Geri Dön

Çevre enterokoklarında linkozamidlere inaktivasyon yoluyla direnç

Resistance to lincosamides by inactivation among environmental enterococcus

PDF İndir

  1. Tez No: 283436
  2. Yazar: EMİNE BİLİR BAŞ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BÜLENT BOZDOĞAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 108

Özet

Bu çalışmada Enterococcus faecium ADU1 suşunda tespit edilen linkozamid direncinin mekanizmasının belirlenmesi ve transfer tespiti amaçlanmıştır. Gots' testiyle linkozamidlere direncin inaktivasyon yoluyla olduğu tespit edilmiştir. Çevreden izole edilen Enterococcus faecium ADU1 suşunda linkozamidlere direnç sağlayan linA, linB, lnu(C) ve lnu(D) genlerinin varlığı PCR yoluyla araştırılmış ve linB geni için bu suşun pozitif olduğu saptanmıştır. Direnç geni Enterococcus faecalis JH2-2 suşuna konjugasyonla aktarılmış ve transkonjugantlarının PFGE profili analizi sonucu plazmidik bir geçiş olduğu düşünülmüştür. Invers PCR yöntemi kullanılarak linB geninin üzerinde bulunduğu genetik elemanın tespitine çalışılmıştır. Invers PCR ile elde edilen amplikonun DNA dizi analiz sonucu Enterococcus faecium ADU1 izolatındaki linB geninin üzerinde bulunduğu genetik elemanın, daha önce Enterococcus faecalis'de tanımlanmış olan pEF418 plazmidi ile sekans homolojisi gösterdiği belirlenmiştir. Konfirmasyon amacıyla pEF418 plazmidine özgü genlerin Enterococcus faecium ADU1 izolatında varlığı spesifik primerlerle PCR yapılarak ve amplikon sekanslanarak araştırılmış ve doğrulanmıştır.Sonuç olarak çevre suşundan ilk kez linkozamidlerin inaktivasyonuna bağlı direnç tespit edilmiş ve şimdiye dek yalnızca insanda ve hayvanda enfeksiyon etkeni olan suşlarda görülen nükleotidiltransferazların çevre suşlarında da olabileceği gösterilmiştir. Bu genin transfer edilebilir bir plazmid üzerinde olması enfeksiyon etkeni olan suşlara geçişini ve direncin yaygınlaşmasını kolaylaştıracaktır.

Özet (Çeviri)

The aim of this study was to determine the mechanism of lincosamide resistance of Enterococcus faecium ADU1 strain. Transferability of lincosamide resistance was also tested. Lincosamide inactivation of this strain was determined by Gots? test. Presence of lincosamide inactivation genes linA, linB, lnu(C) and lnu(D) genes in ADU1 strain was tested and this strain was found positive for linB. Transferability of inactivation gene to Enterococcus faecalis JH2-2 strain was investigated by conjugation. Analysis of transconjugant?s PFGE profile indicated a a plasmidic transfer of resistance. Inverse PCR method was used to determine the genetic environment of linB gene. Sequence analysis of amplicon obtained by inverse PCR indicated that linB gene was carried on a previously described plasmid, pEF418. Using specific primers for pEF418E amplicons were obtained and sequence analysis confirmed that ADU1 carries pEF418.Lincosamide inactivation genes were reported previously only in strains isolated from human and animal samples. To the best of our knowledge for the first time we showed presence of a lincosamides inactivation gene in an environmental sample. As a result presence of nucleotidyl transferases gene in environmental isolates was confirmed with our study. The fact that this gene is carried on a transferable plasmid indicates the possibility of quick dissemination of this gene in the environment.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    213638

    Çeşitli çevresel kaynaklardan izole edilen enterokokların disk difüzyon yöntemi ile antibiyotik duyarlılıklarının tespiti

    Determination of antimicrobial susceptibility of enterococci isolated from various environmental sources by disc diffusion method

    ERMAN ORYAŞIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. HACI HALİL BIYIK

  2. Tez No

    307350

    Vankomisine dirençli enterokoklarda moleküler epidemiyolojik analiz

    Molecular epidemiologic analysis on vancomycin resistant enterococci

    FARUK KARAKEÇİLİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CÜNEYT ÖZAKIN

  3. Tez No

    615661

    Enterokoklarda yüksek düzey aminogıikozid direnci

    Başlık çevirisi yok

    GÖNÜL ÇİÇEK ŞENTÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. PAŞA GÖKTAŞ

  4. Tez No

    281324

    Vankomisine dirençli enterokokların moleküler epidemiyolojisi

    Molecular epidemiology of vancomycin resistant enterococci

    BARIŞ DERYA ERÇAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DUYGU PERÇİN

  5. Tez No

    164311

    Vankomisine dirençli enterokokların önemli hastane yüzeylerinde canlı kalabilme süreleri ve acinetobacter baumannii izolatları ile etkileşimlerinin araştırılması

    Survival time of vacomycin resistant enterococcus on important hospital surfaces and investigate the interaction with acinebacter baumannii strains

    VİLDAN BİLGİÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. KEMAL ALTAŞ

Geri Dön