Geri Dön

Hematolojik malignitelerde GADD45 epigenetik disregülasyonu

Epigenetic dysregulation of GADD45 in hematologic malignancies

  1. Tez No: 267616
  2. Yazar: ENİSE ÇAVUŞOĞLU
  3. Danışmanlar: DR. CAN ERZİK, PROF. DR. BEYAZIT ÇIRAKOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 59

Özet

GADD45 gen ailesi hücrede DNA hasarına cevap oluşturulması ve hücre bölünmesinin durdurulması süreçlerinde etkili olan, nükleer proteinler GADD45?,ß ve ?' yı kodlar. Her üç GADD45 gen ailesi üyesi de MTK1 kinazı aktive ederek p38/c-jun-NH2-kinaz aktivasyonunu ve apoptozu indüklemektedir. Yapılan çalışmalarda GADD45?'nın tümör hücrelerinin koloni oluşturmasını ve bölünmesini baskıladığı gösterilmiştir. Ayrıca birçok kanser türünde GADD45?'nın metile durumda bulunduğu ve metilasyonun ekspresyonu baskıladığı gösterilmiştir. Yapılan çalışmanın amacı hematolojik malignitelerde GADD45? promotorunun metilasyon durumunun belirlenmesi ve metilasyonun ekspresyona etkisinin saptanmasıdır. Bunun için hemotolojik malignite hücre soylarından ve 117 akut miyeloid lösemi (AML), 94 multipl miyelom (MM) teşhisi konmuş hastadan alınan kan ve kemik iliği örneklerinden DNA izolasyonu yapılmıştır. Bisülfit modifikasyonunun ardından örneklerle metilasyon spesifik polimeraz zincir reaksiyonu (MSP) yapılmıştır. Non-Hodgkin lenfoma hücre serileri L?428 ve L?1236, Burkitt lenfoma hücre serisi Raji hücrelerinde GADD45? promotoru tamamiyle metillenmiş olduğu, AML hücre serileri GDM?1, HL?60, KG1a ve MM hücre serisi OPM?2 hücrelerinde ise kısmen metillenmiş olduğu görülmüştür. İncelenen AML hasta örneklerinde metilasyon saptanmazken 94 MM hasta örneğinden 8'inde metilasyon saptanmıştır. İstatistiksel hesaplamalar sonucunda metilasyon saptanan hastalarda ortalama kalsiyum düzeyinin metilasyon görülmeyenlere oranla daha yüksek olduğu görülmüştür. Ayrıca GADD45?'nın metile durumda olduğu hastaların ortalama sağ kalım sürelerinin 13,7 ay, genin metillenmemiş olarak bulunduğu hastalarda ise bu sürenin 57,1 ay olduğu görülmüştür. Metilasyonun genin ekspresyonuna etkisinin belirlenmesi amacıyla hücre soyları DNA metiltransferaz (DNMT) inhibitörü DAC ile 96 saat boyunca inkübe edilmiş ve RT-PCR uygulanmıştır. GADD45? promotorunun tamamiyle metillenmiş durumda bulunduğu L?1236 hücrelerinde DAC uygulaması sonrası genin ekspresyonunda değişiklik olmazken, Raji, L?428, HL?60, KG1a, OPM?2 hücrelerinde DAC uygulaması sonrası genin ekspresyonunda artış gözlemlenmiştir. Elde edilen bulgular hemotolojik malignitelerde GADD45? geninin tümör tipine bağlı olarak epigenetik mekanizmalarla sessizleştirilebileceğini göstermiştir.

Özet (Çeviri)

GADD45 gene family encodes the nuclear proteins, GADD45?, ß and ?, which response to damage in DNA in a cell and stopping cell proliferation. It has been shown from the research conducted in recent years that GADD45? suppresses the colony formation and proliferation of tumor cells.The purpose of this study is to determine the methylation state of GADD45? promoter in hemotologic malignities and the effect of methylation on expression. Therefore, DNA isolation is performed on blood and bone marrow samples of 117 acute myeloid leukemia (AML), and 94 multiple myelom (MM) patients and hematologic malignency cell lines . After the bisulfide modification of DNA, methylation specific polymerase chain reaction (MSP) has been performed on the samples. It has been found that, in Hodgkin lymphoma cell lines L-428 and L-1236 and Burkitt lymphoma cell lines Raji, GADD45? promoter was fully methylated. However in AML cell lines GDM-1, HL-60, KG1a and MM cell lines OPM-2 , GADD45? promoter has been found to be partially methylated. No methylation was found in AML patient samples whereas 8 of of 94 MM patient samples show promoter methylation. The survival time of the patients with methylated GADD45? is 13.7 months, whereas the survival time of the patients with unmethylated GADD45? is 57.1 months. In order to understand the effect of methylation on the gene expression, the cell lines were treated with DNA methyltransferase inhibitor (DAC) for 96 hours and then real-time polymerase-chain reaction (RT-PCR) was performed. In L-1236 cells where GADD45? promoter was fully methylated, there has been no change in gene expression after DAC treatment whereas in Raji, L-428, HL-60, KG1a and OPM-2 cells, an increase in gene expression has been observed after DAC treatment,. The findings of this study indicate that in hemotoligic malignancies, GADD45? gene may be silenced in epigenetic mechanisms according to the type of tumor.

Benzer Tezler

  1. Hematolojik malignitelerde allojenik kök hücre nakli sonrası B ve T hücre kimerizmi değerlendirilmesi

    Evaluation of B and T cell chimerism after allogeneic stem cell transplantation in hematologic malignancies

    METBAN MASTANZADE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Hematolojiİstanbul Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVGİ BEŞIŞIK

  2. Akut myeloid lösemi tanısı ile takip edilen hastaların febril nötropenik ataklarının tek merkezli ve geriye dönük değerlendirilmesi

    Evaluation of febrile neutropenia attacks of patients following with acute myeloid leukemia retrospective and single center experience

    ZEHRA ERDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    HematolojiEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ VURAL

  3. Hematolojik malignitelerde kan grubu dağılımının incelenmesi

    Investigation of blood group distribution in hematologic malignancies

    METE ERDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    HematolojiAtatürk Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FUAT ERDEM

  4. Hematolojik malignitelerde semptom kontrolü

    Symptom control in hematological malignancies

    ZÜHAL MEHREKULA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    HematolojiEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. Z. ÇİÇEK FADILOĞLU

  5. Hematolojik malignitelerde kolesterol seviyelerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of cholesterol levels in hematological malignities

    YÜCEL KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    HematolojiZonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MÜZEYYEN ASLANER AK