Fare genomunda bulunan karbonik anhidraz izoenzim ve karboksilaz enzim genlerinin cDNA'larının üretilmesi, antisens mRNA sentezi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA production, antisens mRNA synthesis and gen expression analysis of carbonic anhdrase izoenzyme and carboxylase enzyme genes in mouse genome by in situ hybridization
- Tez No: 181495
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. ŞÜKRÜ BEYDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: n situ hibridizasyon, gen ekspresyonu, karbonik anhidraz, karboksilaz, In situ hybridization, gene expression, carbonic anhydrase, carboxylase
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 163
Özet
Hayvan genomunda bulunan genlerin büyük çoğunluğunun sekanslarınınbulunması, biyolojik düzenlenmenin temelini teşkil eden kompleks genetik ve proteinetkileşmelerini araştırma imkanlarına neden olmuştur. Gen ekspresyon örnekleri, RNAin situ hibridizasyonu ile kolaylıkla belirlenebilir. RNA in situ hibridizasyonuvasıtasıyla elde edilen gen ekspresyon verilerinin otomatik mikroskobik taranması içinbilgisayar programı oluşturulmuştur. Bu çalışmada karbonik anhidraz izoenzim vekarboksilaz enzim genleri (Car1, Car2, Car3, Car4, Car5a, Car5b, Car6, Car7, Car8,Car9, Car10, Car11, Car12, Car13, Car14, Car15, Acaca, Acacb, Pcx, Pcca, Pccb,Mccc1, Mccc2, Ggcx, Paics) seçildi. Bu genler için spesifik primerler dizayn edildi.Spesifik primerler kullanılarak cDNA kalıpları hazırlandı ve kalıplardan antisensmRNA'lar (in vitro transkripsiyon) sentezlendi. Antisens mRNA'ların;14,5 günlük fareembriyosunda in situ hibridizasyonu yapıldı. Sonuç alınan genler için ekspresyonharitaları mikroskopta incelenerek internet ortamına aktarıldı (www.genepaint.org ).2006, 152 sayfa
Özet (Çeviri)
The availability of sequence data for many of the genes present in animal genomes,opens up opportunities to study complex genetic and protein interactions that underlie biologicalregulations. Gene expression patterns can readily be determined by RNA in situ hybridization.There are automatical systems that allow the determination and visualization of gene expressionpatterns on different tissues. In addition, computer programme was founded for microscopicscanning of gene expression datas obtained by in situ hybridization. In the present study, geneexpression analysis of carbonic anhydrase isoenzyme and carboxylase enzyme genes present inmouse genome was carried out using an automatic robotic system by in situ hybridization in14.5 days old mouse embryo. Specific primers were arranged for these genes. Specific cDNAtemplates were prepared with these specific primers. Antisense mRNAs (in vitro transcription)were produced with spesific cDNA templates. In situ hybridization in which was used theseantisense mRNAs on mouse embryo (14.5 days) was made. Automated microscopic scanning ofgene expression data for carbonic anhydrase isoenzyme and carboxylase enzyme genes wasinvestigated and these results were transfered with software in internet (www.genepaint.org ).2006, 152 pages
Benzer Tezler
- Fare genomunda bulunan bazı glikoliz yolu genlerinin cDNA''larının üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve İn Situ hibridizasyon ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some glycolysis patway genes in mouse genome, production of antisens mRNA and gen expression analysis by In Situ hybridization
MURAT ÇANKAYA
- Fare genomunda bulunan bazı oksidatif fosforilasyon yolu enzimleri ve bazı antioksidan enzim genlerinin cDNA'ların üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve in situ hibridizasyon ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some antioxidant and oxidative phosphorlytion patway genes in mouse genome, production of antisense mRNA and gen expression analysis by in situ hybridization
VEYSEL ÇOMAKLI
- Fare genomunda bulunan bazı TCA devri enzim genlerinin cDNA'larının üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some TCA cycle enzyme genes in mouse genome, production of antisense mRNA and gene expression analysis by in situ hybridization
HARUN BUDAK
- Fare genomunda bulunan glutamat metabolizması genlerinin cDNA'larının üretilmesi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA?s production of glutamate metabolism genes in mouse genome and analysis of gen expression by in situ hybridization
MURAT ÇANKAYA
- Fare genomunda bulunan ve glikojen yıkımında görev alan enzim genlerinin cDNA'larının üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve in situ hibridizasyonu ile gen ekspresyon analizi
cDNA's production of some enzyme genes of glycogen catabolism in mouse genome, production of antisens mRNA and gen expression analysis by in situ hybridization
MÜSLÜM KUZU
