Bazı sitokinlerin C/EBPd geninin transkripsiyonel regülasyonu üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of some cytokines effects in transcription regulation of human C/EBPd gene
- Tez No: 176661
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FERAY KÖÇKAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 128
Özet
C/EBP'ler (CCAAT/enhancer binding proteins) C-terminus'da tüm üyelerinde korunmuş bir bazik lösin fermuar domaini içeren transkripsiyon faktör ailesidir. Bu domain bir DNA bağlanma ve dimerizasyon motifi oluşturmaktadır. Ailenin altı farklı üyesi, C/EBP?, C/EBPß, C/EBP?, C/EBP?, C/EBP?, ve C/EBP? olmak üzere, izole edilmiş ve karekterizasyonu yapılmıştır. C/EBP aile üyelerinden biri olan C/EBP? hemen hemen her dokuda ekspre edilmesine rağmen seviyeleri farklılık göstermektedir. Örneğin C/EBP? böbrek ve testislerde fazlaca ekspre olmaktadır. İnsan C/EBP? geniş bir açık okuma dizisine sahip olan bir eksondan ibarettir. C/EBPd 269 a.a.'ten oluşan bir protein şifrelemektedir. C/EBP? doku veya hücre tipine spesifik tarzda regüle edilmektedir. C/EBP? interlökin-1 ( IL-1), interlökin-6 (IL-6) ve tümör nekrosis faktör-? (TNF-?) gibi inflamasyonel uyarıcılar tarafından regüle edilmektedir. C/EBP? doku hasarları, enfeksiyon, inflamasyon ve akut faz cevapta, hücre proliferasyonunda, hücrelerde enerji metabolizmasının düzenlenmesinde ve meme epitel hücrelerinin apoptosisde önemli rol oynamaktadır. C/EBP? gen haritası 8. (8p11.1-p11.2) kromozomdadır. Ve insan kanserlerinin çoğu kromozom 8p'de var olan mutasyonlar sebebiyle olmaktadır. Bu sebepledir ki C/EBP? son çalışmalarda bir tümör baskılayıcı gen olarak tanımlanmıştır. Fakat çok sayıda dokulara spesifik genlerin ekspresyonlarını kontrol eden C/EBP?'nın regülasyonu konusundaki bilgi oldukça sınırlıdır. Bu çalışmada, insan C/EBP? geninin transkripsiyonel regülasyonunu aydınlatmayı amaçladık. Bu amaçla lüsiferaz vektörüne klonlanmış olan C/EBP? promoteri insan hepatoma hücre hattı olan Hep3B hücrelerine kalsiyum fosfat transfeksiyon yöntemi ile aktarıldı. Geçici transfeksiyon uygulaması sonrasında, C/EBP? promoterinin bazal aktivietsi lusiferaz aktivite tayini ile belirlendi. Daha sonra IL-6, TNF-?, TGF-ß, IFN-? ve IL-1 gibi birçok sitokinin C/EBP? promoterinin regülasyonuna olan etkileri saptandı. Genin regülasyonunda etkileri belirlenen sitokinlerin konsantrasyon ve zaman bağlı analizleri yapıldı. Ayrıca C/EBP? nın mRNA seviyesinde ekspresyon analizleri RT-PCR çalışmaları ile belirlendi. Anahtar kelimeler; C/EBP, C/EBP?, İnflamasyon, Sitokinler, Transkripsiyon faktörleri
Özet (Çeviri)
CCAAT/enhancer binding proteins (C/EBPs) are a family of transcription factors that all contain a highly conserved, basic leucine zipper domain at the C-terminus. The domain consists of DNA binding and dimerization motif. The six members of the family have been isolated and characterized as C/EBP?, C/EBP?, C/EBP?, C/EBPß, C/EBP?, C/EBP?. As one of the C/EBP family members, C/EBP? are almost ubiquitously expressed in every tissues, but with varying levels. C/EBP? expression is most abundant in kidney and testis. The human C/EBP? turned out to be oneexon gene with a large open reading frame encoding a protein of 269 amino acid. C/EBP? can also be up-regulated in a tissue or cell type-specific manner. C/EBP?, is well known to regulate or co-regulate a wide range of inflammatory mediators and mechanisms in the periphery, including interleukin-1 (IL-1), interleukin-6 (IL-6), and tumor necrosis factor-? (TNF-?). C/EBP? also plays a role in acute-phase response in injury, infection and inflammation, cell proliferation, energy metabolism regulation and mammary epithelial cell apoptosis. The human C/EBP? gene maps on chromosome 8 (8p11.1-p11.2). Alterations in chromosome 8p are common in human cancers. Accordingly in recent reports, alterations of C/EBP? identified as a tumour supressor gene. However, the knowledge of the regulation of C/EBP? that control the transcriptional regulation of a number of tissue specific genes is very limited. In this study, we aimed to elucidate the trancriptional regulation of the human C/EBP? gene. In this purpose, C/EBP? promoter in a luciferase vector was transfected in to human hepatoma cell line (Hep3B) with calcium phosphate transfection method. Upon the transient transfection, the basal activity of the C/EBP? promoter was determined by luciferase activity. Afterwords, for the determination of cytokine mediated regulation of the C/EBP? gene, several cytokines, namely IL-6, TNF-alfa, TGF-beta, IFN-gama and IL-1 were used and the effect of cytokines on the C/EBP? gene investigated. For the cytokines which have an effect on C/EBP? gene, concentration, time analysis were completed. Futhermore, the expression levels of C/EBP? mRNAs were also determined with RT-PCR analysis. Key words; C/EBP, C/EBP?, Cytokines, Inflammation, Transcription Factor.
Benzer Tezler
- Primordiyal folikülden antral foliküle bazı sitokinlerin ekspresyonu ve değerlendirilmesi
Evaluation and Expressions of some cytokines from primordial follicle to antral follicle
RABİA KOÇ ÖZAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERPİL KALKAN
- Yeni teşhis edilmiş akut hepatit C virüsü enfeksiyonunda interleukin 16 ve interferon alfa'nın rolü ve bunun HCV RNA düzeyleri ile ilişkisi
Role of interleukin 16 and interferon alpha in newly diagnosed acute hepatitis C virus infection and its relation to HCV RNA levels
RUYA QASIM SHUKUR SHUKUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TAMER KEÇELİ
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASMAA MOHAMMED SULAIMAN
- Ailevi Akdeniz ateşi hastalarında endotel disfonksiyonu mikroalbuminüri ile ilişkili midir?
Is endothelial dysfunction related with microalbuminuria in patients with familial Mediterranean fever?
HAKAN GÜNEŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
KardiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiKardiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BİRHAN YILMAZ
- Metabolik sendrom tanısı almış hastalarda medikal tedaviye ek olarak yapılan ılımlı egzersizin serum lipid, adipokin, sitokin ve apolipoprotein düzeylerine etkisi
The effect of moderate exercise plus medical treatment with MetS diagnosed patients on serum lipids, adipokine, cytokine and apolipoproteins levels
KUTLUHAN ERTEKİN
- Bazı cırsıum mıll. (asteraceae) türleri üzerinde farmakognozik araştırmalar
Pharmacognosic studies on some cirsium mill. (asteraceae) species
SILA ÖZLEM ŞENER
Doktora
Türkçe
2019
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYRİYE GÜLÇİN SALTAN