Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde kinolon direncinin moleküler olarak saptanması
Use of molecular techniques for the detection of quinolone resistance in pseudomonas aeruginosa
- Tez No: 204226
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MELTEM YALINAY ÇIRAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 112
Özet
Pseudomonas aeruginosa hastalarda ciddi seyirli enfeksiyonlara yol açan ve antibiyotik direncinin sorun olduğu bir patojendir. Son yıllarda, hem hastane hem de toplum kaynaklı enfeksiyonlardan izole edilen P. aeruginosa'da antimikrobiyallere karşı direnç artış göstermektedir.Bu çalışmanın amacı, P. aeruginosa suşlarında kinolon direncinin konvansiyonel ve moleküler yöntemler kullanılarak saptanmasıdır.Hastanemize gönderilen çeşitli örneklerden izole edilen 93 nonfermentatif bakteri konvansiyonel yöntemlerle tiplendirilmiştir. Tiplendirilen 39 P.aeruginosa suşu çalışmaya dahil edilmiştir. Bu P. aeruginosa suşlarına CLSI önerilerine uygun olarak agar dilüsyon yöntemi ile ofloksasine olan duyarlılıkları araştırılmıştır. P. aeruginosa'da kinolon direncine sebep olduğu düşünülen ve üzerinde en çok çalışılan bölge DNA giraz geninin A altünitesidir. Ofloksasine duyarlı ve dirençli tüm P. aeruginosa suşlarına gyrA gen bölgesinin dizi analizi yapılarak moleküler olarak incelenmiştir.Elde ettiğimiz verilere göre, agar dilüsyon metodu ile ofloksasine duyarlılıkları araştırılan 39 P. aeruginosa suşunun 14'ünde (%35,89) direnç görülürken, orta düzeyde direnç oranı 3 suşta (%7,69) tespit edilmiştir.gyrA geninde yapılan dizi analizinde farklı kodonlarda mutasyonlar saptanmıştır. gyrA gen bölgesinin dizi analizi sonuçları incelendiğinde, 83. kodonda treonin aminosidinin izolösin aminoasidine dönüşümü sonucu oluşan mutasyon yalnız ofloksasine dirençli 5 suşta (%12,82) saptanmıştır. Duyarlı suşlarda da çok sayıda sessiz mutasyon gözlenmiştir.gyrA geninde incelenen diğer kodonlarda da çok sayıda sessiz mutasyonlara rastlanmıştır. Çalıştığımız örneklerde en sık rastlanan sessiz mutasyon 132. kodonda gösterilmiştir. 6 P. aeruginosa (%15,38) suşunda ise hiçbir değişikliğe rastlanmamıştır.P. aeruginosa suşlarında kinolon direncinin gyrA gen bölgesinin moleküler analizi ile değerlendirildiği bilindiği kadarıyla ülkemizde yapılan ilk çalışmadır.P.aeruginosa'ya yüksek direnç görülmesi nedeniyle antimikrobiyal direncin aydınlatılabilmesi için bu gibi çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Dirençle ilişkili olabilecek gyrB, parC ve parD gen bölgelerininde araştırılması, direncin moleküler özelliklerinin ortaya konulabilmesi açısından gereklidir.
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa is responsible for serious infections in critically ill patients. In recent years, increasing antimicrobial resistance in both nosocomial and community acquired P. aeruginosa isolates is alarming.The aim of study was to detect the quinolone resistance of P. aeruginosa strains isolated from various clinical specimens in our hospital, by conventional and molecular metods. Ninety ? three nonfermentative bacterial isolates were included in the study. Thirty ? nine of them was identified as P. aeruginosa by using conventional metods. Ofloxacin susceptibility of the stains were assessed by using agar dilution method according to the recommendations of CLSI and DNA sequencing of gyrA was done.Fourteen of 39 (35,89%) P. aeruginosa strains were resistant to ofloxacin. Further 3 (7,69%) strains were found intermediate ? resistant. The substitution of threonine to isoleucine was observed in 5 of 14 (35.71%) quinolone resistant strains. Various silent mutations had been detected in quinolone resistant and susceptible strains, where codon 132 was most frequently affected. None of the susceptible strains had missense or nonsense mutations in gyrA. Six of 39 (12,82%) of the strains did not have any gyrA mutations.These data confirm that the primary mechanism of quinolone resistance in P. aeruginosa is mediated through target site alterations, specifically leading to the amino acid substitution of an isoleucine for a threonine in gyrA.To our knowledge this is the first study which the quinolone resistance examined by molecular analyzes in the gyrA gene of the P. aeruginosa in Turkey.We requirement new studies for clarifying the antimicrobial resistance because of the high level resistance in P. aeruginosa. The gene region must examined which can be related with resitance this is necessary for showing molecular chracteristic.
Benzer Tezler
- Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen mikroorganizmaların identifikasyonu, antibiyotik duyarlılıkları ve ESBL direnç durumunun araştırılması
Identification, antibiotic susceptibility and investigation of ESBL resistance of microorganisms isolated from blood culture samples of inpatients in intensive care units
OSMAN ORUÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASHABİL AYGAN
- Çoğul dirençli Pseudomonas aeruginosa'da dış membran protein profilinin belirlenmesi
Determination of outer membrane proteins in multiresistant pseudomonas aeruginosa
ŞEBNEM BUKAVAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
MikrobiyolojiTrakya ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. METİN OTKUN
- Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde virülans, antimikrobiyal direnç ve dezenfektan toleransı
Virulence, antimicrobial resistance and disinfectant tolerance in pseudomonas aeruginosa strains
NÜLÜFER UZUNBAYIR AKEL
Doktora
Türkçe
2018
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİNE HOŞGÖR LİMONCU
- Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde lipid metabolizması ve antibiyotik direncinde rol alan ACPP ve mMEXA genlerinin antisens oligonükleotitler ile susturulması
Silencing acpp and MEXA genes which take part in lipid metabolism and antibiotic resistance in pseudomonas aeruginosa isolates BY antisense oligonucleotids
YAMAÇ TEKİNTAŞ
Doktora
Türkçe
2018
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİNE HOŞGÖR LİMONCU
- Klinik örneklerden izole edilen pseudomonas aeruginosa kökenlerinde genişlemiş spektrumlu, metallo ve ampc tipi beta laktamaz varlığının araştırılması, ampc tipi beta laktamaz üretiminin genotipik olarak saptanması
Determination of the presence of extended spectrum, metallo, ampc beta lactamase enzymes and genotypic detection of ampc type beta lactamase in pseudomonas aeruginosa strains isolated from clinical samples
ÖZGÜR PAŞA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiMustafa Kemal ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURÇİN ÖZER