Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen Cytomegalovırus (CMV) suşlarının genotiplerinin araştırılması

Investigation of genotypes of Cytomegalovirus (CMV) strains isolated in clinical samples.

  1. Tez No: 272696
  2. Yazar: AYTEKİN KILINÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SELMA GÖKAHMETOĞLU
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Sitomegalovirus, genotip, pyrosekans, glikoprotein B, Cytomegalovirus, genotypes, pyrosequencing, glycoprotein B
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Amaç: CMV gB genotipleme açısından en çok üstünde çalışılan proteindir. Doğada bulunmakta olan CMV suşlarında bugüne kadar dört farklı gB genotipi (gBl-4) tarif edilmiştir. Bu çalışmada klinik örneklerden izole edilen CMV suşlarının genotiplerinin araştırılması amaçlandı.Materyal ve Metod: Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanelerinin poliklinik ve servislerinde takip edilen hastalara ait örneklerden CMV DNA'sı pozitif bulunanlar çalışmaya alındı. Çalışmaya 53 farklı hastadan elde edilen toplam 74 örnek dahil edildi. Örnekler plazma, nazotrakeal aspirat (NTA), bronkoalvoeler lavaj (BAL) idi. CMV genotiplerinin araştırılması pyrosekans yöntemi ile (Pyromark Qiagen-Almanya) yapıldı.Bulgular: CMV genotiplerinin dağılımı ; 33/74'ünde gB1 (%45), 7/74'ünde gB2 (%9), 14/74'ünde gB3 (%19), 2/74'ünde gB4 (%4), 18/74'ünde miks genotip (%24) olarak bulundu. Miks genotip bulunan 17 hastanın 18 klinik örneğinin 10 (%55)'unda gB1+gB3, 4 (%22)'ünde gB2+gB3 , 2 (%11)'sinde gB1+gB2, 1 (%6) 'inde gB1+gB4 , 1 (%6) 'indede gB2+gB4 olarak bulundu.Sonuç: Sonuç olarak çalışmaya dahil edilen hastalarda en sık CMV genotip gB1 bulundu. CMV gB1'den sonra en sık görülen genotip miks genotip idi. Bir hastada birden fazla CMV genotip analizinin yapılmasının miks genotip bulunma oranını artıracağı kanaatine varıldı.

Özet (Çeviri)

Aim: CMV glycoproteins B is the most studied protein in terms of genotype. So far four different gB genotypes (gB1-4) have been identified in CMV strains found in nature. In this study, it was aimed to investigate genotypes of Cytomegalovirus (CMV) strains isolated in clinical samples.Materials and Method: CMV DNA positive samples that have been taken from patients who treated in Erciyes University Faculty of Medicine polyclinics and services were included in the study. A total of 74 samples obtained from 53 different patients were used in the study. Samples were plasma, nasotracheal aspirat (NTA), bronchoalveolar lavage (BAL). CMV genotypes of samples were investigated by pyrosequencing (Pyromark Qiagen-Germany).Results: The distribution of CMV genotypes was: In 33/74 gB1 (45%), in 7/74 gB2 (9%), in 14/74 gB3 (19%), in 2/74 gB4 (4%) and in 18/74 mix genotypes (24%). Mix genotypes were found in 18 clinical samples obtained from 17 patients , distribution of mix genotypes was; 10 gB1+gB3 (55%), 4 (22%) gB2+gB3, 2 (11%) gB1+gB2, 1 (6%) gB1+gB4 and 1 (6%) gB2+gB4.Conclusion: As a result, CMV genotype gB1 was detected most frequently in the patients included in the study. Following CMV gB1, the most frequently observed genotype was mix genotype. It is conclued that CMV genotype analysis more than once in one patient can increase the ratio of mix genotypes

Benzer Tezler

  1. Klinik örneklerden izole edilen cytomegalovırus (CMV) suşlarında antiviral ilaç direnci araştırılması

    Investigation of antiviral drug resistance in cytomegalovirus (CMV) strains isolated from clinical samples

    PINAR GÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL AYDOĞAN

  2. Klinik örneklerden izole edilen cytomegalovirüs (CMV) suşlarında gansiklovir direncinin araştırılması

    Investigation of ganciclovir resistance in the cytomegalovirus (CMV) strains isolated from clinical samples

    SAFİYE DELİCE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELMA GÖKAHMETOĞLU

  3. Cytomegalovırus enfeksiyonlarında genotip ve antiviral ilaç direncinin klinik ile ilişkisi

    Clinical relationship of genotype and antiviral drug resistance in cytomegalovirus infections

    GİZEM AKATMACI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜNEŞ ÖZÇOLPAN

  4. Klinik örneklerden izole edilen pesudomonas aeruginosa suşlarının SDS-page protein profilleri, antibiyotik duyarlılıkları, biyokimyasal ve piyosin tiplendirimi

    SDS-page protein profiles, antibotic sensitivity, biocehimical and pycin typing of pseudomonas aeruginosa strains isolated from various clinical specime

    BELGİN ALTINOK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    BiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Eğitimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CUMHUR ÇÖKMÜŞ

  5. Klinik örneklerden izole edilen kandidaların tiplendirilmesi ve antifungal ajanlara duyarlılıkları

    The Identification and antifungal sensitivity of candida strains that are isolated from clinical specimens

    SELMA GÖLLER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN YULUĞ