Determination of the effects of actinic keratosis mutations on apoptosis
Aktinik keratozlardaki P53 mutasyonlarının apoptoz üzerindeki etkisinin incelenmesi
- Tez No: 195997
- Danışmanlar: PROF.DR. İZZET HAMDİ ÖĞÜŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Moleküler Tıp, Onkoloji, Biochemistry, Molecular Medicine, Oncology
- Anahtar Kelimeler: p53, p53 mutasyonu, Apoptoz, UVB, p53, p53 mutation, Apoptosis, UVB
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 109
Özet
Ercan A., Aktinik Keratozlardaki p53 Mutasyonlarının Apoptoz Üzerindeki Etkisinin ncelenmesi, Hacettepe Üniversitesi Saglık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya Programı Doktora Tezi, Ankara, 2006. Her sene cilt kanseri vakaları artmaktadır ve bu kanserlerin % 95'ni nonmelanoma cilt kanserleri (NMCK) olusturmaktadır. Günes yanıgı hücreleri olarak da bilinen Aktinik Keratozlar (AK), bir NMCK çesitidir. Günes ısıgının önemli kısmını olusturan UV, cilt kanserlerinin etiyolojisine büyük ölçüde katkıda bulunmaktadır. UV, mutasyonlara sebep olan DNA fotoürünlerini olusturmak suretiyle DNA'da hasarlar yaratmaktadır. UV'nin tanımlayıcı isareti Sitozin'in Timin'e degisimidir ve bu isaret tümör baskılayıcı p53'ün üzerinde de tanımlanmıstır. P53 hücre döngüsünü durdurarak ve apoptozu indükleyerek tümör büyümesini engellemektedir. P53'ün kanserlerin % 50'sinden fazlasında mutasyona ugradıgı ve bu mutasyonların büyük kısmının da yanlıs kodlanmıs nokta mutasyonlar oldugu bilinmektedir. Bu çalısmada amacımız AK'lerde bulunan p53'ün farklı mutant allellerinin UV'ye bagımlı apoptoz üzerine etkilerini tespit etmekti. Bunun için bir dizi biyoinformatik çalısma sonucu 11 nokta mutasyonu tespit edilmistir. Bu mutasyonlar ekspresyon vektörü üzerinde bölge yönelimli mutagenezle yaratılmıstır. Mutant ve yabanıl tip vektörler primer fare fibroblastlarına transfekte edilmis ve 1000 J UVB radyasyona maruz bırakılmıstır. Apoptoz yüzdesi flow cytometry'le ölçülmüs, protein ekspresyonunu ölçmek için western blotting uygulanmıstır. Çalısmamızın sonucunda R201C ve L202F mutasyonlarının etkisiz davrandıgı bazılarınınsa yüksek endojen apoptoza sahip olmalarına ragmen UV'ye bagımlı apoptoz yüzdesinin düsük oldugu görülmüstür (S241F, G245S, R248W). P128S UV'ye bagımlı apoptoza direnç gösterirken aynı ekzonda yer alan H178Y ve H179Y'de yabanıl tipe göre % 7.2 ve % 5.2 daha fazla apoptoz görülmüstür. A84V ve P92L artmıs endojen apoptoza ragmen UV'ye bagımlı apoptoz açısından yabanıl tip gibi davranmıslardır. Mutasyonun kazandıgı fiziksel ve kimyasal degisiklik, evrimsel olarak korunmus bölgede yer alması ve/veya DNA'ya baglanma bölgesine yakınlıgı bu mutasyonların apoptoz açısından davranısını etkilemektedir.
Özet (Çeviri)
Ercan A., Determination of the Effect of Actinic Keratosis Mutations on Apoptosis, Hacettepe University Institute of Health Sciences, Ph.D. Thesis in Biochemistry, Ankara 2006. Every year the incidence in skin cancers increases where 95% of these are non melanoma skin cancers (NMSC). Actinic Keratosis (AK) is a NMSC characterized by aberrant proliferation and cell differentiation. Ultraviolet (UV) contributes to the etiology of skin cancers. UV damages DNA by creating DNA photoproducts which in turn generates mutations also seen on the p53 tumor suppressor gene. P53 is mutated in more than 50% of cancers, and most of these are missense mutations. In this research our aim was to determine whether different mutant p53 alleles found in AK have different abilities to confer new properties as a response to UVB-induced apoptosis. After a bioinformatic study 11 point mutations were selected and generated by site directed mutagenesis on an expression vector. The mutated and wild type (WT) vectors were transfected into primary mouse fibroblasts and irradiated with 1000 J UVB. The apoptosis percentage was detected with flow cytometry and protein expression levels were determined by western blotting. We found that mutations R201C and L202F behave like nullmutations, while hotspot mutations S241F, G245S, R248W have high endogenous apoptosis but less response to UV-induced apoptosis. P128S was resistant to UVinduced apoptosis but H178Y and H179Y have 7.2% and 5.2% more UV-induced apoptosis compared to WT scores, respectively. Mutations A84V, P92L have increased endogenous apoptosis but behaved like WT p53 to UV-induced damage. The physical and chemical change the mutation acquires, being on an evolutionarily conserved domain and/or close to the DNA binding region effect the behavior of the mutation.
Benzer Tezler
- Egzersiz sırasında anaerobik eşik ve solunum kompanzasyon parametrelerinin akciğer gaz değişim performansları üzerine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of anaerobic threshold and respiratory compensation point parameters on pulmonary gas exchange dynamcis during exercise
FETHİ AHMET UĞUR
- Erken laktasyon dönemindeki yüksek verimli süt sığırlarının beslenmesinde kullanılan toplam yem karışımı'na (TMR) ilave edilen probiyotiklerin enterik metan ve karbondioksit emisyonu ile sindirilebilirlik üzerine etkilerinin in vitro gaz üretim tekniği ile belirlenmesi
Determination of the effects of probiotics added to the total feed mi̇xture (TMR) used in the feeding of high producing dairy cattle in early lactation period on enteric methane and carbon dioxide emission and digestibility by in vitro gas production technique
RAMAZAN ATA
- Silajlık mısır (Zea mays L.)'da farklı çapraz ekim yöntemlerinin verim ve kalite üzerine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of different cross planting methods on yield and quality in silage maize (Zea mays L.)
KEMAL ALTUNTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatSakarya Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA YILMAZ
- Çerezlik kabak bitkisinde verim ve kalite üzerine potasyum uygulamalasının etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of potassium application on the yield and quality of pumpkin seeds plant
ESMA BUDAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatErciyes ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADEM GÜNEŞ
- Sodyum nitroprussidin çilek bitkisinde sel baskını stresine karşı etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of sodium nitroprusside on flooding stress in strawberry
EMRULLAH KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatYozgat Bozok ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERVET ARAS