Akut ve kronik lösemili (AML, KML) ve myelodisplastik sendromlu (MDS) hastalardanup98-hox genlerinin oluşturduğu kimerik genlerin mrna ürünlerinin saptanması
Detection of mrna products which are products of chimeric genes occured by translocation between hox and nup98 genes in patients diagnosed as having acut/chronic leukemia (AML, CML) and myelodisplastic syndrome (MDS)
- Tez No: 193217
- Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. OGÜN SERCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Hematoloji, Moleküler Tıp, Tıbbi Biyoloji, Hematology, Molecular Medicine, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Leukemia, translocation, NUP98, HOX, DDX10, chimeric gene, RT-PCR
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 52
Özet
ÖZETAKUT VE KRON K LÖSEM L (AML,KML) VE MYELOD SPLAST K SENDROMLU(MDS) HASTALARDA NUP98-HOX GENLER N N OLUŞTURDUĞU K MER KGENLER N mRNA ÜRÜNLER N N SAPTANMASIGizem AYNAnsan lösemilerinde NUP98 geninin, translokasyonlar sonucunda kimerik genoluşturduğu pekçok gen bulunmaktadır. Tez kapsamında Dokuz Eylül Tıp FakültesiHastanesi, çevre iller ve zmir içindeki diğer hastanelerden laboratuarımıza gelen lösemi,myelodisplastik sendrom (MDS) ve myeloproliferatif hastalık (MPH) ön tanılı hastalarınkemik iliği örneklerinde NUP98'in homeobox genleri (HOXA9, HOXA11, HOXA13,HOXC11, HOXC13, HOXD11, HOXD13) ve RNA helikaz enzimini kodlayan (DDX10) geniile birlikte meydana getirdiği füzyon ürünlerinin varlığı araştırıldı. Hastaların kemik iliğiörneklerinden toplam RNA ekstraksiyonu yapıldıktan sonra RNA'lar komplementer DNA'ya(cDNA) çevrildi. β-aktin geni internal kontrol olarak kullanıldı. Hastaların cDNA örneklerikullanılarak yapılan RT-PCR deneyleri sonucunda, çalışılan tüm hastalarda β-aktin gen ürünüsaptandı. Hedeflenen genlerin varlığını araştırmak üzere literatürden araştırılarak 17 adetprimer ısmarlandı ve bu primerler kullanılarak cDNA örnekleri RT-PCR yöntemikullanılarak çoğaltıldı. NUP98-HOX genlerinin ürünlerinin tarandığı 34 hastada ve NUP98-DDX10 geninin ürününün tarandığı 30 hastada füzyon transkriptlerine rastlanmadı.Anahtar Kelimer: Lösemi, translokasyon, NUP98, HOX, DDX10, kimerik gen, RT-PCR.
Özet (Çeviri)
SUMMARYDETECTION of mRNA PRODUCTS WHICH ARE PRODUCTS OF CHIMERIC GENESOCCURED BY TRANSLOCATION BETWEEN HOX AND NUP98 GENES INPATIENTS DIAGNOSED AS HAVING ACUTE/CHRONIC LEUKEMIA (AML,CML,)and MYELODISPLASTIC SYNDROME (MDS)Gizem AYNAAs a results of chromosomal translocations, NUP98 and various partner genes wereshown to form fusion products in human leukemias. Bone marrow samples of leukemia,myelodysplastic sendrome (MDS), and myeloproliferative disease (MPD) patients , sent toour laboratuary from the Dokuz Eylul University hospital and other hospitals in zmir, wereused in this study. The presence of NUP98- HOX (HOXA9, HOXA11, HOXA13, HOXC11,HOXC13, HOXD11, HOXD13) fusion products as well as NUP98-DDX10 fusion productswere investigated. Cellular total RNA was extracted from the bone marrow mononuclear cellsand complementer DNA reaction was set up to obtain double strand DNA. The Ã-actin geneproduct was used as internal control. The cDNA products were amplified by PCR using 17different primer sets selected from medical literature.The Ã-actin internal control was foundpositive in all reactions.In conclusion, NUP98-HOX fusion gene products were found to be negative in 34patients tested while the NUP98-DDX10 products were negative in the total of 30 patientstested.
Benzer Tezler
- Hematolojik malign hastalıklarda high resolution bantlama tekniği kullanılarak sitogenetik anomalilerin değerlendirilmesi
Evaluation of cytogenetic anomalies with high resolution banding technique in haematologic malignancies
AYŞEGÜL BAYRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞÜKRÜ PALANDUZ
- Akut ve kronik lösemili olguların eritrosit ile lökosit süperoksit dismutaz enzim düzeylerinin karşılaştırılması
The Comparison of erythrocytes and leukocytes superoxide dismutase enzyme levels in the patients with acute and chronic leukemia
ŞULE SULTAN MENZİLETOĞLU
- Akut ve kronik lösemili hastalarda kemik iliği biyopsisi retiküler lif derecesi değişiminin prognostik faktörler ile olan ilişkisinin değerlendirilmesi
The evaluation of the relationship between variation of bone marrow biopsy reticulin fiber degree and prognostic factors in acute and chronic leukemias
DEMİRCAN ÖZBALCI
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2011
HematolojiCelal Bayar Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÜLKÜ ERGENE
- Akut ve kronik miyeloid lösemilerde killer cell immunoglobulin-like reseptör genotip analizi
Analysis of killer imminoglobulin-like receptor genotypes in the acute and chronic myeloid leukaemia
MERVE ERKOÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
HematolojiÇukurova Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL GÜRKAN
- Akut ve kronik lösemili hastalarda eritrosit içi süperoksit dismutaz, glutatyon perosidaz ve katalaz aktivitelerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
İSMALİ ÇETİN ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1996
Biyokimyaİnönü ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENGİN M. GÖZÜKARA