Geri Dön

Elastin kökenli peptit zincirlerinin yapısal geçişlerinin incelenmesi

Investigation of the conformational transitions of elastin-based peptide chains

  1. Tez No: 258734
  2. Yazar: MUSTAFA BİLSEL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HANDAN ARKIN OLĞAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 100

Özet

Elastin kökenli polipeptitler olarak bilinen (VPGXG)n polipeptitleri, farklı biyolojik, biyomekanik, biyokimya ve biyofizik özellikleri ile doku mühendisliğinde başta doku, mikrotüp ve nanotüp olmak üzere birçok alanda biyomateryal üretimine uygun yapıları ile dikkat çekmektedir. Bu nedenle, bu tür peptitlerin yapısının anlaşılması önem arz etmektedir.Bu amaçla, çalışmamızda elastin kökenli polipeptitlerin yapısal özellikleri bilgisayar simülasyonları yöntemiyle incelenmiştir. Simülasyonlarımız, genelleştirilmiş küme ailesinin en güçlü algoritmalarından olan multikanonik algoritma ile gerçekleştirilmiştir. Multikanonik yöntem katı halden biyofiziğe çok geniş uygulama alanına sahiptir.Çalışmamızın ilk kısmında, n=1 alınıp X aminoasiti değiştirilerek aminoasitlerin hidrofobisite skalası oluşturulmuş, ardından farklı solüsyonlarda termodinamik büyüklükler hesaplanmıştır. Son olarak, n=1, 2, 3 seçilerek küçük moleküllerden büyüklere geçişte yapısal özelliklerdeki farklılıklar belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

(VPGXG)n polypeptides known as elastin-like polypeptides with different biological, biomechanical, biochemical and biophysical properties stand out suitable structures appropriate for production of several biomaterials, in the first instance, tissue, microtube and nanotube in tissue engineering. Therefore, understanding the structural properties of such peptides comes into prominence.For this purpose, structural properties of elastin-like polypeptides have been investigated by computer simulation methods in our study. Our simulations have been carried out by multicanonical algorithm, the most powerful algorithm in generalized ensemble family. Multicanonical method has a wide range of application area from solid state to biophysics.By taking n=1 and changing aminoacid X, hydrophobicity scale has been established in the forepart of our study, afterwards the thermodaynamical quantities have been determined in different solvents. Finally, by choosing n=1, 2, 3 structural properties have been determined when progression from small molecules to larger ones.

Benzer Tezler

  1. Adipöz kökenli erişkin kök hücre ekilmiş kollajen-elastin matriks yardımı ile kondroid doku elde edilmesi

    Production of chondroid tissue by using adipose derived stem cells seeded into collagen-elastin matrix

    HASAN ATEŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyomühendislikDokuz Eylül Üniversitesi

    Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. ADNAN MENDERES

  2. Biyouyumlu damar greftlerinin mikromekanik özelliklerinin nanoindentasyon ile belirlenmesi

    Determination of micromechanical properties of biocompatible vascular grafts by nanoindentation

    EMEL BERNA YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyomühendislikTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİNAN EĞRİ

    DOÇ. DR. MUSTAFA OĞUZHAN ÇAĞLAYAN

  3. Farklı kökenli agregalar içeren yüksek mukavemetli betonların elastik özelliklerinin incelenmesi

    Investigation of the elastic properties of high strength concretes including different types of aggregates

    AYDIN KARADAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. HASAN YILDIRIM

  4. Farklı kökenli agregalarla üretilmiş normal ve yüksek mukavemetli betonlarda agrega konsantrasyonunun mekanik özelliklere etkisi

    Effects of aggregate volume fraction on mechanical properties of normal and high strength concrete produced with aggregate from different origins

    ADİL ORÇUN KAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HASAN YILDIRIM

  5. Gümüşhane il merkezindeki magmatik kökenli kayaların jeomekanik özelliklerinin araştırılması

    Investigation of the geomechanical properties of magmatic origin rocks in Gümüşhane province

    FATİH ALKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Jeoloji MühendisliğiGümüşhane Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SERHAT DAĞ