Genetic mapping and characterization of eggplant for glycoalkaloid content
Patlıcanda glikoalkaloid içeriğinin karakterizasyonu ve genetik haritalama
- Tez No: 266592
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SAMİ DOĞANLAR, YRD. DOÇ. DR. RİTCHİE EANES
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Patlıcan dahil çoğu bitki böceklere, patojenlere ve hayvanlara karşı toksinleri üretir. Bu toxinlerin en geniş sınıfı alkaloidlerdir. Genellikle bitkiler alkaloidleri glikoalkaloid olarak adlandırılan glikosidik formda üretirler. Glikoalkaloidlerin insan sağlığı üzerinde toksik etkileri vardır. Örneğin; hücre membranını parçaladıklarından dolayı gastrointestinal bölge ve diğer organlarda hasara yol açar. Glikoalkaloidler sadece toksik değildirler, yararlı etkileri de vardır. Örneğin kolesterol seviyesini düşürürler ve antikanser aktiviteleri vardır. Ayrıca steroidal ilaçların öncüsü olarak kullanılırlar. Bu nedenle glikoalkaloid izolasyonu ve glikoalkaloid içeriğinin belirlenmesi önem taşır.Bu amaçla kolon kromatografisi gerçekleştirilmiş ve solamargine ve solasonine elde edilmiştir. Solanum Lineanum türünden toplamda 122, 8 mg solamargine, solasonine, solamargine ve solasonine karışımı elde edilmiştir. 1H NMR ve kütle spektroskopisi ile doğruluğu kontrol edilmiştir. Glikoalkaloid içeriğinin belirlenmesi için mobil faz, pH, sıcaklık, akış hızı ve kolon tipi gibi çeşitli parametreler değiştirilerek HPLC metodu geliştirilmiştir. Fosfat tamponu kullanmadan RP kolon kullanılarak glikoalkaloidlerin ayrımının yeterli olmadığı bulunmuştur. Buna karşılık karbohidrat kolonda glikoalkaloidlerin ayrımı daha iyidir, fakat bu tip kolonlar stabil değildir.Ayrıca CAPs metodu ve COSII işaretleyicileri kullanılarak bağlantı haritası oluşturulmuştur.385 COS II işaretleyicisi ve 221 SSR işaretleyicisi kontrol edilmiş ve 38 tane COS II, 28 tane SSR işaretleyicisi polimorfik bulunmuş; bunlardan 52 tanesi haritalanmıştır.
Özet (Çeviri)
Most plants including eggplant, produce toxins against insects, pathogens and animals. The biggest class of these toxins is alkaloids. Generally plants produce alkaloids in a glycosidic form which are called glycoalkaloids. Glycoalkaloids have toxic effects on human health. For example, as a result of disrupting the cell membrane, the gastrointestinal track and other organs are damaged. Glycoalkaloids are not only toxic to human health but also they have beneficial effects. For example, they decrease cholesterol level, and have anticancer activity. And also they are used as a precursor for steroidal drugs. Therefore, isolation and determination of glycoalkaloids content is important.For this aim, column chromatography was performed and solamargine and solasonine were obtained. Totally 122,8 mg solamargine, solasonine and solamargine and solasonine mix from Solanum linnaeanum were obtained. Their identities were confirmed via 1H NMR and mass spectroscopy. For determination of glycoalkaloid content HPLC method was developed via changing different parameters such as mobile phase, pH, temperature, flow rate and column type. It was found that separation of glycoalkaloids by using RP column without phosphate buffer was not sufficient. On the other hand, separation of glycoalkaloids by using carbohydrate column was better but this type of column is not stable.Furthermore, linkage mapping was performed by using CAPs and SSR methods; and 385 COSII markers and 221 SSR markers were tested. Of the tested markers, 38 of the COS II markers and 28 of the SSR markers were found to be polymorphic. A total of 52 of these markers were mapped.
Benzer Tezler
- Characterization of glycoalkaloid content and molecular mapping in eggplant
Glykoalkaloid içereğinin karakterize edilmesi ve patlıcanda moleküler haritalama
ÖYKÜM KIRSOY
Yüksek Lisans
İngilizce
2006
Biyokimyaİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ANNE FRARY
YRD. DOÇ. DR. RİTCHİE EANES
- Characterization and genetic mapping of health related traits in tomato
Domateste sağlıklı ilgili karakterlerin belirlenmesi ve genetik haritalanması
DANE RUSÇUKLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SAMİ DOĞANLAR
DOÇ. DR. ANNE FRARY
- Genetic characterization of 150 F6-inbread durum wheat lines derived from kunduru-1149xcham-1 cross using molecular markers and economically important traits
F6 kademesindeki kendilenmiş 150 kunduru-1149xcham-1 melezi makarnalık buğday hattının moleküler belirteçler ve ekonomiksel önemli karakterler kullanılarak genetik olarak tanımlanması
BELGİN GÖÇMEN
- İncir genotiplerinin karakterizasyonu ile cinsiyet ve bazı meyve özellikleri için ilişkilendirme haritalaması yöntemi ile moleküler işaretleyicilerin belirlenmesi
Characterization of fig genotypes and development of molecular markers for sex determination and some important fruit features using association mapping
HATİCE IKTEN
Doktora
Türkçe
2007
ZiraatEge ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. NEDİM MUTLU
PROF.DR. UYGUN AKSOY
- Kalıtsal aritmojenik hastalıklarla ilişkili yeni genlerin, gen haritalama, pozisyonel klonlama, ve aday gen tarama yöntemleri ile tanımlanması
Identification of new genes involved in hereditary arrhythmogenic diseases by gene mapping, positional cloning and candidate gene screening
ECE SELEN ŞAHİN