Nıck translatıon yöntemiyle işaretlenmiş özgün dna dizilerinin kompleks kromozom anomalilerinin aydınlatılmasında kullanılması
Usage of distinctive dna sequences that labeled by nick transaltion method for identifing complex chromosome abnormalities
- Tez No: 203940
- Danışmanlar: PROF. DR. SEHER BAŞARAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 124
Özet
Bu çalışmada; klasik sitogenetik yöntemlerle ve ticari problarla yapılan FISH çalışmaları ile açıklanamayan kompleks kromozom anomalilerinin aydınlatılmasında, anomaliye özgün BAC klonlarının Nick translasyon tekniği ile işaretlenerek kullanılabilir hale getirilmesi amaçlandı.Bu çalışma kapsamında öncelikle 9., 13. ve 22. kromozomların katıldığı kromozom anomalileri kullanıldı.Çalışmaya alınan anomalilerin kırık noktalarına özgün 31 BAC klonu seçildi. Laboratuarımıza ulaşan 30 BAC klonu öncelikle çoğaltılarak stoklandılar. Daha sonra, stoklanmış 20 kültürden BAC lar izole edildi ve Nick Translasyon yöntemiyle işaretlenerek prob haline getirildiler.Özellikle kırık noktalarının aydınlatılması amacıyla çalışmaya alınan 8 kromozom anomalisinde, özgün problarla FISH çalışmaları uygulandı ve sitogenetik tanıya katkı sağlandı.Çalışmalar sonunda; BAC-FISH tekniğinin1.laboratuar koşullarında uygulanabilir olduğu ancak bakteri klonlarının üretilmesi ve izolasyonu aşamasında uygun laboratuar koşullarının göz önünde bulundurulması gerektiği2.en önemli aşamalarından biri klonların izolasyonu olup probların kalitesini etkilediği ve diğer önemli etmenin preparatların kalitesi olduğu ve hibridizasyonun başarısını etkilediği3.uygun BAC klonlarının kullanımı koşulu ile kompleks kromozom anomalilerinin aydınlatılmasında ek bilgiler sağladığı saptandı.BAC-FISH tekniğinin referans merkezi olarak çalışan ve daha sıklıkla kompleks kromozom anomalilerinin aydınlatılması sorunu ile karşı karşıya kalan laboratuarlar için uygun ve uygulanabilir bir teknik olduğu kararına varıldı.
Özet (Çeviri)
In this study, we aimed to reveal the use of specific BAC clones labeled by Nick translation in identification of complex chromosome abnormalities, which could not be defined by classical cytogenetic methods and commercial FISH probes.Primarily, abnormalities of chromosome 9, 13 and 22 were used within this study.31 BAC clones peculiar to brake points of abnormalities were chosen and 30 BAC clones were cultured and stocked. 20 BACs were rendered as FISH probes following isolation from stock cultures and labeling by Nick translation method.FISH studies using distinctive probes was performed on 8 chromosome abnormalities, especially selected for identification of break points, and contributed to cytogenetic diagnosis.By this study, the following keypoints were achieved:1.applicability of BAC-FISH needs special laboratory conditions, especially at stage of cloning and isolating of bacterial cultures,2.isolating is one of the most important stage and it affects the probe quality. The other important step is slide preparation and this is effective on the hybridization success,3.using of suitable BAC clones; contribute identification of complex chromosome abnormalities.In conclusion, BAC-FISH technique is suitable and applicable for laboratories that are working as reference center and which usually challenges with complex chromosomal abnormalities
Benzer Tezler
- The ınvestıgatıon of changes ın chromosome 9 INV (9) and 9QH (+) varıant regıons by molecular cytogenetıc analysıs(fluorescence ın situ hybridization (FISH)
Kromozom 9'un inv(9) ve 9qh(+) variant bölgelerindeki değişimlerin moleküler sitogenetik yöntemle ( fluorescence in situ hybridization (FİSH) incelenmesi
RAJAA UMRAN MOSA AL-RUBAYE
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
GenetikSelçuk ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NADİR KOÇAK
- Normal ve hemoglobinopatik hasta kanlarından DNA izolasyonu ve karakterize edilmesi
Başlık çevirisi yok
S. AYŞE ÖZER
- Özgün DNA dizilerinin floresan in situ hibridizasyon (FISH) tekniği için işaretlenmesi
Spesific DNA fragments labelling for flouresan in situ hybridization (FISH)
KADER YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEHER BAŞARAN
- HER2/neu genine özgü dual color FISH progbu hazırlanması
Producing the fluoresans in situ hybridization probe of HER2/neu gene
HASAN AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞEGÜL TOPAL SARIKAYA
YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP AKDESTE
- Sevdâyî Divanı'nın çeviri yazı metni ve günümüz Türkçesiyle nesre aktarımı
Sevdayi Divan?s transcription and translation to contemporary Turkish
ZÜBEYDE YAŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Eğitim ve ÖğretimSelçuk ÜniversitesiTürkçe Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖNÜL AYAN