Peptid protein kovalent konjugasyonu
Peptide protein covalent conjugation
- Tez No: 182632
- Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. ZEYNEP AKDESTE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Peptid, Protein, BSA, Kovalent Bağlanma, Karbodiimid, EDC, Peptide, Protein, BSA, Covalent Coupling, Carbodiimide, EDC
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 155
Özet
Peptidlerin taşıyıcı proteinlere bağlanması, zayıf immunojenik özellikteki peptidlere karşı antikoroluşturmak için gerekmektedir. Sulu çözeltideki moleküllerin karboksil gruplarının aktivasyonu veaktive olmuş karboksil gruplarına amino gruplarının kovalent bağlanması, bu tez çalışmamızın konusuolan globular yapıdaki protein ile sentetik peptidlerin konjugasyon reaksiyonunun temelinioluşturmaktadır.Karbodiimidler heterobifonksiyonel özellikteki direkt (zero-length) çapraz bağlama reaktifleridir vekarboksil gruplarının amino gruplarına bağlanmasında kullanılırlar. Bu tez çalışmamızda karbodiimidyöntemi ile suda çözünen 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil) karbodiimid hidroklorid (EDC) kullanılarak,Peptid-Protein konjugatları hazırlandı. Konjugasyonda bir protein molekülü için peptidin farklıoranları (npeptid/nBSA) ile çalışıldı ve bu orantılara ait biyokonjugatlar sentezlendi. Sentezlenmişbiyokonjugatlar farklı kolonlardan geçirilerek saflaştırıldı.Saflaştırılan biyokonjugatların; sentetik peptid, BSA ve BSA-sentetik peptid fiziki karışımları ilekarşılaştırmalı olarak karakterizasyonu ve bağlanma mekanizmasının incelenmesi, HPLC, GPC-VISCOTEK (Gel Permeation Chromatography; UV, Refraktif ndeks, Vizkozite ve Işık SaçılmasıDetektörlerine Sahip Kromatografik Sistem), Fluoresans Spektrofotometre ve Zetasizer (Partikülboyutu ve Zeta Potansiyel ölçümü için) cihazları kullanılarak gerçekleştirildi. Fiziko-kimyasal analizsonuçlarına dayanarak globular BSA moleküllerinin lineer yapılı peptid molekülleri ile kovalentbağlanması sonucu elde edilen biyokonjugatların oluşum mekanizması, elektrik yükü ve üç boyutluyapısı incelenmiştir.
Özet (Çeviri)
Coupling of the peptides to carrier protein is required to producing of anti-peptide antikor which areweak immunogenic peptides. In aqueuos solution carboxyl grups activation and binding the aminogroups to activated carboxyl group with covalent bond is formed our thesis main subject?sfundamental which is conjugation of globular proteins with synthetic peptides.Carbodiimides are heterobifonctional (zero-length) cross linkers reagents and used for coupling ofcarboxyl groups and amino groups. In this thesis study we prepare Peptide-Protein conjugates whitcarbodiimide method by using 1-ethyl -3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide hydrochloride. Forconjugation we study with different ratio of peptides for one protein molecule (npeptid/nBSA) andsynthesed the conjugates for this ratio. Conjugates are purified by using different column .Purified conjugates are characterized and the mechanism of the binding process is investigatedcomparatively with synthetic peptide, BSA and BSA-synthetic peptide physical mixture by HPLC,GPC-VISCOTEK (Gel Permeation Chromatography, The system has UV, Refractive Index,Viscometer and Right Angle Light Scattering detectors), Fluoresans Spectrophotometer, Zetasizer (Z-Ave, Zeta Potential). Formation mechanism, electrical charge and three dimensional structure ofbioconjugates are investigated based on physicochemical analysis results.
Benzer Tezler
- Biyohibrid yapılı ve biyotaklitçi polimer-peptid konjugatlarının geliştirilmesi
Improving of biohybrid and biomimicking polymer-peptide conjugates
BANU MANSUROĞLU
- Melanoma hastalığını oluşturan sentetik peptidlerin poliakrilikasit ve kopolimerleri ile konjugasyonu
Conjugation of melanoma based synthetic peptides with polyacrylic acid and their copolymers
KADRİYE KIZILBEY
Doktora
Türkçe
2012
BiyokimyaYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP MUSTAFAEVA AKDESTE
- Alzheimer amiloid beta peptidine ait farklı amino asid dizilerinin polielektrolitler ile konjugasyon reaksiyonlarının incelenmesi
Investigating conjugation reactions between different alzheimer's amyloid beta peptide sequences with polyelectrolytes
BAŞAK İŞCANI EROĞLU
Doktora
Türkçe
2014
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP AKDESTE
- Influenza A tanısına yönelik IgY antikoruna dayalı ELISA yönteminin geliştirilmesi
Development of ELISA method based on IgY antibody for influenza A diagnosis
BÜŞRA ÖZKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. RABİA ÇAKIR KOÇ
DR. YASEMİN BUDAMA KILINÇ
- Targeting bag-1S/C-raf interaction for therapeutic intervention in cancer
Bag-1S/C-raf etkileşiminin kanserde terapötik bir yaklaşım olarak kullanılmak üzere hedeflenmesi
ÖZGE TATLI
Doktora
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY