Dermatofitlerin identifikasyonunda moleküler yöntemlerin yeri ve uygulanabilirliğinin belirlenmesi
The place of molecular methods in the identification of dermatophytes and the determination of their feasibility.
- Tez No: 203970
- Danışmanlar: PROF. DR. YILDIZ YEĞENOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Dermatofit, Trichophyton cinsinden, Microsporum cinsinden, PCR, RFLP, Dermatophyte, Trichophyton spp, Microsporum spp, PCR
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
Bu çalışmada; 270 hastadan alınan, saç+saçlı deri, deri ve tırnak kazıntısı örnekleri mikolojik yönden incelenmiş ve etken olarak izole edilip dermatofit olduğu düşünülen 56 suşun geleneksel ve moleküler yöntemler ile identifikasyonu yapılmıştır. Üreyen kolonilerden hazırlanan preparasyonlarda 37 (% 66,1)'sinin Trichophyton rubrum, dördünün (% 7,1) Trichophyton mentagrophytes, dördünün (% 7,1) Trichophyton tonsurans, birinin (% 1,8) Trichophyton violaceum, sekizinin (% 14,3) Trichophyton cinsinden, birinin (% 1,8) Microsporum canis, birinin (% 1,8) Microsporum cinsinden olduğu belirlenmiştir. Benzer makroskopik ve mikroskopik özelliklere sahip olan suşların, daha doğru identifikasyonunu gerçekleştirmek için; sporulasyonu ve pigment oluşumunu uyaran MUA / PDA, üreaz oluşumunu sağlayan üre agarı ve Trichophyton cinsinden mantarların vitamin gereksinimlerini sağlayabilme temeline dayalı trikofiton agar 1-7 besiyerlerine ekim yapılmış, 56 suştan 29 (% 51,8)'u T. rubrum, üçü (% 5,3) T. mentagrophytes, ikisi (% 3,6) T. tonsurans, biri (% 1,8) T. violaceum, 19 (% 33,9)'u Trichophyton cinsinden, biri (% 1,8) M. canis, biri (% 1,8) Microsporum cinsinden olarak adlandırılmıştır. Geleneksel yöntemler ile T. rubrum, T. mentagrophytes, T. tonsurans, T. violaceum, Trichophyton cinsinden, M. canis ve Microsporum cinsinden olarak tanımlanan suşların kesin identifikasyonları T1 PCR, 25 GA PCR, ITS PCR-RFLP ve sekanslama yöntemleri uygulanarak yapılmıştır. Moleküler identifikasyon sonucunda 41 suş (% 73,2) T. rubrum, 10 suş (% 17,8) Trichophyton interdigitale, bir suş (% 1,8) T. violaceum, iki suş (% 3,6) M. canis, bir suş (% 1,8) Peacilomyces lilacinus, bir suş (% 1,8) Aspergillus fumigatus olarak tanımlanmış, kullanılan moleküler yöntemler ile dermatofitlerin tür düzeyinde identifikasyonu hızlı ve doğru bir şekilde sağlanmıştır.
Özet (Çeviri)
In this work, hair, skin and nail scrapings collected from 270 patients were examined and 56 strains that were thought to be dermatophytes were isolated. These 56 strains were identified by conventional and molecular methods. Out of 56 strains, 37 (66,1 %) were identified as Trichophyton rubrum, four (7,1 %) were as Trichophyton mentagrophytes, four were (7,1 %) as Trichophyton tonsurans, one (1,8 %) was as Trichophyton violaceum, eight (14,3 %) were as Trichophyton spp., one (1,8 %) was as Microsporum canis, one (1,8 %) was as Microsporum spp. The strains which have similar macroscopic and microscopic characteristics were inoculated into CMA/PDA that enhance the pigment production and stimulate sporulation, urea agar for the production of urease and trichophyton agars 1-7 to detect nutritional requirements of Trichophyton species. At the end of these tests, 29 (51,8 %) strains were identified as T. rubrum, three (5,3 %) were as T. mentagrophytes, two (3,6 %) were as T. tonsurans, one (1,8 %) was as T. violaceum, 19 (33,9 %) were as Trichophyton spp., one (1,8 %) was as M. canis, one (1,8 %) was as Microsporum spp. T1 PCR, 25 GA PCR, ITS PCR-RFLP, and sequencing were performed for definite identification of the strains that were identified as T. rubrum, T. mentagrophytes, T. tonsurans, T. violaceum, Trichophyton spp., M. canis, and Microsporum spp. by conventional methods. According to the molecular identification, 41 (73,8 %) strains were identified as T. rubrum, 10 (17,8 %) were as Trichophyton interdigitale, one (1,8 %) was as T. violaceum, two (3,6 %) was as M. canis, one (1,8 %) was as Peacilomyces lilacinus, one (1,8 %) was as Aspergillus fumigatus. Molecular methods were used in this work provide rapid and accurate species level identification of dermatophytes.
Benzer Tezler
- Dermatofit izolasyonunda ve identifikasyonunda CDSAM, SGA ve MBLA besiyerlerinin karşılaştırılması
Comparison of CDSAM, SGA and MBLA mediums for the isolation and identification of dermatophytosis
DİLAN PERİŞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET MACİT İLKİT
- Diabetes mellituslu hastalarda onikomikoz etkenleri ve antifungal duyarlılıkları
Başlık çevirisi yok
AYNUR GÜLCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
MikrobiyolojiAbant İzzet Baysal ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. DEMET KAYA
- Dermatofitlerde tür tayini ve Van yöresinde izole edilen dermatofitler
Identifcation of dermatophytes and isolation of dermatophytes in the Van region
HAMZA BOZKURT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1997
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA BERKTAŞ
- Dermatofitlerin izolasyonu ve moleküler tanımlanması ve bununla ilişkili bazı çevresel faktörlerin incelenmesi
Isolation and molecular identification of dermatophytes and investigation of some environmental factors associated with it
MURAD KHAMEES MUSHIB
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMET GAFFAROĞLU
YRD. DOÇ. DR. WALED KHALİD AHMED
- Dermatofitlerin çabuk tanısında (Gaca)4, Its1 ve Its2 bölgelerini hedef alan primerlerin etkinliğinin karşılaştırılması
Comparison of efficiency of (Gaca)4 and primers targeting Its1-Its2 regions in rapid identification of dermatophytes
TUBA YÜKSEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MACİT İLKİT