Fenoksazin yapılı bazı boyaların plazma alfa-1-asit glikoprotein'ine bağlanma özelliklerinin incelenmesi
Binding properties of some phenoxazine dyes to plasma alpha-1-acid glycoprotein
- Tez No: 192608
- Danışmanlar: PROF.DR. A. NİLGÜN SÜMER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Eczacılık ve Farmakoloji, Kimya, Biochemistry, Pharmacy and Pharmacology, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Fenoksazin boyalar, Alfa-1-asit glikoprotein, saflaştırma, fisetin, bağlanma stokiyometrisi.Detekleyen Kurumlar: Tübitak S.B.A.G, Tez Destekleme (SBAG-HD-3 105S006), Phenoxazine dyes, Alpha-1-acid glycoprotein, purification, fisetin, binding stochiometry
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
ÖZETUlutaş F., Fenoksazin Yapılı Bazı Boyaların Plazma Alfa-1-AsitGlikoprotein'ine Bağlanma Özelliklerinin ncelenmesi, Hacettepe ÜniversitesiSağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya Programı Bilim Uzmanlığı Tezi, Ankara,2005. Bu çalışmada H.Ü. Hastanesi Kan Bankasından sağlanan insan plazmasındanalfa-1- asit glikoprotein (AAG) Cibacron Mavisi F3GA kolonu kullanılarak affinitekromotografisi yöntemi ile saflaştırıldı (SAAG). Saflık, sodyum dodesil sülfatpoliakrilamid jel elektroforezi ile (SDS-PAGE) ile doğrulandı. Fenoksazinboyalardan nil kırmızısı (NK) ve nil mavisinin (NM) ve bir bitkisel flavonoid olanfisetinin, SAAG ve ticari AAG'e bağlanma özellikleri fluorimetrik titrasyon yöntemiile incelendi. AAG'in NK ile fluorimetrik titrasyon çalışmalarında, elde edilenveriler ile sağlıklı bir değerlendirme yapılamadı. Ticari AAG'in NM ile fluorimetriktitrasyonunda Kd (disosiyasyon sabiti) 0,58 ± 0,04 µM, bağlanma stokiyometrisi, n =0,28 ± 0,03 bulundu. SAAG ile yapılan çalışmada da benzer sonuçlar elde edildi (Kd= 0,52 ± 0,04 µM, n = 0,32 ± 0,02). Ticari AAG'in, diyaliz öncesi ve sonrası, fisetinile titrasyon çalışmalarında bağlanma stokiyometrisi sırasıyla, 0,13 ± 0,01 ve 0,22 ±0,02 bulundu. Kd değerlerinde ise belirgin bir farklılık gözlenmedi (Kd = 0,37 ±0,04). Ticari AAG'in diyaliz öncesi ve sonrası NM ile titrasyon çalışmalarında isebağlanma stokiyometrisi sırasıyla 0,28 ± 0,03 ve 0,47 ± 0,05 bulundu. Kd değerininise diyaliz sonrası düştüğü ( 0,25 ± 0,01) gözlendi.Bu bulgular ışığında AAG'e bağlanma özellikleri incelenen NM ve fisetin ilegözlenen düşük stokiyometri değerlerinin, büyük bir olasılıkla endojen ligantetkisinden ziyade AAG preparatlarının heterojenitesinden kaynaklandığı düşünüldü.
Özet (Çeviri)
ABSTRACTUlutaş F., nvestigation of Binding Properties of Some Phenoxazine Dyes toPlasma Alpha-1-Acid Glycoprotein, Hacettepe University Institute of HealthSciences, Master of Science Thesis in Biochemistry, Ankara, 2005. Alpha-1-acidglycoprotein (AAG) was purifed from human plasma obtained from HacettepeUniversity Hospitals Blood Bank by Cibacron blue F3GA affinity chromatogropy(SAAG). Purity was approved by sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gelelectorphoresis (SDS-PAGE). Binding properties of nile red (NK) and Nile blue(NB) as phenoxazine dyes and fisetin as herbal flavonoid to SAAG and commercialyavaible AAG were determined by flourometric titration assays. From the datas offluorometric titration assays of NK we couldn?t evaluate exact estimations. In thefluorometric titration assay of commercialy avaible AAG with NB Kd (dissociationconstant) and binding stochiometry (n) were calculated as Kd = 0,58 ± 0,04 µM andn = 0,28 ± 0,03 respectively. Similar findings were obtained in the assay of SAAG(Kd = 0,52 ± 0,04.µM, n = 0,32 ± 0,02 ). From the titration assays of commercialyavailable AAG with fisetin before and after dialysis binding stochiometries weredetermined as 0,13 ± 0,01 and 0,22 ± 0,02 respectively, and, dissociation constantswere not changed (Kd = 0,37 ± 0,04). From the titration assays of commercialyavailable AAG with NB before and after dialysis binding stochiometries weredetermined as 0,28 ± 0,03 and 0,47 ± 0,05 respectively, and, lower value ofdissociation constant (0,25 ± 0,01) was obtained after dialysis. These findingssuggested that, low stochiometric values which were determined in NB and Fisetinarrays arise from heterogenity of preperation rather than the effect of endogenousligand.
Benzer Tezler
- Photoinitiated metal-free controlled/living radical polymerization using polynuclear aromatic hydrocarbons
Polinükleer aromatik bileşikler kullanarak ışıkla başlatılmış metal içermeyen atom transfer radikal polimerizasyonu
ANDRIT ALLUSHI
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF YAĞCI
- Triarilmetan ve fenoksazin yapılı boyaların plazma kolinesterazına etkisi
The effect of triarylmethane and phenoxazine dyes on human plasma cholinesterase
TUBA TÜYLÜ KÜÇÜKKILINÇ
- Kolinesterazlarda yapı-katalitik etki ilişkisinin triarilmetan ve fenoksazin yapılı ligandlar aracılığıyla araştırılması
The study of structure-effect relations in cholinesterases by use of triarylmethane and phenoxazine dyes
ZEKİYE TUBA TÜYLÜ KÜÇÜKKILINÇ
- Fenoksazin ve fenotiyazin yapılı ligandların insan bütirilkolinesterazına bağlanma noktalarının bölge yönelimli mutagenez yöntemi ile araştırılması.
Investigation of binding sites of phenoxazine and phenothiazine structured ligands on human butyrylcholinesterase by site-directed mutagenesis.
ZEYNEP SEZGİN
- Triarilmetan, fenoksazin ve fenotiyazin yapılı bileşiklerin insan eritrosit asetilkolinesteraz ve at plazma bütirilkolinesteraz aktivitesi üzerine etkileri
The effects of triarylmethane, phenoxazine and phenothiazine compounds on human erythrocyte acetylcholinesterase and horse serum butyrylcholinesterase
YASEMİN YÜCEL YÜCEL
