Class restriction in odorant receptor gene regulation
Koku reseptörü gen regülasyonunda sınıf kısıtlaması
- Tez No: 246266
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. STEFAN H. FUSS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
Suda ve havada bulunan kimyasalların algılanmasında rol alan koku reseptörleri çoğu omurgalıda yedi-transmembran G protein-kenetli reseptörlerinin en büyük grubunu oluştururlar. GPKR olarak tanımlanmalarından beri KR'nin gen regülasyonu detaylı olarak çalışılmıştır. KR'nin memelilerde iki ana sınıfa, Sınıf I ve Sınıf II, ayrıldıgı gösterilmiştir ve bu olgunun KR gen ekspresyonunun çeşitli aşamalarında kısıtlayıcı bir rol oynadığına inanılmaktadır. Bu aşamalardan biri, koku alıcı nöronların ilk denemelerinde fonksiyonel bir KR ifade edememeleri durumunda alternatif bir KR seçtikleri ikinci seçim mekanizmasıdır. Zebrafish KR repertuarı tek bir adet Sınıf I KR (OR101-1) dahil olmak üzere 136 fonksiyonel KR geninden oluşmaktadır. KR repertuarının nispeten küçük boyutu, ve sadece tek bir Sınıf II KR'nün varlığı, zebrafish türünü sınıf kısıtlamasını çalışmak için ideal kılmaktadır.Soyunun Sınıf II'ye dayandığını kanıtlamak için OR101-1'in filogenetik geçmişi, insane ve zebrafish gen repertuarlarını içeren iki adet filogenetik ağaç hazırlanarak analiz edildi. OR101-1'in insan KR'lerine çok daha yakın olduğu gözlemlendi. 8 değişik zebrafish dokusuna RT-PCR analizi yapılarak, OR101-1'in koku epiteline spesifik ekspresyonu gösterildi. OR101-1'in erken gelişme dönemindeki ekspresyon motifi embryonik cDNA üzerine yapılan RT-PCR ve qRT-PCR aracığıyla gösterildi. 24 saat post-fertilizasyon kadar erken bir safhada OR101-1 ekspresyonu gözlemlendi. OR101-1'e spesifik antisens RNA riboprobları kullanılarak yapılan in situ hibridizasyon çalışmaları da önceki bulgularımızı destekledi. Son olarak, OR101-1 ekspresyonunu gözlemlememizi sağlayacak iki transgenik konstrakt tasarlandı ve kısmen klonlandı: OR101-1-IRES-Venus işaretleme konstraktı ve OR101-1 ekspres eden koku nöronlarında ikinci seçim mekanizmasını çalışmamıza olanak sağlayacak, OR101-1 kodlayıcı sekansının yerini YFP (sarı flöresan protein) sekansı ile değiştiren, YFP delesyon konstraktı.
Özet (Çeviri)
Odorant receptors which partake in the detection of both water-soluble and airborne chemicals constitute the largest family of seven-transmembrane G-Protein-Coupled Receptors in the majority of vertebrates. Since their identification as GPCR proteins, the mechanism of gene regulation in ORs has been extensively studied. It has been shown that ORs in mammals are divided into two major classes, Class I and Class II, and this phenomenon is believed to play an important restrictive role in various aspects of OR gene expression, one of which is the second choice mechanism by which olfactory sensory neurons switch to an alternate OR in case their first attempt fails at the expression of a functional OR. Zebrafish OR repertoire consists of 136 intact OR genes, including only a single Class II OR. The relatively small size of the OR repertoire and the presence of a single Class II gene, OR101-1, makes the zebrafish species an ideal model organism to study class restriction.In order to ascertain its nature as a Class II OR, the phylogenetic background of OR101-1 was analyzed by the construction of two different phylogenetic trees which include zebrafish and human OR gene repertoires. OR101-1 was shown to be much more closely related to human ORs. Olfactory epithelium-specific expression of OR101-1 was shown through RT-PCR analysis of cDNA from 8 different zebrafish tissues. Early developmental expression patterns of OR101-1 was assessed by RT-PCR, qRT-PCR of embryonic cDNA, and expression of OR101-1 as early as 24 hours post-fertilization was observed. In situ hybridization studies using OR101-1-specific antisense RNA riboprobes also corroborated our previous findings. Finally, two transgenic BAC constructs that would allow the visualization of OR101-1 expression were designed and partially cloned: an OR101-1-IRES-Venus tag construct and a YFP deletion construct replacing the OR101-1 coding sequence to study the second choice mechanism in OR101-1 expressing OSNs.
Benzer Tezler
- Morbid obez hastalarda ultrason kullanılarak zor havayolu tahmini
Difficult airway prediction using ultrasound in morbidly obese patients
SEVİM AKIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Anestezi ve ReanimasyonFırat ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ESEF BOLAT
- Development of a smal-scale purification procedure for the restriction enzyme PstI
PstI restriksiyon enziminin saflaştırılması için küçük ölçekli yöntem geliştirilmesi
DİDEM RANA TÜRKKAN
- Çocuk adalet sisteminde çalışan uzmanların psikolojik dayanıklılık durumlarının değerlendirilmesi
Evaluation of psychological resilience of the experts working in the juvenile justice system
TUĞBA ATA SOLMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
PsikolojiÜsküdar ÜniversitesiKlinik Psikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERMİN KESEBİR
- Sınıf II bölüm 1 maloklüzyonlarda jasper jumper apareyi ile üst küçük azı ve alt-üst küçük azı çekim protokollerinin sefalometrik karşılaştırması
Cephalometric comparison of class ii division 1 patients treated with jasper jumper, 2 premolar extraction, and 4 premolar extraction protocols
IŞIL İLHAN
- COVID-19 sürecinde okulların algılanan durumları ve eğitim paydaşlarının değişen rolleri
The perceived status of schools and the changing roles of education stakeholders in the COVID-19 process
MELİKE YAYLA
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Eğitim ve ÖğretimAkdeniz ÜniversitesiEğitim Yönetimi, Teftişi, Planlaması ve Eko. Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL KAYIKÇI
