALİ OSMAN BELDÜZ