Geri Dön

Streptococcus thermophilus ve Lactobacillus bulgaricus virülent fajlarının replikasyon parametreleri, kapsid protein profilleri ve restriksiyon endonükleaz analizleri esas alınarak tanımlanmaları ve sınıflandırılmaları

Identification and classification of virulent bacteriophages of streptococcus thermophilus and Lactobacillus bulgaricus based on their replication parameters, capsid protein profiles and restriction endonuclease analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 196507
  2. Yazar: ESRA ACAR SOYKUT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NEZİHE TUNAİL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Gıda Mühendisliği, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Food Engineering, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: S. thermophilus, Lb. bulgaricus, virülent faj, konakçı özgüllüğü, proteinprofilleri, restriksiyon endonükleaz analizi, replikasyon parametreleri, sınıflamai, S. thermophilus, Lb. bulgaricus, virulent phage, host specifity, protein profiles, restriction endonuclease analysis, replication parameters, classificationii
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 188

Özet

Bu tez kapsamında konakçıları endüstriyel 709, 231 ve B3 S. thermophilus suşları olan 26 adet S.thermophilus fajı ile konakçıları ticari Y4, V1 ve V2 olan 24 adet Lb. bulgaricus fajının proteinprofilleri, restriksiyon endonükleaz şablonları ve faj replikasyon parametreleri belirlenmiştir.Ayrıca B3 S. thermophilus ve 231, V1, V2 Lb. bulgaricus fajlarının konakçı özgüllüklerininbelirlenmesi amacıyla; her iki türe ait fajlar, yerel ve starter S. thermophilus suşları ile yerel vestarter Lb. bulgaricus suşları ile karşılaştırılmıştır. Fajların hemen hemen aynı konakçıspektrumuna sahip oldukları görülmüştür. Yerel S. thermophilus suşları fajlara tam dirençgösterirken, yerel Lb. bulgaricus suşları hem kendi fajlarına çok duyarlı bulunmuş hem departnerinin kimi fajlarına heterolog konakçı olarak davranmıştır. S. thermophilus fajlarınınbirbirine identik protein profili ve 30.6 ile 27.3 kDa büyüklüğünde iki adet majör protein bantınasahip olduğu tespit edilmiştir. Lb. bulgaricus fajları ise iki ve/veya üç minör ve majör protein bantıiçermelerine göre 5 gruba ayrılmıştır. Minör protein bantlarının büyüklüğü 100.8, 65 ve 50 kDaiken, majör protein bantlarının büyüklüğü 29.6, 29.2 ve 26.2 kDa olarak belirlenmiştir. Fajlardan S.thermophilus' a özgül olanlar EcoRI, EcoRV, PvuII, HindIII, ClaI, HaeII, HhaI, PstI, BamHIrestriksiyon endonükleaz enzimleri ile kesime alınmış, oluşan fragment dizilimlerine göresınıflandırılmaya çalışılmış, EcoRV'e göre 9 grup oluşmuştur. Genom büyüklüklerinin ise 41-45kb civarında olduğu saptanmıştır. Lb. bulgaricus fajları ise EcoRI, EcoRV, PvuII, HindIII, HhaI veBamHI restriksiyon enzimleri ile kesime alınmış, HindIII ile kesim sonucu 8 farklı grubaayrılmıştır. Faj genom büyüklükleri 29-32 kb olarak hesaplanmıştır. S. thermophilus fajlarındanФB3-X19, Ф2B3-A, Ф231-X9, Ф231S-A ve Ф709-X5'in, Lb. bulgaricus fajlarından ise ФY4-X12'nin faj gelişim parametreleri belirlenmiştir. S. thermophilus fajlarının latent dönem sürelerinin15-35 dk arasında değiştiği görülürken, ФY4-X12'nin latent dönem süresi 85 dk bulunmuştur.Fajların tamamının artış dönem süreleri hemen hemen aynıyken, patlama büyüklüklerinde belirginfarklılıklar göze çarpmıştır.2007, 176 sayfa

Özet (Çeviri)

In this thesis, we have determined DNA restriction patterns, structural protein analysis andreplication parameters of 26 S. thermophilus (709, 231, B3) and 24 Lb. bulgaricus (Y4, V1, V2)phages. Furthermore, sensitivities of natural and commercial S. thermophilus and Lb. bulgaricusstrains to both of B3 S. thermophilus and 231 V1, V2 Lb. bulgaricus phages have beeninvestigated. It has been observed that none of the phages lyse natural S. thermophilus strain whilenatural Lb. bulgaricus strains have shown to be sensitive to Lb. bulgaricus phages. Besides, someof natural Lb. bulgaricus strains show sensitivity to some S. thermophilus phages as a heterologhosts. We have also identified that the electrophoretic profiles of the structural proteins of S.thermophilus phages are related, with two major bands of 30.6 and 27.3 kDa in common for allphages. Lb. bulgaricus phages, on the other hand, possess two and/or three major (29.6, 29.2, 26.2kDa) and minor (100.8, 65, 50 kDa) structural proteins. We have classified these phages into fivegroups based on major and minor proteins. EcoRI, EcoRV, PvuII, HindIII, ClaI, HaeII, HhaI,PstI,and BamHI resriction endonücleases have been used to digest of S. thermophilus phages.According to the EcoRV digestion, S. thermophilus phages are differentiated into nine subgroups.The genom size (41-45 kb) of S. thermophilus phage is determined by summing the molecular sizeof restriction fragments generated by digestion. Lb. bulgaricus phages are also treated withrestriction endonücleases (EcoRI, EcoRV, PvuII, HindIII, HhaI, and BamHI). The genom sizeranges from 29-32 kb. One-step growth studies show that latent periods of S. thermophilus phagesvary from 15 to 35 minutes and latent period of ΦY4-X12 is 85 minutes. Finally, it has beenobserved that all phages have similar rising time whereas they considerably differ in the size ofburst.2007, 176 pages

Benzer Tezler

  1. Tez No

    104505

    Streptococcus salivarius subsp. thermophilus virulent fajlarının izolasyonu ve yoğurt starter kültürleri üzerine litik etkilerinin belirlenmesi

    Virulent phages isolation of Streptococcus salivarius subsp. thermophilus and determination of lytic activity on yoghurt starter cultures

    DEĞER KALELİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Gıda MühendisliğiAnkara Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZİHE TUNAİL

  2. Tez No

    120101

    Yoğurt starter kültür fajlarının elektron mikroskobu ile morfolojik karakterizasyonu

    Morphological characterization of bacteriophages of yoghurt starter cultures

    ESRA ACAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Gıda MühendisliğiAnkara Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZİHE TUNAİL

  3. Tez No

    268503

    Characterization of Lactobacillus delbrueckii subspecies bulgaricus and Streptococcus thermophilus as lactic cultures isolated from traditional Turkish yogurts and subtyping of Streptococcus thermophilus using crispr analysis and mlst

    Geleneksel türk yoğurtlarından laktik kültür olarak izole edilen Lactobacillus delbrueckii subspecies bulgaricus ve Streptococcus thermophilus karakterizasyonu ve Streptococcus thermophilus?ların crispr analizi ve mlst kullanılarak alttiplendirmesi

    NESLİHAN ALTAY DEDE

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    MikrobiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Bölümü

    DOÇ. DR. GÜZİN CANDAN GÜRAKAN

  4. Tez No

    270342

    Geleneksel yoğurtlardan izole edilen laktik asit bakterilerinin plazmit içeriği ve biyojenik amin üretimi bakımından gıda endüstrisinde kullanılabilirliğinin araştırılması

    The investigation of potential usage in food industry in terms of plasmid content and biogenic amin production of lactic acid bacteria isolated from traditional yoghurts

    YEKTA GEZGİNÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Gıda MühendisliğiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İSMAİL AKYOL

  5. Tez No

    313837

    Chemical and rheological properties of yoghurt produced by lactic acid cultures isolated from traditional Turkish yoghurt

    Geleneksel Türk yoğurtlarından izole edilen laktik kültürler tarafından yapılan yoğurtların kimyasal ve fizyolojik özellikleri

    SEZEN DİNÇEL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜZİN CANDAN GÜRAKAN

    DOÇ. DR. BEHİÇ MERT

Geri Dön