Geri Dön

Class restriction in odorant receptor gene regulation

Koku reseptörü gen regülasyonunda sınıf kısıtlaması

  1. Tez No: 246266
  2. Yazar: EMİR TINAZTEPE
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. STEFAN H. FUSS
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 106

Özet

Suda ve havada bulunan kimyasalların algılanmasında rol alan koku reseptörleri çoğu omurgalıda yedi-transmembran G protein-kenetli reseptörlerinin en büyük grubunu oluştururlar. GPKR olarak tanımlanmalarından beri KR'nin gen regülasyonu detaylı olarak çalışılmıştır. KR'nin memelilerde iki ana sınıfa, Sınıf I ve Sınıf II, ayrıldıgı gösterilmiştir ve bu olgunun KR gen ekspresyonunun çeşitli aşamalarında kısıtlayıcı bir rol oynadığına inanılmaktadır. Bu aşamalardan biri, koku alıcı nöronların ilk denemelerinde fonksiyonel bir KR ifade edememeleri durumunda alternatif bir KR seçtikleri ikinci seçim mekanizmasıdır. Zebrafish KR repertuarı tek bir adet Sınıf I KR (OR101-1) dahil olmak üzere 136 fonksiyonel KR geninden oluşmaktadır. KR repertuarının nispeten küçük boyutu, ve sadece tek bir Sınıf II KR'nün varlığı, zebrafish türünü sınıf kısıtlamasını çalışmak için ideal kılmaktadır.Soyunun Sınıf II'ye dayandığını kanıtlamak için OR101-1'in filogenetik geçmişi, insane ve zebrafish gen repertuarlarını içeren iki adet filogenetik ağaç hazırlanarak analiz edildi. OR101-1'in insan KR'lerine çok daha yakın olduğu gözlemlendi. 8 değişik zebrafish dokusuna RT-PCR analizi yapılarak, OR101-1'in koku epiteline spesifik ekspresyonu gösterildi. OR101-1'in erken gelişme dönemindeki ekspresyon motifi embryonik cDNA üzerine yapılan RT-PCR ve qRT-PCR aracığıyla gösterildi. 24 saat post-fertilizasyon kadar erken bir safhada OR101-1 ekspresyonu gözlemlendi. OR101-1'e spesifik antisens RNA riboprobları kullanılarak yapılan in situ hibridizasyon çalışmaları da önceki bulgularımızı destekledi. Son olarak, OR101-1 ekspresyonunu gözlemlememizi sağlayacak iki transgenik konstrakt tasarlandı ve kısmen klonlandı: OR101-1-IRES-Venus işaretleme konstraktı ve OR101-1 ekspres eden koku nöronlarında ikinci seçim mekanizmasını çalışmamıza olanak sağlayacak, OR101-1 kodlayıcı sekansının yerini YFP (sarı flöresan protein) sekansı ile değiştiren, YFP delesyon konstraktı.

Özet (Çeviri)

Odorant receptors which partake in the detection of both water-soluble and airborne chemicals constitute the largest family of seven-transmembrane G-Protein-Coupled Receptors in the majority of vertebrates. Since their identification as GPCR proteins, the mechanism of gene regulation in ORs has been extensively studied. It has been shown that ORs in mammals are divided into two major classes, Class I and Class II, and this phenomenon is believed to play an important restrictive role in various aspects of OR gene expression, one of which is the second choice mechanism by which olfactory sensory neurons switch to an alternate OR in case their first attempt fails at the expression of a functional OR. Zebrafish OR repertoire consists of 136 intact OR genes, including only a single Class II OR. The relatively small size of the OR repertoire and the presence of a single Class II gene, OR101-1, makes the zebrafish species an ideal model organism to study class restriction.In order to ascertain its nature as a Class II OR, the phylogenetic background of OR101-1 was analyzed by the construction of two different phylogenetic trees which include zebrafish and human OR gene repertoires. OR101-1 was shown to be much more closely related to human ORs. Olfactory epithelium-specific expression of OR101-1 was shown through RT-PCR analysis of cDNA from 8 different zebrafish tissues. Early developmental expression patterns of OR101-1 was assessed by RT-PCR, qRT-PCR of embryonic cDNA, and expression of OR101-1 as early as 24 hours post-fertilization was observed. In situ hybridization studies using OR101-1-specific antisense RNA riboprobes also corroborated our previous findings. Finally, two transgenic BAC constructs that would allow the visualization of OR101-1 expression were designed and partially cloned: an OR101-1-IRES-Venus tag construct and a YFP deletion construct replacing the OR101-1 coding sequence to study the second choice mechanism in OR101-1 expressing OSNs.

Benzer Tezler

  1. Morbid obez hastalarda ultrason kullanılarak zor havayolu tahmini

    Difficult airway prediction using ultrasound in morbidly obese patients

    SEVİM AKIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Anestezi ve ReanimasyonFırat Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ESEF BOLAT

  2. Development of a smal-scale purification procedure for the restriction enzyme PstI

    PstI restriksiyon enziminin saflaştırılması için küçük ölçekli yöntem geliştirilmesi

    DİDEM RANA TÜRKKAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1996

    Kimya MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    PROF.DR. BETÜL KIRDAR

  3. Çocuk adalet sisteminde çalışan uzmanların psikolojik dayanıklılık durumlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of psychological resilience of the experts working in the juvenile justice system

    TUĞBA ATA SOLMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    PsikolojiÜsküdar Üniversitesi

    Klinik Psikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERMİN KESEBİR

  4. Sınıf II bölüm 1 maloklüzyonlarda jasper jumper apareyi ile üst küçük azı ve alt-üst küçük azı çekim protokollerinin sefalometrik karşılaştırması

    Cephalometric comparison of class ii division 1 patients treated with jasper jumper, 2 premolar extraction, and 4 premolar extraction protocols

    IŞIL İLHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Diş HekimliğiMarmara Üniversitesi

    Ortodonti Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ. TOROS ALCAN

  5. COVID-19 sürecinde okulların algılanan durumları ve eğitim paydaşlarının değişen rolleri

    The perceived status of schools and the changing roles of education stakeholders in the COVID-19 process

    MELİKE YAYLA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Eğitim ve ÖğretimAkdeniz Üniversitesi

    Eğitim Yönetimi, Teftişi, Planlaması ve Eko. Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL KAYIKÇI