Selection of titanium specific polypeptides by phage display technique
Titanyuma özgün polipeptitlerin faj gösterim tekniğiyle seçilimi
- Tez No: 172075
- Danışmanlar: DOÇ.DR. CANDAN TAMERLER, DOÇ.DR. HAKAN BERMEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
titanyuma ozgun olan polipeptitlerin faj gösterim yöntemiyle seçimi ÖZET Doğadaki hemen hemen tüm organizmalar organik-inorganik hibrid sistemlerini kullanırlar. Bu sistemler yapısal ve/veya koruyucu amaçlı olmakla beraber aynı zamanda hücreler arası etkileşimde de görev alırlar. Bu tip organik-inorganik hibritlerin oluşmasında başlıca rolü proteinler oynamaktadır. Proteinler organizmaların en önemli yapıtaşlarındandır. Bu mükemmel işlevsellikleri nedeniyle inorganik malzemelere özgün olan polipeptidler biyoteknolojide ve nanobiyoteknolojide kullanılmaya çalışılmaktadır. Faj gösterim tekniği çeşitli inorganik malzeme yüzeylerine özgün olarak bağlanan polipeptitlerin seçiliminde kullanılan kombinatoryal biyoloji tabanlı bir yöntemdir. Son zamanlarda genetik mühendisliğinin büyük yol katetmesi sonucu inorganik yüzeylere bağlanan polipeptitler üzerine yapılan çalışmalar hızla artmaktadır. Bu malzemelere soy metaller, bazı metal oksitler ve yan iletken malzemeler örnek verilebilir. İnorganiklere özgün olan polipeptitler moleküler bağlayıcı veya inorganik sentezi gibi nano ve bionanoteknolojik alanlarda kullanılabilir. Bu çalışmada toz titanyuma özgün polipeptitler faj gösterim yöntemiyle seçilmiştir. Titanyumun inorganik malzeme olarak seçilmesinin sebebi biyouyumluluğu yüksek bir malzeme olması ve tıp alanında özellikle diş implantlarında sıklıkla kullanılmasıdır. Titanyuma özgün polipeptitlerin seçimi C7C faj gösterim kütüphanesinden yapılmıştır. Faj gösterim protokolü uygulanmadan önce malzeme karakterizasyonu yapılıp, yüzey alanı, parçacık büyüklüğü ve yüzey morfolojisi hakkında bilgi edinilmiştir. Deney seti süresince 3 döngü yapılmıştır. Bu döngüler sonucunda rastgele 51 dizi seçilip titanyuma bağlanma eğilimi ve Özgünlüğü incelenmiştir. Deney setinin sonunda, tanımlanan polipeptit dizilerinin amino asit oranları hesaplanarak faj kütüphanesindeki amino asit oranlarıyla karşılaştırılmıştır. Daha sonra orantısal analizleri yapılan polipeptit dizilerinin titanyuma bağlanma eğilimlerini araştırmak için floresan mikroskobu çalışması yapılmıştır. Seçilen polipeptitlerin titanyumun yüzeyine bağlanma eğilimleri incelenip, güçlü, orta ve zayıf bağlanan olarak 3 kategoriye ayrılmıştır. Güçlü bağlanan polipeptitler titanyuma olan özgünlüğünü anlamak için platin, gümüş ve silika ile florasan mikroskobu çalışmaları yapılmıştır. xu
Özet (Çeviri)
SELECTION OF TITANIUM SPECIFIC POLYPEPTIDES BY PHAGE DISPLAY TECHNIQUE SUMMARY In nature, nearly all of the organisms utilize organic-inorganic hybrid systems. Either these systems play structural and/or defensive roles, or function in intercellular interactions between cells. Proteins are the major molecules in formation of this type of hybrid systems. Proteins are, in fact the major building blocks of all organisms. Polypeptides are used in biotechnologic and nano-biotechnologic areas due to their excellent functionality in complexes with inorganic materials. Phage display technique is one of the combinatorial biology based selection techniques used in selection of inorganic binding peptides. Recent years, there is a great trend to study on selecting inorganic binding polypeptides by phage display technology. Some noble metals, metal oxides and semiconductors could be given as examples to these studies preformed recently. Inorganic specific polypeptides can be used in nanotechnological and bionanotechnological applications as molecular linkers and take role in inorganic biomineralization. In the current work, titanium specific polypeptides were selected via using phage display technique. The rationale for selecting titanium as an inorganic subtrate may be explained by its biocompatibility and popularity in medical implants, especially the dental implants. C7C phage library was used to select titanium specific polypeptides. Before screening, material characterization studies were carried out in order to get information about particle size, particle surface and morphology. After 3 rounds of screening 51 sequences were randomly selected to study the binding affinities and specificities. At the end of the screening procedure amino acid distribution of selected sequences and observed amino acid frequencies in library were compared, after amino acids frequency analyses, fluorescence microscopy experiments were carried out in order to understand the binding affinity of selected polypeptides to titanium powder. After fluorescence microscopy studies, polypeptides were grouped as strong, moderate and weak binding polypeptides by their affinities. Selection of strong polypeptides was not considered sufficient to assure which polypeptide was“specific”to titanium therefore cross specificity experiments were performed with platinum, silver and silica by examination on fluorescence microscopy. XI
Benzer Tezler
- Selection of mica binding polypeptides by using phage display technology
Mikaya özgün olarak bağlanan polipeptitlerin faj gösterim tekniğiyle taranması
HİLAL YAZICI
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HAKAN BERMEK
DOÇ. DR. CANDAN TAMERLER
- Sürdürülebilir endodontik malzeme seçim modelinin uygulama geçerliliğinin sınanması
Testing the practical validity of the sustainable endodontic material selection model
DENİZ DOĞAN BULUT
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2025
Diş HekimliğiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiEndodonti Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EKİM ONUR ORHAN
- Utilization of Titanium-silicalite-1 (TS-1) as inorganic filler in mixed matrix membrane formation for CO2 separation
CO2 ayırımı için karışık matrisli membranlarda (KMM) inorganik katkı maddesi olarak Titanyum-silikalit-1 (TS-1) kullanımı
ÖZLEM HAVAL DEMİREL
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERİFE BİRGÜL ERSOLMAZ
- Yapıda malzeme seçimi için bir yaklaşım: Metal esaslı cephe kaplama malzemesi örneği
An approach to material selection in construction: A review of metal facade cladding material
ŞAFAK GÖKTEPE
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEYLA TANAÇAN
- The effects of process parameters on the cell morphology of the aluminum foam
Üretim parametrelerinin alüminyum köpüklerin hücre yapıları üzerine etkileri
TOLGA UÇAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Makine MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. SABRİ ALTINTAŞ