Geri Dön

Selection of titanium specific polypeptides by phage display technique

Titanyuma özgün polipeptitlerin faj gösterim tekniğiyle seçilimi

  1. Tez No: 172075
  2. Yazar: KAMİL SEMİH KARABULUT
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. CANDAN TAMERLER, DOÇ.DR. HAKAN BERMEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 73

Özet

titanyuma ozgun olan polipeptitlerin faj gösterim yöntemiyle seçimi ÖZET Doğadaki hemen hemen tüm organizmalar organik-inorganik hibrid sistemlerini kullanırlar. Bu sistemler yapısal ve/veya koruyucu amaçlı olmakla beraber aynı zamanda hücreler arası etkileşimde de görev alırlar. Bu tip organik-inorganik hibritlerin oluşmasında başlıca rolü proteinler oynamaktadır. Proteinler organizmaların en önemli yapıtaşlarındandır. Bu mükemmel işlevsellikleri nedeniyle inorganik malzemelere özgün olan polipeptidler biyoteknolojide ve nanobiyoteknolojide kullanılmaya çalışılmaktadır. Faj gösterim tekniği çeşitli inorganik malzeme yüzeylerine özgün olarak bağlanan polipeptitlerin seçiliminde kullanılan kombinatoryal biyoloji tabanlı bir yöntemdir. Son zamanlarda genetik mühendisliğinin büyük yol katetmesi sonucu inorganik yüzeylere bağlanan polipeptitler üzerine yapılan çalışmalar hızla artmaktadır. Bu malzemelere soy metaller, bazı metal oksitler ve yan iletken malzemeler örnek verilebilir. İnorganiklere özgün olan polipeptitler moleküler bağlayıcı veya inorganik sentezi gibi nano ve bionanoteknolojik alanlarda kullanılabilir. Bu çalışmada toz titanyuma özgün polipeptitler faj gösterim yöntemiyle seçilmiştir. Titanyumun inorganik malzeme olarak seçilmesinin sebebi biyouyumluluğu yüksek bir malzeme olması ve tıp alanında özellikle diş implantlarında sıklıkla kullanılmasıdır. Titanyuma özgün polipeptitlerin seçimi C7C faj gösterim kütüphanesinden yapılmıştır. Faj gösterim protokolü uygulanmadan önce malzeme karakterizasyonu yapılıp, yüzey alanı, parçacık büyüklüğü ve yüzey morfolojisi hakkında bilgi edinilmiştir. Deney seti süresince 3 döngü yapılmıştır. Bu döngüler sonucunda rastgele 51 dizi seçilip titanyuma bağlanma eğilimi ve Özgünlüğü incelenmiştir. Deney setinin sonunda, tanımlanan polipeptit dizilerinin amino asit oranları hesaplanarak faj kütüphanesindeki amino asit oranlarıyla karşılaştırılmıştır. Daha sonra orantısal analizleri yapılan polipeptit dizilerinin titanyuma bağlanma eğilimlerini araştırmak için floresan mikroskobu çalışması yapılmıştır. Seçilen polipeptitlerin titanyumun yüzeyine bağlanma eğilimleri incelenip, güçlü, orta ve zayıf bağlanan olarak 3 kategoriye ayrılmıştır. Güçlü bağlanan polipeptitler titanyuma olan özgünlüğünü anlamak için platin, gümüş ve silika ile florasan mikroskobu çalışmaları yapılmıştır. xu

Özet (Çeviri)

SELECTION OF TITANIUM SPECIFIC POLYPEPTIDES BY PHAGE DISPLAY TECHNIQUE SUMMARY In nature, nearly all of the organisms utilize organic-inorganic hybrid systems. Either these systems play structural and/or defensive roles, or function in intercellular interactions between cells. Proteins are the major molecules in formation of this type of hybrid systems. Proteins are, in fact the major building blocks of all organisms. Polypeptides are used in biotechnologic and nano-biotechnologic areas due to their excellent functionality in complexes with inorganic materials. Phage display technique is one of the combinatorial biology based selection techniques used in selection of inorganic binding peptides. Recent years, there is a great trend to study on selecting inorganic binding polypeptides by phage display technology. Some noble metals, metal oxides and semiconductors could be given as examples to these studies preformed recently. Inorganic specific polypeptides can be used in nanotechnological and bionanotechnological applications as molecular linkers and take role in inorganic biomineralization. In the current work, titanium specific polypeptides were selected via using phage display technique. The rationale for selecting titanium as an inorganic subtrate may be explained by its biocompatibility and popularity in medical implants, especially the dental implants. C7C phage library was used to select titanium specific polypeptides. Before screening, material characterization studies were carried out in order to get information about particle size, particle surface and morphology. After 3 rounds of screening 51 sequences were randomly selected to study the binding affinities and specificities. At the end of the screening procedure amino acid distribution of selected sequences and observed amino acid frequencies in library were compared, after amino acids frequency analyses, fluorescence microscopy experiments were carried out in order to understand the binding affinity of selected polypeptides to titanium powder. After fluorescence microscopy studies, polypeptides were grouped as strong, moderate and weak binding polypeptides by their affinities. Selection of strong polypeptides was not considered sufficient to assure which polypeptide was“specific”to titanium therefore cross specificity experiments were performed with platinum, silver and silica by examination on fluorescence microscopy. XI

Benzer Tezler

  1. Tez No

    166329

    Selection of mica binding polypeptides by using phage display technology

    Mikaya özgün olarak bağlanan polipeptitlerin faj gösterim tekniğiyle taranması

    HİLAL YAZICI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2005

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HAKAN BERMEK

    DOÇ. DR. CANDAN TAMERLER

  2. Tez No

    392784

    Synthesis and catalytic applications of metal oxide based materials in particulate form

    Partikül formunda metal oksit bazlı malzemelerin sentezi ve katalitik uygulamaları

    KADRİYE ÖZLEM HAMALOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Kimya MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜLEYMAN ALİ TUNCEL

  3. Tez No

    352353

    Çok işlevli uyluk çivisi tasarımı, üretimi ve mekanik özellikleri

    Multifunctional femoral nail design, production and mechanical properties

    MUHARREM MERAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EYÜP SABRİ KAYALI

  4. Tez No

    39520

    Seramik birleştirme teknolojisi ve yapısal seramiklerin lehimlenmesi

    Ceramic foining technology and brazing of structural ceramics

    OSMAN AKKOCA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    DOÇ.DR. OKTAY BODUR

  5. Tez No

    521172

    Ti4Al4Mo ve Ti6Al4V alaşımlarının sıcak pres ile üretimi ve erozif aşınma davranışlarının incelenmesi

    Processing of Ti4Al4Mo and Ti6Al4V alloys via hot pressingand investigation of their erosive wear behaviour

    KADİR ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Metalurji MühendisliğiKocaeli Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. RIDVAN YAMANOĞLU

Geri Dön