Mesane kanserli vakalarda DNA tamir genlerinden XRCC1, XRCC3, XPD, XPG, APE1, hOGG1 gen polimorfizmlerinin araştırılması
Analysis of XRCC3, hOGG1, XPD, XRCC1, XPG and APE1 gene polymorphisms in patients with bladder cancer
- Tez No: 204052
- Danışmanlar: PROF. DR. TURGAY İSBİR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Moleküler Tıp, Üroloji, Molecular Medicine, Urology
- Anahtar Kelimeler: DNA onarım kalitesi, DNA onarım testi, Gen sıklığı, Mesane, Mesane neoplazmları, Neoplazmlar, Onarım, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, DNA repair quality, DNA repair test, Gene frequency, Urinary bladder, Urinary bladder neoplasms, Neoplasms, Repair, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mesane kanseri sigara içimi ile oluşan en önemli idrar yolu kanserlerindendir. Serbest oksijen radikalleri sayesinde DNA hasarına sebep olmaktadır. DNA tamir kapasitesindeki değişikliklerİ ile malign tümörler gelişebilir. Çalışmamızda mesane kanserli hastalarda DNA tamir genlerinden XRCC1, XRCC3, XPD, XPG, APE1, hOGG1 gen polimorfizmlerini incelemeyi amaçladık. 84 mesane kanserli ve 45 sağlıklı bireyde Polimeraz Zincirleme Reaksiyonu, Restriksiyon Fragmanı Uzunluk Polimorfizmi ve agaroz jel elektroforezi teknikleri kullanılarak, hOGG1 Ser326Cys, XPD Lys751Gln, XRCC3 Thr241Met, XRCC1 Arg194Trp, APE1 Asp148Glu ve XPG Asp1104His polimorfizmleri araştırılmıştır. Çalışmamızda hasta ve kontrol grubunda XRCC3 genotip dağılımı açısından anlamlı fark gözlenmiş (p:0,003) ve T allelinin kontrol grubunda 4.87 kat koruyuculuk oluşturduğu tespit edilmiştir (p:0,002). Ayrıca hasta grubunda hOGG1 genotip dağılımının kontrol grubuna göre anlamlı olarak farklı şekilde dağılım gösterdiği (p:0,003) ve CYS/CYS genotipinin hasta grubunda istatistiksel olarak anlamlı şekilde yüksek olduğu tespit edilmiştir (p:0,022). Diğer polimorfizmleride kontrol ve çalışma grubu arasında istatistiksel anlamlılık saptanmamıştır. Cinsiyet, yaş grupları, sigara, XRCC3C, XRCC3T, hOGG1SER ve hOGG1CYS alleleri arasında yapılan lojistik regresyon analizinde XRCC3T alleli etkili olarak tespit edilmiştir (p<0,001). Ayrıca APE gen polimorfizmi AA genotipi (P:0,01) ve A alleli taşıyanlar (P:0,040) değişici epitelyum hücreli kanser grubunda adeno kanseri grubuna gore istatistiksel olarak anlamlı şekilde yüksek bulunmuştur. Bu sonuçlara göre XRCC3 T allelinin koruyucu olduğu, hOGG1 CYS/CYS genotipinin ise hastalık gelişme riskini arttırdığı tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Bladder Cancer is one of the most important cancer related to urinary system.In our study we aimed to investigate the role of DNA repair gene polymorphisms hOGG1, XRCC1, XRCC3, XPD,XPG and APE1 in bladder cancer. Ser 326Cys in hOGG1 gene, Lys751Gln in XPD gene,Thr241Met in XRCC3 gene, Arg 194Trp in XRCC1 gene,Asp148Glu in APE1 gene and Asp1104His in XPG gene polymorphisms were examined in 84 patients with bladder cancer and 45 control subjects by using Polymerase Chain Reaction (PCR) , Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) , and agarose gel electrophoresis techniques. When the contribution of the XRCC3 genotype for that disease was analysed we found that the genotype distribution is statistically significantly different between the control group and patients (p=0.003) and the T allele has 4.87 times protective affect for the control group (p=0.002). As a result of our study, when we analysed our group according to hOGG1 gene contribution to interindividual variation in Bladder Cancer, we found that patients with CYS/CYS genotype have a higher risk for Bladder Cacer (p=0..22) and the genotype distribution is statistically significantly different between the control group and patients (p=0.003).When logistic regression analyse was performed between age, gender, smoking, XRCC3C, XRCC3T, hOGG1Ser, hOGG1CYS, we found that XRCC3T allele has the affect on the development of bladder cancer(p<0.001). We also found that the ratio of the patients with AA genotype (p=0.01) and the A allele (p=0.04) are statistically significantly more in cancer group with transitional epithelium cell then in cancer with adenocancer. With all these findings we found that the T allele in XRCC3 gene has protective and hOGG1 CYS/CYS genotype has detrimental affect on bladder cancer risk.
Benzer Tezler
- Base excision repair capacity in non-muscle-invasive bladder cancer
Kasa invaze olmayan mesane kanserinde baz eksizyon tamir kapasitesi
FATMA MERVE ANTMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
ÜrolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELTEM MÜFTÜOĞLU
- Değişici epitel hücreli mesane kanserinde insan telomeraz reverse transkriptaz mutasyonunun yüksek ve düşük dereceli tümörlerde karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of human telomerase reverse transcriptase mutation in transitional epithelial cell bladder cancer in high and low grade tumors
MUSTAFA KAPLAN
Doktora
Türkçe
2023
OnkolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiMoleküler Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA DUMAN
- VDR, Txnip, hOGG1 gen ekspresyonları ve 25-hidroksi vitamin D3 düzeyinin mesane kanseri ile ilişkisinin incelenmesi
Investigation of VDR, Txnip, hOGG1 gene expressions, and 25-hydroxy vitamin D3 level their relationship with bladder cancer
ESRA ACAR
Doktora
Türkçe
2021
BiyokimyaKocaeli ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELTEM ÖZLEN DİLLİOĞLUGİL
- Solid tümörlü hastalarda gemsitabin ve sisplatin rejiminin etkililik ve yan etki profilini etkileyen genetik faktörlerin değerlendirilmesi
Evaluation of genetic factors affecting the effectiveness and side effect profile of gemcitabine and cisplatin regimen in patients with solid tumours
ONUR PATAN
Doktora
Türkçe
2024
Farmasötik Toksikolojiİstanbul ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜL ÖZHAN
DOÇ. DR. ZELİHA PALA KARA
- Dapagliflozin'in genotoksisitesinin drosophila melanogaster'de COMET, SMART ve davranış testleriyle araştirilmasi
Investigation of genotoxicity of dapagliflozin in drosophila melanogaster using COMET, SMART and behavioral tests
ZEBİHA YİĞİT
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARZU ÖZKARA