Construction and expression of a bi-functional peptide by using genetic engineering methods for bio-nanotechnologies
Biyo-nanoteknoloji için çift işlevli bir peptidin genetik mühendisliği yöntemleri ile oluşturulması ve üretilmesi
- Tez No: 251315
- Danışmanlar: PROF. DR. CANDAN TAMERLER, YRD. DOÇ. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
İşlevsel inorganik malzemelerin kontrollü olarak oluşmalarını ve düzenlenmelerini sağlamak için, inorganik yapılara bağlanabilen peptidlerin biyo-bağlayıcı ve moleküler yapı taşları olarak kullanılma potansiyelleri vardır. Genetik mühendisliği kullanılarak değiştirilmiş ve geliştirilmiş bu yapıların tasarlanması biyoteknoloji ve biyo-nanoteknoloji uygulamaları için oldukça önemlidir.Tümleşik biyolojiye dayalı moleküler kütüphaneler aracılığıyla seçilen inorganik yüzeylere bağlanabilen peptidler genellikle 7-14 amino asit uzunluğundaki kısa peptidlerdir. Bağlanma ilgisini artırmak için peptid dizilerinin ardışık tekrarları genetik mühendisliği yöntemleri ile oluşturulabilir. Kısa peptidlerin tekrarlı yapıları daha iyi bir ilgi göstererek kontrol edilebilir oluşum işlemini sağlayabilirler.Bu çalışmada, çift işlevli peptidin oluşturulması için hem quartza bağlanan peptidin hem de altına bağlanan peptidin üçlü ardışık tekrarı kullanılmıştır. İki peptid dizisi birbirine 10 amino asitten oluşan esnek bir bağlayıcı bölge ile bağlanmıştır. Peptidin üretimi için, E. coli'ye dayalı bir ekspresyon sistemi olan TAGZyme pQE-2 vektör sistemi kullanılmıştır. Vektör oluşturulmuş ve çift işlevli peptid Luria Bertani besiyerinde eksprese edilmiştir. Üretilen proteinler İmmobilize Metal Afinite Kromatografi yöntemi ile saflaştırılmıştır ve SDS-PAGE ile analiz edilmiştir.
Özet (Çeviri)
For the controlled formation and assembly of the functional inorganic materials, inorganic-binding peptides have an enormous potential to be used as bio-linkers and molecular building blocks. The design of these genetically engineered and modified systems are very important for biotechnology and bio-nanotechnology applications.Inorganic-binding peptides, selected via combinatorial biology-based molecular libraries, are generally short ones, between 7-14 amino acids. To increase binding affinity, tandem repeats of the sequence can be generated by genetic engineering. Repeated structures of short peptides may show a better affinity and provide a controlled assembly process.In this study, three tandem repeats of both quartz-binding peptide and gold-binding peptide were used to develop the bi-functional construct. Two peptide sequences were linked by a flexible peptide linker, composed of 10 amino acids. For the expression of the peptide, an E. coli-based expression system TAGZyme pQE-2 is used. The vector was constructed and the bi-functional peptide was expressed in LB medium. Expressed proteins were purified by using Immobilized Metal Affinity Chromatography and were analyzed by SDS-PAGE.
Benzer Tezler
- Molecular recognition based self assembly of engineered proteins on nanoscaled gold surfaces
Nano-ölcek metal yüzeylerde moleküler tanıma esaslı kendiliğinden montaj olabilen protein tasarımı
BANU TAKTAK KARACA
Doktora
İngilizce
2015
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CANDAN TAMERLER
YRD. DOÇ. DR. BÜLENT BALTA
- Flexible multifunctional molecular vector construction for testing affinity applications
Afinite uygulamalarını test etmeye yönelik değişken çok işlevli moleküler vektör tasarımı
HASAN KAHRAMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CANDAN TAMERLER
YRD. DOÇ. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Konya İli, Karahüyük Beldesi, Korkmaz evi restorasyon projesi
The restoration project of Korkmaz house in Karahuyuk District in Konya
SÜHEYLA KOÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiRestorasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ERSEN
- Veri akış denklemlerinin çözümü ile kod optimizasyonu
Code optimization by solving data flow equations
EROL AKARSU
Yüksek Lisans
Türkçe
1993
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiDOÇ.DR. NADİA ERDOĞAN
- Hibrid adım motorunun modellenmesi ve simülasyonu
Modelling and simulation of hybrid stepping motors
AYLİN TÜLAY USTA
Yüksek Lisans
Türkçe
1991
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. TAMER KUTMAN