Matriks GLA protein (MGP) gen çok yapılılığının böbrek taşı hastalarında araştırılması
Matrix GLA protein gene polymorphism in kidney stone forming patients
- Tez No: 195029
- Danışmanlar: PROF.DR. AHMET ARSLAN, Y.DOÇ. SİBEL OĞUZKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Üroloji, Medical Biology, Urology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Taş oluşumu; kristal çekirdekleşmesi, büyüme, kümelenme ve böbrek epiteline tutunma aşamalarından oluşan bir işleyiştir. İdrar bu süreci değiştiren ve böbreği taş oluşumuna karşı koruyan çeşitli makromolekülleri ihtiva etmektedir. Bunlardan matriks Gla protein (MGP) doku kalsifikasyonunun önlenmesinde oldukça etkin olduğu ve taş oluşumunun da önleyicisi olabileceği düşünülmektedir. Matriks Gla Protein geninin yapısal ve özendirici gen bölgelerinde saptanan nükleotid değişimlerinin taş hastası ve normal bireyler arasındaki dağılımının taş oluşumu ile ilişkisinin belirlenmesi için bu çalışma planlanmıştır. Klinik olarak böbrek taşı oluşturduğu tespit edilen, ailesel hikâyeye sahip 88, kendiliğinden taş oluşumu gözlenen 111 böbrek taşı hastası ile 94 sağlıklı bireyden DNA analizi yapmak amacıyla kan örneği alındı. Elde edilen DNA'lar, MGP geninin kodlayıcı ve özendirici (promoter) bölgesindeki çeşitli nükleotid değişimlerini kapsayan, 3 çift primer seti kullanılarak Polimeraz Zincir Tepkimesi'ne (PZT) tabi tutuldu. Çoğaltılan gen bölgeleri RFLP yöntemi ile gen çokyapılılığı (polymorphism) yönünden analiz edildi. MGP geni özendirici bölgesinde yer alan T-138C ve G-7A değişimi ile genin 4. ekzonunda rastlanan Thr83Ala değişiminin incelendiği çalışmamızda her 3 gen çokyapılılığının da gruplar arasındaki dağılımları belirlenmiştir. Yapılan ki-kare analizlerinde her 3 bölge için gruplar arasındaki dağılımda anlamlı bir fark görülmemiştir. Hardy-Weinberg eşitliğine uygunluğu açısından değerlendirilen her 3 nükleotid değişiminde G-7A normal bir dağılım sergilerken diğer iki değişimin (T-138C, Thr83Ala) sapma gösterdiği belirlenmiştir. Bunlardan Thr83Ala için hasta grubunda farklı bir dağılım görülürken, T-138C için hem hasta hem kontrol grubunda sapma gözlenmiştir. Ayrıca yapılan haplotip analizleri T-A-Thr ve C-A-Ala gibi iki haplotip öbeğinin taş oluşum riski ile ilişkili olduğu göstermiştir. Bu çalışma böbrek taşı oluşum mekanizmasında etkin rol oynayan diğer proteinlerin de gen bölgelerinin çalışılması gereğini ortaya çıkarmıştır.
Özet (Çeviri)
Stone formation is a process, includes crystal nucleation, growth, aggregation, and crystal retention within the renal tubules. Urine contains various macromolecules that modulate this process and protect the kidney against stone formation. Matrix Gla protein (MGP) appears to be an important protective modulator against crystallization since it is a potential inhibitor of tissue calcification. In this respect, it is aimed to establish the relationship between the distributions of nucleotide alterations found in promoter and coding regions of MGP gene in patients with kidney stone and normal individuals. DNA samples were obtained from 88 familial kidney stone formers, 111 sporadic stone formers, and from 94 healthy individuals, respectively. The DNA samples obtained were analyzed by Polymerase Chain Reaction (PCR) method using the 3 sets of primer pairs which cover the coding (Thr83Ala in exon 4) and promoter regions (T-138C and G-7A) of MGP gene. Amplified regions were analyzed by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) method for possible polymorphisms. The chi-square analysis of the results revealed that there is no relationship between the observed polymorphisms and stone formation. However, each of three polymorhisms evaluated by Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) revealed that G-7A genotype has no relation with the stone formation. The T-138C polymorphisms has shown deviation both in stone formers and the control group suggesting that this polymorphism is noninformative for stone formation risk while the Thr83Ala polymorphism has shown the significance only in stone formers suggesting the possible candidate region for stone formation. Additionally, haplotype analysis revealed that two haplotype blocks (T-A-Thr and C-A-Ala) are related with stone formation risk. In conclusion, either the polymorphic nature of the genes invoved in macromoleculer mechanism or their expressional level develops the risk of stone formation.
Benzer Tezler
- MGP gen polimorfizminin koroner arter hastalığındaki rolü
The role of MGP gene polymorphism in coronary artery disease
MEHMET ZİHNİ BİLİK
- İskemik kardiyomiyopatili hastalarda matrix gla protein gen polimorfizmi
The matrix gla gene polymorphysm in patients with ischemic cardiomyopathy
İLYAS KAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
KardiyolojiDicle ÜniversitesiKardiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. SIDDIK ÜLGEN
- Tip II Diabetes Mellitus'lu hastalarda Matriks Gla Proteininin G-7A ve T-138C gen polimorfizmlerinin araştırılması
Study of gene polymorphisms of Matrix Gla Proteins G-7A and T-138 in patients with Type 2 Diabetes Mellitus
FULYA YÜKÇÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyofizikTrakya ÜniversitesiBiyofizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TAMMAM SİPAHİ
- Arterial trombozla GAS6 (growth arrest- specific 6) ve MGP (matrıks GLa proteini) ilişkisi
Association between arterial thrombosis and plasma levels of matrix gla protein (MGP) and gas6 (growth arrest-specific 6)
ERDEM YILMAZ
- Son dönem böbrek yetersizliği olan hastalarda genetik polimorfizm ve oksidatif stresin rolü
The role of genetic polymorphism and oxidative stress in end-stage renal disease patients
SEHER KARSLI ÇEPPİOĞLU
Doktora
Türkçe
2010
Eczacılık ve FarmakolojiMarmara ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TÜRKAN YURDUN