Çevre enterokoklarında linkozamidlere inaktivasyon yoluyla direnç
Resistance to lincosamides by inactivation among environmental enterococcus
- Tez No: 283436
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BÜLENT BOZDOĞAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 108
Özet
Bu çalışmada Enterococcus faecium ADU1 suşunda tespit edilen linkozamid direncinin mekanizmasının belirlenmesi ve transfer tespiti amaçlanmıştır. Gots' testiyle linkozamidlere direncin inaktivasyon yoluyla olduğu tespit edilmiştir. Çevreden izole edilen Enterococcus faecium ADU1 suşunda linkozamidlere direnç sağlayan linA, linB, lnu(C) ve lnu(D) genlerinin varlığı PCR yoluyla araştırılmış ve linB geni için bu suşun pozitif olduğu saptanmıştır. Direnç geni Enterococcus faecalis JH2-2 suşuna konjugasyonla aktarılmış ve transkonjugantlarının PFGE profili analizi sonucu plazmidik bir geçiş olduğu düşünülmüştür. Invers PCR yöntemi kullanılarak linB geninin üzerinde bulunduğu genetik elemanın tespitine çalışılmıştır. Invers PCR ile elde edilen amplikonun DNA dizi analiz sonucu Enterococcus faecium ADU1 izolatındaki linB geninin üzerinde bulunduğu genetik elemanın, daha önce Enterococcus faecalis'de tanımlanmış olan pEF418 plazmidi ile sekans homolojisi gösterdiği belirlenmiştir. Konfirmasyon amacıyla pEF418 plazmidine özgü genlerin Enterococcus faecium ADU1 izolatında varlığı spesifik primerlerle PCR yapılarak ve amplikon sekanslanarak araştırılmış ve doğrulanmıştır.Sonuç olarak çevre suşundan ilk kez linkozamidlerin inaktivasyonuna bağlı direnç tespit edilmiş ve şimdiye dek yalnızca insanda ve hayvanda enfeksiyon etkeni olan suşlarda görülen nükleotidiltransferazların çevre suşlarında da olabileceği gösterilmiştir. Bu genin transfer edilebilir bir plazmid üzerinde olması enfeksiyon etkeni olan suşlara geçişini ve direncin yaygınlaşmasını kolaylaştıracaktır.
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to determine the mechanism of lincosamide resistance of Enterococcus faecium ADU1 strain. Transferability of lincosamide resistance was also tested. Lincosamide inactivation of this strain was determined by Gots? test. Presence of lincosamide inactivation genes linA, linB, lnu(C) and lnu(D) genes in ADU1 strain was tested and this strain was found positive for linB. Transferability of inactivation gene to Enterococcus faecalis JH2-2 strain was investigated by conjugation. Analysis of transconjugant?s PFGE profile indicated a a plasmidic transfer of resistance. Inverse PCR method was used to determine the genetic environment of linB gene. Sequence analysis of amplicon obtained by inverse PCR indicated that linB gene was carried on a previously described plasmid, pEF418. Using specific primers for pEF418E amplicons were obtained and sequence analysis confirmed that ADU1 carries pEF418.Lincosamide inactivation genes were reported previously only in strains isolated from human and animal samples. To the best of our knowledge for the first time we showed presence of a lincosamides inactivation gene in an environmental sample. As a result presence of nucleotidyl transferases gene in environmental isolates was confirmed with our study. The fact that this gene is carried on a transferable plasmid indicates the possibility of quick dissemination of this gene in the environment.
Benzer Tezler
- Çeşitli çevresel kaynaklardan izole edilen enterokokların disk difüzyon yöntemi ile antibiyotik duyarlılıklarının tespiti
Determination of antimicrobial susceptibility of enterococci isolated from various environmental sources by disc diffusion method
ERMAN ORYAŞIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
BiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. HACI HALİL BIYIK
- Vankomisine dirençli enterokoklarda moleküler epidemiyolojik analiz
Molecular epidemiologic analysis on vancomycin resistant enterococci
FARUK KARAKEÇİLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
MikrobiyolojiUludağ ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CÜNEYT ÖZAKIN
- Enterokoklarda yüksek düzey aminogıikozid direnci
Başlık çevirisi yok
GÖNÜL ÇİÇEK ŞENTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. PAŞA GÖKTAŞ
- Vankomisine dirençli enterokokların moleküler epidemiyolojisi
Molecular epidemiology of vancomycin resistant enterococci
BARIŞ DERYA ERÇAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DUYGU PERÇİN
- Vankomisine dirençli enterokokların önemli hastane yüzeylerinde canlı kalabilme süreleri ve acinetobacter baumannii izolatları ile etkileşimlerinin araştırılması
Survival time of vacomycin resistant enterococcus on important hospital surfaces and investigate the interaction with acinebacter baumannii strains
VİLDAN BİLGİÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. KEMAL ALTAŞ