Anaerobik fungus Orpinomyces sp.'ye ait selülaz geninin klonlanması, karakterizasyonu ve enzim aktivitesinin belirlenmesi
Cellulase gene cloning, characterization and determination of enzyme activity in anaerobic fungi Orpinomyces sp.
- Tez No: 284466
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. İSMAİL AKYOL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 83
Özet
Bu çalışmanın amacı anaerobik ruminal fungus Orpinomyces sp.'nin selülolitik özelliğini araştırmaktır. Bu amaç doğrultusunda Zootekni Bölümü BİGEM (Biyoteknoloji ve Gen Mühendisliği Laboratuarı) anaerobik kültür koleksiyonundan sağlanan Orpinomyces sp. (GMLF19)'in çeşitli karbon kaynaklarında selülaz, likenaz ve ksilanaz üretimi belirlenmiştir. Orpinomyces sp. (GMLF19)'un kromozomal DNA'sından bir selülaz geni (Cel19A) izole edilmiş ve E.coli (E.coli C19)'ye klonlanmıştır. Cel19A gen bölgesinin nükleotit dizisinin analizi sonucunda bu genin 2 dokerin domain ve bir katalitik domain'e sahip, 1.585 bç uzunluğunda olduğu görülmüştür. Kodladığı proteinin 50588,35 Da molekül büyüklüğünde, glikozil hidrolaz 6 ailesine ait bir protein olduğunu göstermiştir. E.coli'de Cel19A enzim aktivitesinin büyük bir kısmının hücresel olduğu bulunmuştur ve karboksimetilselüloz'a karşı en yüksek aktiviteyi pH 6.0 ve 30 oC'da gösteriken likenan'a karşı ise pH 5.5 ve 40 oC'da göstermiştir. Ayrıca likenaz aktivitesi 40 oC stabilitesini korurken, 50 oC'de 5 dk içerisinde aktivitesinin tamamını kaybetmiştir.
Özet (Çeviri)
The purpose of this study is to investigate cellulolytic feature of ruminal anaerobic fungi Orpinomyces sp. For this reason, Orpinomyces sp. (GMLF19) was obtained from the culture collection of Animal Science Department BIGEM (Biotechnology and Gene Engineering Laboratory) and cellulase, lichenase and xylanase production determined in various carbon sources. cel19A gene was amplified from Orpinomyces sp. (GMLF19) chromosomal DNA, cloned into pCT vector and expressed in Escherichia coli (E.coli C19). Sequenced 1.585 bp length C19 regions showed that gene containing two dockerin domain and one catalytic domain. Encoded protein has 50588,35 Da molecular mass and enzyme belong to family glycosyl hydrolase 6. In E.coli C19, big proportion of cellulase enzyme activity was found in the cellular part. High level the enzyme expression in carboxymethylcellulose and lichena substrate were found at pH 6.0, pH 5.5 and at 30 oC at 40 oC, respectively. In addition, the lichenase activity was found stable at 40 oC, but the enzyme lost activity when temperature increased 50 OC.
Benzer Tezler
- Anaerobik ruminal fungus Orpinomyces sp. ve Neocallimastix sp.nin amilolitik özelliklerinin araştırılması
Amylolytic activities of anaerobic ruminal fungi Orpinomyces sp. and Neocallimastix sp.
BEKİR MEHMET KELLECİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR ÇÖMLEKCİOĞLU
- Uçucu yağların bazı rumen funguslarının yaşamsal ve fibrolitik enzim sistemleri üzerine etkisinin araştırılması
The effects of essential oils on the survival and fibrolitic enzyme activities of some rumen fungi
KADRİYE DALFESOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyoteknolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SAİT EKİNCİ
- Improvement of biogas production by fungal treatment during the conversion of agricultural biomass into energy and digestate
Fungal arıtım uygulanan lignoselülozik biyokütleden biyogaz üretiminin artırılması ve son ürünlerin değerlendirilmesi
ÇAĞRI AKYOL
Doktora
İngilizce
2019
Çevre MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAHAR İNCE
- Anaerobik gut fungus ve bakterilerinin konjuge linoleik asit üretim potansiyellerinin in vitro olarak belirlenmesi
Determination of conjugated linoleic acid production potential of anaerobic gut fungi and bacteria in vitro
KÜBRA EKİNCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
GenetikKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİN ÖZKÖSE
- Rumen bakteri ve funguslarının bazı enzimlerinin moleküler düzeyde karakterisazyonu
Molecular characterization of some enzymes in rumen bacteria and fungi
HALİT YÜCEL
Doktora
Türkçe
2022
BiyoteknolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SAİT EKİNCİ