Isı şok proteini HSP 70'in stres ve farklı nükleotitler varlığında yapısında meydana gelen değişikliklerin incelenmesi
Conformational changes of heat shock protein 70 in the presence of stress and different nucleotides
- Tez No: 179680
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. YUSUF TUTAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Kimya, Biochemistry, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Bölümü
- Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 96
Özet
Hsp70 türler arasında korunmuştur ve hücrelerin yaşamı için gereklidir. Hsp70lerin nükleotid dizisi hatta amino asit dizileri karşılaştırıldığında yüksek oranda benzerlik gösterirler. Bundan dolayı, laboratuarımızda Hsp70 proteinlerinin yapı-fonksiyon ilişkileri incelendi. Maya strainlerinin manipülasyonu diğerlerine göre daha kolay olması itibarı ile sitozolik maya proteini Hsp70 (Ssa1) ve iki maymun homolog proteini S.Pombe' de karşılaştırıldı. Maymun proteinleri Hsc70 ve Hsp70 sırasıyla konstitif ve indüktif olarak eksprese edilirler.Fonksiyonlarını yerine getirebilmeleri için proteinlerin doğru olarak katlanması gereklidir. Stres altında, proteinler üçüncül yapılarını ve dolayısı ile fonksiyonlarını kaybederler. Bundan dolayı Hsp70 substrat proteinlerin doğal haline katlanabilmelerine yardımcı olabilmeleri için göreceli yüksek sıcaklıklara dayanabilmelidirler.Bu araştırmanın amacı, farklı nükleotitler varlığında ve yokluğunda ısı stresi altında Hsp70'in karalılığının ve yapısının araştırılmasıdır.Spektroskopik ve kalorimetrik deneyler tüm proteinlerin fizyolojik olarak yüksek sayılan sıcaklıklarda kararlı olduklarını ve farklı nükleotitler varlığında yapılarını koruduklarını gösterdi.Literatürde ilk olarak, Hsp70 plazmitlerinin bütün maya hücreleri üzerine etkisini incelendi. Bu ilave deneyler, proteinlerin kararlılığa etkisi olma açısından, plazmitlerin hücreye kararlılık verdiğini gösterdi.
Özet (Çeviri)
Hsp70 is conserved among species and is essential for existence of the cell. Nucleotide sequence comparison and even amino acid sequence comparison of Hsp70s indicated high sequence similarity. In this end, our lab decided to examine-structure function relationship of Hsp70 proteins. Since manipulation of yeast strain is relatively easier, yeast stoplasmic Hsp70 (Ssa1) and two primate homolog were compared in S. Pombe. Primate proteins Hsc70 and Hsp70 are constitutively and inductively expressed respectively.To elucidate their function, proteins must be correctly folded. Under stress, proteins lose their tertiary structure and as a consequence their function. Thus, Hsp70 must bear to relatively elevated temperatures so that it can help substrate proteins to fold their native state.The purpose of this investigation was to investigate structure and stability of Hsp70 under heat stress in the presence and absence of different nucleotides.Spectroscopic and calorimetric experiments showed that all proteins were stable at physiologically high temperatures and maintain their structure in the presence of different nucleotides. Also, nucleotides do not introduce significant structural changes and the proteins assume rigid body movement for signal transduction for their function.For the first time in the literature we investigated the effects of Hsp70 plasmids on intact yeast cells. This additional experiment showed that the plasmids confer appreciable stability to the cells, another indication for the stability contribution of the proteins.
Benzer Tezler
- Acanthamoeba castellanii'den HSP70 geninin izolasyonu ve karakterizasyonu
The isolation and characterisation of acanthamoeba castellanii HSP70 gene
KÜBRA AÇIKALIN COŞKUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
ParazitolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA ÖZÇELİK
- Toxoplasma gondii'den Hsp70'in izolasyonu ve biyokimyasal karakterizasyonu
Insulation of Hsp70 from Toxoplasma gondii and its biochemical charecterization
SAHİL DİLMEÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyomühendislikCumhuriyet ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YUSUF TUTAR
- Saanen keçilerinde ısı şok proteini 60 (HSP 60) ve ısı şok proteini 70 (HSP 70) genlerinin kantitatif analizi
Quantitative analysis of heat shock protein 60 (HSP 60) and heat shock protein 70 (HSP 70) genes in saanen goats
SELÇUK ERTÜRK ADIYAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyokimyaAdnan Menderes ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FUNDA KIRAL
- Identification of the interaction partners of anti-apoptotic BAG-1M isoform in breast cancer and breast epithelial cells
Anti-apoptotik BAG-1M izoformunun etkileşim partnerlerinin meme kanseri ve meme epitel hücrelerinde tanımlanması
NİSAN DENİZCE CAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Keçi (Carpa hircus) testislerinde ısı şok proteini 70 (HSP70)'in immunohistokimyasal lokalizasyonu
Immunohistochemical localization of heat shock protein 70 (HSP 70) in goat (Carpa hircus) testes
CANSEL DURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Histoloji ve EmbriyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KENAN ÇINAR