Cloning, expression and purification of recombinant elongation factor ts from hyperthermophilic bacteria geobacillus anatolicus
Hipertermofilik geobacillus anatolicus bakterilerinden rekombinant elongasyon faktörü Ts'nin klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması
- Tez No: 181238
- Danışmanlar: PROF. DR. NEŞE BİLGİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Mikrobiyoloji, Bioengineering, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Geobacillus anatolicus elongasyon faktörü Ts His kuyruklu bir rekombinant proteinolarak Escherichia coli içerisinde klonlanmış, ekpresyonu yapılmış ve saflaştırılmıştır. Buçalışmanın ilk adımı Geobacillus anatolicus tsf geninin nükleik asit dizisininbelirlenmesidir. Bu amaç için, Geobacillus anatolicus'a filogenetik olarak en yakınbakterilerin tsf ve tsf'ye komşu genleri kullanılarak tsf genini taşıyan kromozomal bölgeninçoğaltılması amacıyla uygun oligonükleotit primerleri tasarlanmıştır. Daha sonra, bu dizibilgisi kullanılarak, C terminal bölgesinde 6 ek Histidin amino asiti olan tam tsf geniniuygun bir ekspresyon vektörüne klonlamak amacıyla uygun primerler tasarlanmıştır. Buekspresyon vektörü, proteinin Escherichia coli içinde yüksek miktarda ekspresyonununsağlanması için kullanılmış ve proteinin saflaştırılması yapılmıştır. Rekombinant proteinihomojen bir şekilde saflaştırabilmek amacıyla Ni-afinite kromatografisi kullanılmıştır.Geobacillus anatolicus EF-Ts proteininin Escherichia coli EF-Tu proteinine bağlanmadatam olarak aktif olduğu bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
Elongation factor EF-Ts from Geobacillus anatolicus was cloned, expressed andpurifed as a His-tagged recombinant protein in Escherichia coli. The first step in this studywas the determination of the nucleic acid sequence of the tsf gene of Geobacillusanatolicus. In order to achive this first goal, sequence data for the tsf gene and theneighbouring genes of the the bacteria phylogenetically related to Geobacillus anatolicuswere used to design the appropriate oligonucleotide primers to amplify the chromosomalregion carrying the tsf gene. This sequence information was then used to design primers toclone the complete tsf gene including 6 additional histidine residues at its C-terminal intoan appropriate expression vector. This vector was used to express and purify the protein inhigh quantities in Escherichia coli. Ni-affinity chromotography was then used to purify therecombinant protein to homogeneity. Geobacillus anatolicus EF-Ts was found out to befully active in binding Escherichia coli EF-Tu.
Benzer Tezler
- Cloning, expression and purification of recombinant elongation factor tu from hyperthermophilic bacteria geobacillus anatolicus
Hipertermofilik geobacillus anatolicus bakterilerinden rekombinant elongasyon faktörü tu'nun klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması
BARIŞ AKALIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2006
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE BİLGİN
- Transgenik tütünde CRISPR/CAS9 sistemi kullanılarak sistein proteaz gen (NtCP6) ekspresyonunun susturulmasına yönelik çalışmalar
Studies for silencing the protease gen (NtCP6) expression by using CRISPR/CAS9 system in transgenic tobacco
ÇİĞDEM BOZKURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATMA İNCİ ÖZDEMİR
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
- Cloning, expression and purification of the recombinant DNA polymerase I from the hyperthermophilic bacteria Geobacillus anatolicus
Hipertermofilik Geobacillus anatolicus bakterilerinde rekombinant DNA polimeraz I'in klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması
MELİKE ÇAĞLAYAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Tıbbi BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. NEŞE BİLGİN
- Cloning, heterologous expression and purification of PHI 29 DNA polymerase variants
PHI 29 DNA polimeraz türevlerinin klonlanması, heterolog ekspresyonu ve saflaştırılması
FATMA ARAS
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURAN DEVECİ AKSOY
- İnsan karbonik anhidraz VII enzim geninin eE coli'de klonlanması, ekspresyonu, rekombinant enzimin saflaştırılması, karakterizasyonu ve bazı antibiyotiklerin bu enzim aktivitesi üzerine etkilerinin incelenmesi
Cloning and expression of human carbonic anhydrase VII gene in E. coli, purification, characterization of recombinant enzyme and investigation of some antibiotics effects on enzyme activity
HATİCE ESRA ASLAN