Elastin kökenli peptit zincirlerinin yapısal geçişlerinin incelenmesi
Investigation of the conformational transitions of elastin-based peptide chains
- Tez No: 258734
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HANDAN ARKIN OLĞAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 100
Özet
Elastin kökenli polipeptitler olarak bilinen (VPGXG)n polipeptitleri, farklı biyolojik, biyomekanik, biyokimya ve biyofizik özellikleri ile doku mühendisliğinde başta doku, mikrotüp ve nanotüp olmak üzere birçok alanda biyomateryal üretimine uygun yapıları ile dikkat çekmektedir. Bu nedenle, bu tür peptitlerin yapısının anlaşılması önem arz etmektedir.Bu amaçla, çalışmamızda elastin kökenli polipeptitlerin yapısal özellikleri bilgisayar simülasyonları yöntemiyle incelenmiştir. Simülasyonlarımız, genelleştirilmiş küme ailesinin en güçlü algoritmalarından olan multikanonik algoritma ile gerçekleştirilmiştir. Multikanonik yöntem katı halden biyofiziğe çok geniş uygulama alanına sahiptir.Çalışmamızın ilk kısmında, n=1 alınıp X aminoasiti değiştirilerek aminoasitlerin hidrofobisite skalası oluşturulmuş, ardından farklı solüsyonlarda termodinamik büyüklükler hesaplanmıştır. Son olarak, n=1, 2, 3 seçilerek küçük moleküllerden büyüklere geçişte yapısal özelliklerdeki farklılıklar belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
(VPGXG)n polypeptides known as elastin-like polypeptides with different biological, biomechanical, biochemical and biophysical properties stand out suitable structures appropriate for production of several biomaterials, in the first instance, tissue, microtube and nanotube in tissue engineering. Therefore, understanding the structural properties of such peptides comes into prominence.For this purpose, structural properties of elastin-like polypeptides have been investigated by computer simulation methods in our study. Our simulations have been carried out by multicanonical algorithm, the most powerful algorithm in generalized ensemble family. Multicanonical method has a wide range of application area from solid state to biophysics.By taking n=1 and changing aminoacid X, hydrophobicity scale has been established in the forepart of our study, afterwards the thermodaynamical quantities have been determined in different solvents. Finally, by choosing n=1, 2, 3 structural properties have been determined when progression from small molecules to larger ones.
Benzer Tezler
- Adipöz kökenli erişkin kök hücre ekilmiş kollajen-elastin matriks yardımı ile kondroid doku elde edilmesi
Production of chondroid tissue by using adipose derived stem cells seeded into collagen-elastin matrix
HASAN ATEŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
BiyomühendislikDokuz Eylül ÜniversitesiCerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. ADNAN MENDERES
- Biyouyumlu damar greftlerinin mikromekanik özelliklerinin nanoindentasyon ile belirlenmesi
Determination of micromechanical properties of biocompatible vascular grafts by nanoindentation
EMEL BERNA YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyomühendislikTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİNAN EĞRİ
DOÇ. DR. MUSTAFA OĞUZHAN ÇAĞLAYAN
- Farklı kökenli agregalar içeren yüksek mukavemetli betonların elastik özelliklerinin incelenmesi
Investigation of the elastic properties of high strength concretes including different types of aggregates
AYDIN KARADAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. HASAN YILDIRIM
- Farklı kökenli agregalarla üretilmiş normal ve yüksek mukavemetli betonlarda agrega konsantrasyonunun mekanik özelliklere etkisi
Effects of aggregate volume fraction on mechanical properties of normal and high strength concrete produced with aggregate from different origins
ADİL ORÇUN KAYA
Doktora
Türkçe
2017
İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN YILDIRIM
- Gümüşhane il merkezindeki magmatik kökenli kayaların jeomekanik özelliklerinin araştırılması
Investigation of the geomechanical properties of magmatic origin rocks in Gümüşhane province
FATİH ALKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Jeoloji MühendisliğiGümüşhane ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SERHAT DAĞ