Rutin laboratuvarımızda izole edilen E.coli, K. pneumoniae ve E. cloacae kökenlerinde yeni bir geniş spektrumlu beta laktamaz IBC-1'in fenotipik ve genotipik yöntemlerle saptanması
Detection of a novel extended spectrum beta lactamase IBC-1 by phenotypic and genotypic methods in E.coli, K.pneumoniae and E. cloacae clinical strains
- Tez No: 193536
- Danışmanlar: DOÇ.DR. UFUK HASDEMİR, PROF.DR. GÜNER SÖYLETİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: E.coli, K.pneumoniae, E. cloacae, Genişlemiş Spektrumlu BetaLaktamaz, IBC-1.1, E.coli, K.pneumoniae, E. cloacae, Extended Spectrum Beta Lactamases, IBC-1.1
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
ÖZETGram negatif çomaklarda beta laktam antibiyotiklere karşı gelişendirençten sıklıkla sorumlu tutulan genişlemiş spektrumlu beta laktamazlar (GSBL) tümsefalosporinleri ve monobaktamları hidroliz edebilen enzimlerdir. Bu çalışmanın amacı,çoklu antibiyotik direncinden sorumlu tutulan, TEM, SHV ve CTX-M enzimlerinin yanısıra, yeni bir genişlemiş spektrumlu beta laktamaz olan IBC-1'in varlığını saptamaktır.Marmara Üniversitesi Hastanesi'nin değişik kliniklerinden Ocak 2004- Aralık 2005tarihleri arasında, fenotipik olarak GSBL(+) olup, IBC-1 fenotipi gösteren (seftazidimeve beta laktam inhibitörlerine dirençli, sefotaksim, sefepim, aztreonama azalmışduyarlılık ve imipeneme duyarlı) 30 köken(12 K.pneumoniae, 11 E. coli ve 7 E.cloacae) bu çalışmaya alınmıştır. Antibiyotik duyarlılık deneyleri CLSI'nin önerilerinegöre disk difüzyon ve agar dilüsyon yöntemleriyle gerçekleştirilen kökenlerin tamamı,disk difüzyon yöntemiyle ampisilin, amoksisilin klavulanik asit, piperasilin, seftazidimve trimetoprim sülfametaksazole dirençli; imipeneme ise duyarlı bulunmuştur. Diskdifüzyon yöntemiyle uyumlu olarak, kökenlerin tamamı agar dilüsyon yöntemiyle deampisilin, piperasilin ve seftazidime dirençli; imipeneme ise duyarlı bulunmuştur.Kökenlerin 26'sı E-test ile GSBL pozitif bulunurken 4'ü tanımlanamamıştır. IBC-1enziminin varlığını araştırmak amacıyla çift disk sinerji yönteminde imipenemdenseftazidime doğru inhibisyon zonunun genişlemesi pozitif olarak değerlendirilmiştir. kikökenimiz kesin pozitif iken 5 köken şüpheli pozitif olarak değerlendirilmiştir.Çalışmamızda kullanılan kökenlerde, GSBL üretiminden sorumlu olan bla IBC, bla TEM,bla SHV ve bla CTX-M genlerinin varlığını saptamak amacıyla polimeraz zincir reaksiyonuyapılmıştır. Kökenlerimizin 22(%73.3) tanesinde bla 18 (%60) tanesinde bla SHV,TEM,17 (%56.6) tanesinde bla genlerini taşıdıkları saptanmış ancak hiçbirinde blaCTX-M IBCgeni saptanamamıştır. Sonuçta hastanemizde izole edilen kökenlerimizde TEM, SHV veCTX-M enzimleri yaygın bulunurken IBC-1 enzimine rastlanmamıştır.
Özet (Çeviri)
SUMMARYExtended spectrum beta lactamases (ESBL), which are usually responsiblefor resistance to beta lactam antibiotics in Gram negative bacilli, are enzymes that canhydrolise cephalosporins and monobactams. The aim of this study was to detect thenovel extended spectrum beta lactamase IBC-1 in addition to TEM, SHV and CTX-Mtype ESBLs. In this study, a total of 30 strains (12 K. pneumoniae, 11 E.coli and 7 E.cloacae) isolated from different departmants of Marmara University Hospital betweenJanuary 2004- December 2005 and which produce ESBL and display IBC-1 phenotype(resistance to ceftazidime and beta lactamase inhibitors with reduced susceptibility tocefotaxime, cefepime and aztreonam and susceptibility to imipenem). Antimicrobialsusceptibility tests were performed both by disk diffusion and agar dilution testsaccording to CLSI guidelines. All isolates were resistant to ampicillin, amoxicillinclavulanic acid, piperacillin, ceftazidime and trimethoprim sulfamethoxazole butsusceptible to imipenem by both methods. ESBL phenotype was observed in 26 of theisolates but 4 isolates were found to be indeterminate by E-test ESBL strips. Enhancedinhibition zone between imipenem and ceftazidime in double disk synergy test has beenevaluated as positive for the presence of IBC-1. Two isolates were clearly positivewhile the results were doubtfull in five isolates for IBC-1. A polimerase chain reactionwas performed for bla IBC, bla TEM, bla SHV and bla CTX-M genes. Among the 30 isolates,the rates for TEM, SHV, CTX-M beta lactamases were found %73.3, %60, %56.6respectively while none of the isolates carried IBC-1 gene.. In conclusion, the results ofour study indicated that common ESBLs including TEM, SHV and CTX-M werewidely but not IBC-1 in our hospital.
Benzer Tezler
- Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli ve Klebsiella spp.'nin toplum taşıyıcılığı sıklığının ve enzim tiplerinin araştırılması
Prevelance of the carriage of Extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella spp.in the community and investigating the types of enzymes
DERYA ÇAKIR ERDOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiBülent Ecevit ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. FÜSUN CÖMERT
DOÇ. DR. ELİF AKTAŞ
DOÇ. DR. CANAN KÜLAH
- Kateter kaynaklı kan dolaşımı enfeksiyonu etkenlerinin belirlenmesi ve biyofilm oluşumunun fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Determination of etiologic agents of catheter related bloodstream infection and investigation of biofilm formation by phenotypic and genotypic methods
SİBEL GÜMÜŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METE EYİGÖR
- Rutin laboratuvarımızda etken olarak izole edilen Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde, metalo beta laktamaz varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle saptanması ve elde edilen sonuçların karşılaştırılması
Dedection and compaire of metallo beta lactamase with phenotypic and genotypic methods in Pseudomonas aeruginosa strains isolated in routine microbiology laboratory
MÜKERREM AKAYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. GÜNER SÖYLETİR
- Dermatofitlerin çabuk tanısında (Gaca)4, Its1 ve Its2 bölgelerini hedef alan primerlerin etkinliğinin karşılaştırılması
Comparison of efficiency of (Gaca)4 and primers targeting Its1-Its2 regions in rapid identification of dermatophytes
TUBA YÜKSEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MACİT İLKİT
- Hastane kaynaklı pnömoni etkeni olan metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarının moleküler epidemiyolojik incelenmesi
Molecular epidemiological investigation of hospital acquired pneumonia agent methicillin resistant Staphylococcus aureus
ZAHİDE DOYUK BEKTAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiZonguldak Karaelmas ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CANAN KÜLAH