Laktik asit bakterilerinde transkripsiyon regülasyonu
Transcription regulation of lactic acid bacteria
- Tez No: 213604
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. İSMAİL AKYOL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Lactococcus lactis subsp.lactis IL1403, rcfA geni, Transkripsiyon düzenleyici protein FNR, Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403, rcfA gene, Transcription Regulator proteins, FNR
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 35
Özet
FNR transkripsiyon düzenleyicisi E. coli bakterisinde düzenler ve promotorun üst bölgesindeki FNR kutusuna bağlanmakta ve anaerobik ve aerobik şartlardaki değişiklikleri kontrol etmektedirler. Bu tez çalışmasında Lactococcus lactis subsp.lactis IL1403 suşunda transkripsiyon düzenleyicisi olarak rol oynadığı düşünülen FNR benzeri RcfA proteinini kodlayan rcfA geni çalışılmıştır. RcfA ve FNR proteini amino asit dizileri karşılaştırılıp önemli benzerlik bulunmuştur. rcfA genin promotor analizi yapılarak potansiyel FNR benzeri proteinlerin bağlanma bölgeleri araştırılmıştır. rcfA genini IL1403 suşunda mutasyona uğratabilmek için genin alt ve üst bölgelerini çoğaltabilecek primerler tasarlanmıştır. Çoğaltılan alt bölge PCR ürünü pORI280 plazmitine klonlanmış ve oluşturulan plazmit pBGML110 olarak adlandırılmıştır. Çoğaltılan rcfA gen üst bölgesi pBGML110 plazmitine klonlanarak rcfA geninin alt ve üst bölgesini içeren pBGML113 plazmiti oluşturulmuştur ve EC1000 suşuna transfer edilip BGML123 olarak adlandırılmıştır. Plazmit ileriki çalışmalarda L.lactis IL1403 aktarılarak çiftli geçiş sistemi ile kromozomal DNA'dan rcfA geninin mutasyona uğratılması sağlanacaktır.
Özet (Çeviri)
FNR is a transcriptional regulator in E. coli and binds to FNR boxes located upstream of promoters to be regulated, and controls the switch from aerobic and anaerobic growth. In this thesis, potential transcriptional regulator rcfA genes, that encode FNR like protein RcfA, was studied in Lactococcus lactis subsp.lactis IL1403. RcfA and FNR proteins were compared and significant homology was observed. rcfA gene promotor region analysis was done and potential FNR like proteins binding sequence was investigated. Primers were designed to amplify gene upstream and downstream region to create rcfA gene mutation in IL1403 strains. PCR amplified downstream region was cloned into pORI280 and constructed plasmid named as a pBGML110. Amplified rcfA gene upstream region was cloned into pBGML110 and both upstream and downstream region contained pBGML113 plasmid constructed then transferred into EC1000 and BGML123 strains was created. This plasmid will be used to create rcfA gene mutation using double crossover plasmid system in L.lactis IL1403.
Benzer Tezler
- Laktik asit bakterilerine ait bazı suşların obeziteye karşı etkileri
Anti-obesity effects of certain strains of lactic acid bacteria
GAMZE EDA YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU
- Streptococcus thermophilus suşlarının laktat dehidrogenaz ve asetaldehit transkript seviyelerinin belirlenmesi ile potansiyel starter seçilmesi
The potential starter selection of Streptococcus thermophilus strains by determination of lactate dehydrogenase and acetaldehyde transkript levels
ŞEYMA DÖKÜCÜ KARAÇALI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YEKTA GEZGİNÇ
- Lactococcus lactis fhuR geninin çoklu kopyalarının nisin biyosentezine etkisi
The effect of multiple copies of fhur gene of Lactococcus lactis on nisin biosynthesis
ZEYNEP GİRGİN ERSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
GenetikGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İ. YAVUZ SEZEN
DOÇ. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Lactococcus lactis'in oksidatif stres toleransının arttırılması ve aerobik koşullarda nisin üretimi ve optimizasyonu
Improving oxidative stress tolerance of Lactococcus lactis and optimization of nisin production in aerobic conditions
ZEYNEP GİRGİN ERSOY
Doktora
Türkçe
2021
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Laktik asit bakterilerinde bazı biyojen amin üretim potansiyellerinin moleküler olarak belirlenmesi
Determining the molecular production of biogenic amin in lactic acid bacteria
ÖZNUR BUCAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİN ÖZKÖSE