Bazı Alkanna türlerinin ekstre ve fraksiyonlarının DNA topoizomeraz I inhibisyonu üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation on DNA topoisomerase I inhibition effects of the extracts and fractions of some Alkanna species
- Tez No: 182595
- Danışmanlar: DOÇ.DR. ERDAL BEDİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Eczacılık ve Farmakoloji, Moleküler Tıp, Bioengineering, Pharmacy and Pharmacology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Alkanna, Boraginaceae, Biyoaktivite Rehberli Fraksiyonlama, DNA Topoizomeraz I nhibisyonu, Sitotoksisite, MTT, Alkanna, Boraginaceae, Bioassay Guided Fractionation, DNATopoisomerase I nhibition, Cytotoxicity, MTT
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 161
Özet
Bu çalı mada, Alkanna türleri metanolik ekstrelerinin (A. tubulosa, A.cordifolia, A. tinctoria, A. hirsutissima, A. orientalis), MTT testi kullanılarak 5 kanser(K-562, MCF-7, HL-60, SaOs-2, Hep-3B) ve 2 normal hücre hattına kar ı (L929,Vero) sitotoksik etki taramaları yapılmı tır. Yüksek sitotoksisite gösteren Alkannatürleri, süper sarmal plazmid DNA gev eme testi ile DNA Topoizomeraz I inhibisyonpotansiyelleri de erlendirilmi tir. Türler arasında A. cordifolia 8 µG/mL'den 32µG/mL'ye kadar artan dozlarda kültüre hücre hatlarına kar ı inhibisyon etkisigöstermi tir. Önemli sitotoksisite ve DNA topoizomeraz I inhibisyonu gösteren A.cordifolia, ileri izolasyon için seçilmi tir. Ön fraksiyonlamada A. cordifolia metanolikekstresi, optimum fraksiyonlama sistemini belirlemek amacıyla farklı stasyoner fazlarda(Silika jel, Kar ıt faz-C18 and Sephadex LH-20) Açık Kolon Kromatografisi veVakum Sıvı Kromatografisi'ne uygulanmı tır. Silika jel kolondan S2, S9, S10 ve Kar ıtfaz-C18'den RP5, RP6, RP7, RP8 fraksiyonları, 10 ng/mL konsantrasyonda güçlü DNAtopoizomeraz I inhibisyonu gösterirken, Sephadex LH-20'den elde edilen SF2fraksiyonu inhibitör aktivite sergilememi tir.Büyük ölçekli fraksiyonlama, normal faz silika jel kullanılarak, Biotage SP-2Yüksek Performans Fla Kromatografi'de gerçekle tirilmi tir. Çünkü aktif fraksiyonlar,silika jel ile iyi bir da ılım göstermi tir. Biotage Fla Kromatografi'den .T.K.profillerine göre 27 alt fraksiyona ayrılan 536 fraksiyon toplanmı tır. 69-80; 81-91; 92-110 arası fraksiyonlar ve hekzan ekstresi, 10 ng/mL konsantrasyonda aktif bulunmuiken, 1 ng/mL seviyesinde DNA topoizomeraz I inhibisyonu gözlenmemi tir.
Özet (Çeviri)
In this study, methanolic extracts of the Alkanna species (A. tubulosa, A.cordifolia, A. tinctoria, A. hirsutissima, A. orientalis) were screened for cytotoxicactivity against 5 cancer cell lines (K-562, MCF-7, HL-60, SaOs-2, Hep-3B) togetherwith 2 normal cell lines (L929, Vero) by using MTT Test. Alkanna species whichexhibited promising cytotoxicity were evaluated for their DNA topoisomerase Iinhibition potentials by means of Supercoil Plasmid DNA Relaxation Assay. Among thespecies, A. cordifolia has shown inhibition effect against cultured cell lines at the dosesranging from 8 µG/mL to 32 µG/mL. A. cordifolia exerting significant cytotoxicityand DNA topoisomerase I inhibition was selected for further purification. Inpreliminary fractionation, methanolic extract of A. cordifolia was subjected to differentstationary phases (Silica gel, RP-C18 and Sephadex LH-20) by using Open ColumnChromatography and Vacuum Liquid Chromatography (VLC) to determine optimumfractionation system. Fractions S2, S9, S10 from silica gel column and RP5, RP6, RP7,RP8 obtained from RP-C18 exhibited strong DNA topoisomerase I inhibition at 10ng/mL concentration, whereas SF2 obtained from Sephadex LH-20 showed noinhibitory activity.Since the active fractions were spread out well by silica gel, scale-upfractionation was performed on Biotage SP-2 High Performance Flash Chromatographyby using normal phase silica gel. Biotage Flash Chromatography yielded total of 536fractions which were pooled into 27 subfractions based on their Thin LayerChromatography profiles. Fractions 69-80; 81-91; 92-110 and hexane extract wereactive at 10 ng/mL while no DNA topoisomerase I inhibition was observed at 1 ng/mL.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yetişen bazı bitki türlerinin antimikrobiyal ve antioksidan özelliklerinin incelenmesi
The investigation of antimicrobial and antioxidant properties of some plant species growing in turkey
İREM YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BotanikAnadolu ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYHAN ALTINTAŞ
- Bazı Alkanna türlerinin biyoaktivite rehberli izolasyon yöntemi kullanarak çeşitli kanser hücreleri üzerindeki sitotoksik etkilerinin in vitro ortamlarda taranarak, hücresel mekanizmalara ve apoptoz yolaklarına olan etkilerinin araştırılması
Research on cytotoxic effects of some alkanna species on various tumor cell lines by using boiassay guided isolation method and in vitro screening: Effects of these species on cellular mechanisms and apoptotic pathways
CANAN SEVİMLİ GÜR
Doktora
Türkçe
2009
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KEMAL SAMİ KORKMAZ
PROF. DR. İSMET DELİLOĞLU GÜRHAN
- Bazı Alkanna türlerinin biyoaktivite rehberli izolasyon yöntemi kullanılarak çeşitli kanser hücreleri üzerindeki sitotoksik etkilerinin in vitro ortamda taranması
In vitro screening of cytotoxic effects of some Alkanna species on various cancer cell lines by using bioassay-guided isolation
ŞEBNEM BIÇKICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ERDAL BEDİR
- Alkanna sieheana ve a. orientalis var. Orientalis türlerinin in vitro kültürü, antioksidan aktiviteleri ile bazı sekonder metabolitlerin incelenmesi
In vitro culture, antioxidant activity and determination of some secondery metabolites in alkanna sieheana and a. Orientalis var. orientalis
CENNET YAMAN
- Studies on herbal dye formulations
Bitkisel boya formülasyonları üzerinde çalışmalar
BEYZA DOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Eczacılık ve FarmakolojiYeditepe ÜniversitesiKozmetoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDEM YEŞİLADA
YRD. DOÇ. DR. GÜLENGÜL DUMAN