Model zar-yüzey aktif etkileşmelerinin elektron paramanyetik rezonans (EPR) spin etiketleme tekniği ile incelenmesi
The investigation of model membrane-surfactant interactions by electron paramagnetic resonance (EPR) spin labeling technique
- Tez No: 182425
- Danışmanlar: PROF.DR. MÜBERRA MARAL SÜNNETÇİOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Fizik ve Fizik Mühendisliği, Biophysics, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 96
Özet
Bu çalışmada model zar-yüzey aktif etkileşmeleri EPR spin etiketleme tekniği ilespin etiketi olarak 4-amino-2,2,6,6-tetramethyl-1-piperidinyloxy (TEMPAMINE), 4-hydroxy-2,2,6,6-tetramethyl-1-piperidinyloxy (TANOL), 3-carbomoyl-2,2,5,5-tetramethyl-3-pyrrolin-1-yloxy (TEMPYO) ve 2-(14-carboxytetradecyl)-2-ethyl-4,4-dimethyl oxazolydine-3-oxyl (16-DSA) nitroksit kararlı kökçeleri kullanılarakincelenmiştir. Model zar olarak dimyristoylphosphatidylcholine (DMPC), yüzey aktifolarak sodium dodecyl sulfate (SDS) ve lithium dodecyl sulfate (LiDS)kullanılmıştır. Çalışılan örneklerde, spin etiketlerin dönme ilgi zamanları ve aşırıince yapı sabitlerinin yüzey aktif derişimi ile değişimleri bilgisayar programlarıkullanılarak yapılan tek bölgeli benzeştirme sonucunda bulunmuştur.TEMPAMINE, 16-DSA spin etiketlerinin yapının farklı bölgelerinden bilgi verdiğispektrumların doğrudan değerlendirilmesi ve tek bölgeli benzeştirmeler sonucundabelirlenmiştir. TEMPAMINE için bölge yüzdeleri iki bölgeli benzeştirme ilebulunmuştur. TEMPYO ve TANOL spin etiketlerinin tampon, zar ve SDSbölgelerindeki paylaşımlarının ise artan SDS derişimi ile değişmediği ve aNdeğerlerinin fosfat tampon bölgesine yakın kaldığı gözlenmiştir.Anahtar Kelimeler : EPR, nitroksitler, zarlar, yüzey aktifler, ilgi zamanı.Danışman: Prof.Dr. M. Maral Sünnetçioğlu, Hacettepe Üniversitesi, FizikMühendisliği Anabilim Dalı.i
Özet (Çeviri)
In this study, model membrane-surfactant interactions were investigated by EPRspin labeling technique using 4-amino-2,2,6,6-tetramethyl-1-piperidinyloxy(TEMPAMINE), 4-hydroxy-2,2,6,6-tetramethyl-1-piperidinyloxy (TANOL), 3-carbomoyl-2,2,5,5-tetramethyl-3-pyrrolin-1-yloxy (TEMPYO) and 2-(14-carboxytetradecyl)-2-ethyl-4,4-dimethyl oxazolydine-3-oxyl (16-DSA) nitroxide freeradicals as spin labels. Dimyristoylphosphatidylcholine (DMPC) was used asmodel membrane, sodium dodecyl sulfate (SDS) and lithium dodecyl sulfate(LiDS) were used as surfactants. For the studied sample groups, using singledomain simulation program, the rotational correlation times (Ï) and nitrogenhyperfine splitting constants (aN) of spin labels were calculated against surfactantconcentration. As a result of direct evaluations and single domain simulations itwas shown that TEMPAMINE, 16-DSA spin labels give information from differentdomains of sample. The percentages of domains for TEMPAMINE were obtainedby double domain simulations. The partitition of TEMPYO and TANOL spin labelsin buffer, membrane and SDS was observed to remain approximately same withincreasing SDS concentration. aN values were remained close to buffer?s.Key Words : EPR, nitroxides, membranes, surfactants, correlation time.Advisor: Prof.Dr. M. Maral Sünnetçioğlu, Hacettepe University, PhysicsEngineering Department.ii
Benzer Tezler
- Membrane protein-based in vitro methods
Zar protein-tabanlı in vitro metotlar
FATİH İNCİ
Doktora
İngilizce
2013
Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA NEŞE KÖK
- Three dimensional simulation of fluid structure interactions for red blood cells
Kırmızı kan hücreleri için üç boyutlu akışkan yapı etkileşimi simülasyonu
AYŞE ÇETİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Uçak Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiUçak ve Uzay Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ŞAHİN
- Designing and in vivo evaluation of microemulsion formulation containing capsaicin for the treatment of neuropathic pain
Nöropatik ağrinin tedavisi için kapsaisin içeren mikroemülsiyon formülasyonunun tasarimi ve in vivo değerlendirilmesi
RUMOOZ SHAYYAH
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Eczacılık ve FarmakolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FAZİLET AKSU
DR. ÖĞR. ÜYESİ UMAY MERVE GÜVEN
- Gravity on brane worlds
Zar dünya üzerinde gravitasyon
AHMET EMİR GÜMRÜKÇÜOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİKRAM ALİEV
DOÇ. DR. NEŞE ÖZDEMİR
- Düzensiz maddelerin elektronik yapılarının yeni bir teknikle hesaplanması
Calculation of the electronic structure of disordered systems by a new technique
CENGİZ TATAR
Doktora
Türkçe
2002
Fizik ve Fizik MühendisliğiFırat ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ABDÜLKADİR YILDIZ