Screening of autosomal recessive charcot-marie-tooth (ARCMT2), distal hereditary motor neuropathy (dHMN) and hereditary spastic paraplegia (HSP) patients for mutations in axonal neuropathy genes
Aksonal nöropati genlerinin otozomal çekinik charcot-marie-tooth (ARCMT2), distal herediter motor nöropati (DHMN) ve herediter spastik parapleji (HSP) hastalarında taranması
- Tez No: 200251
- Danışmanlar: DOÇ. ESRA BATTALOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Moleküler Tıp, Biology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Charcot-Marie-Tooth (CMT), distal Kalıtsal Motor Nöropati (dHMN) ve Herediter Spastik Parapleji (HSP) en genis kalıtsal periferik sinir sistemi hastalıkları grubunu olustururlar. Tez kapsamında, Türk ailelerinde ve izole olgularda otozomal çekinik CMT2 (ARCMT2) hastalıgının genetik altyapısı arastırıldı. Bu amaçla bu hastalıktan sorumlu oldugu bilinen GDAP1 ve LMNA genleri SSCP yöntemi ve 19q13.1 kromozom bölgesi homozigotluk haritalaması kullanılarak incelendi. Çalısma, otozomal baskın CMT2 ve dHMN'den sorumlu oldukları henüz bulunan küçük ısı-sok proteinlerini kodlayan HSPB1 ve HSPB8 gen taramalarını da içine alacak sekilde genisletildi. Bir baska ısı-sok proteinini kodlayan HSP60 geni de daha küçük bir grup olan kalıtsal spastik paraplezi hastalarında mutasyonlar için tarandı. ARCMT2'den sorumlu olan üç kromozom bölgesinin bir ailede tümüyle dıslanması ile hastalıktan sorumlu en az bir genin daha oldugu gösterildi. CMT4 hastalarından sadece birinde GDAP1 gen mutasyonu belirlendi. Diger bir hastalık mutasyonu ise bir CMT2 hastasında HSPB1 geninde bulundu. Bu hastalarda genetik tanının klinik tanı ile örtüstügü görüldü. Diger hastaların GDAP1, LMNA, HSPB1, HSPB8, ve HSP60 genlerinde hastalıktan sorumlu mutasyonlar tasımadıkları belirlendi ancak bu hastalarda normal bireylerde de görülebilen çesitli polimorfizmler tanımlandı. Bu bulgular, sözkonusu genlerin Türk toplumunda bu hastalıklar üzerindeki etkisinin yaygın olmadıgını gösterdi.
Özet (Çeviri)
Charcot-Marie-Tooth Disease (CMT), distal Hereditary Motor Neuropathy (HMN) and Hereditary Spastic Paraplegia (HSP) constitute the largest group of inherited diseases affecting the peripheral nervous system. In the scope of this thesis, the genetic background of autosomal recessive CMT2 disease was investigated in a cohort of Turkish families and isolated cases. For this purpose, GDAP1 and LMNA genes were investigated by SSCP analyses, and linkage to 19q13.1 locus was tested by homozygosity mapping. The study was extended to screening of the small heat shock protein genes, HSPB1, and HSPB8, that have been recently shown to be responsible for autosomal dominant CMT2 and distal HMN. The involvement of another heat shock protein gene, HSP60, was screened for mutations in a small group of Hereditary Spastic Paraplegia patients. Exclusion of all known loci responsible for ARCMT2 in a family demonstrated that there is at least one more locus responsible for the disease phenotype. Only one of the CMT4 patients was found to be mutated in GDAP1. Another causative mutation was identified in HSPB1 in a CMT2 patient. Clinical diagnoses of the patients were found to be compatible with the genetical diagnoses. All other patients tested negative for mutations in the GDAP1, LMNA, HSPB1, HSPB8, and HSP60 genes although several novel or previously repoted polymorphisms were detected. Absence of mutations in these patients indicated that the contribution of these genes to the appropriate disease phenotypes is low in the Turkish population.
Benzer Tezler
- Investigation of novel recessive causative genes and gene/allele frequency for CMT disease in Turkey
Çekinik CMT hastalığı için yeni genlerin araştırılması ve Türkiye'de CMT yapıcı gen/alel sıklığı incelemesi
AYŞE CANDAYAN
Doktora
İngilizce
2021
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU
- Short tandem repeat and mutation analyses in Turkish Charcot-Marie-Tooth patients
Türk Charcot-Marie-Tooth hastalarında kısa tekrarlı dizi ve mutasyon analizi
BARIŞ İBRAHİM
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
Tıbbi BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ESRA BATTALOĞLU
- Screening of spastin, atlastin, NIPA1 and REEP1 genes in hereditary spastic paraplegia (HSP) patients
Herediter spastik parapleji hastalarında (HSP) spastin, atlastin, NIPA1 ve REEP1 genlerinin taranması
ÇİĞDEM ATAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. ESRA BATTALOGLU
- Neonatal tarama programında konjenital adrenal hiperplazi taraması pozitif saptanarak Dokuz Eylül Üniversitesi Çocuk endokrinolojisi bilim dalı'na yönlendirilen yenidoğanların retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of neonates referred to Dokuz Eylul University department of pediatric endocrinology with positive screening test for congenital adrenal hyperplasia
BERFİN ORHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıDokuz Eylül ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KORCAN DEMİR
- A Multiplex-SSCP assay for ataxia-telangiectasia and gene localization in three disorders
Ataksi-telanjektezi için çoklu polimerazla zincirleme sentez-SSCP yöntemi ve üç hastalığın gen bölgelerinin belirlenmesi
SUNA ÖNENGÜT