Geri Dön

Characterization of FAM134B in the context of hepatocellular carcinoma and endoplasmic reticulum stress

FAM134B?nin karaciğer kanseri ve endoplazmik retikulum stresi konularındaki özelliklerinin belirlenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 286303
  2. Yazar: MUSTAFA YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 115

Özet

FAM134B (Family with sequence similarity 134, member B)'nin daha önceki çalışmalarımızda Huh7 karaciğer kanseri hücre hattında kendiliğinden gelişen hücre yaşlanmasında yapılan gen ifade profilleri analizi sonucunda hücre yaşlanmasıyla ilgili olduğunu tespit ettik. Bu bilgiden yola çıkarak bu çalışmada özellikle FAM134B'nin karaciğer kanseri ve endoplazmik retikulum stresi konuları çerçevesinde niteliklerinin belirlenmesini amaçladık. İlk olarak, hücre yaşlanması ve FAM134B ilişkisi Huh7 hücrelerinde erken hücre yaşlanmasına neden olarak test ettik. Adriamisin ve TGF-ß kullanılarak sebep olunan erken hücre yaşlanması FAM134B gen ifadesinde artışa neden olmadı. Bu nedenle, kendiliğinden gelişen hücre yaşlanmasında görülen gen ifade artışının doğrudan hücre yağlanma fenotipiyle alakalı olmadı sonucuna vardık. Daha sonra, FAM134B'nin iyi diferansiye ve kötü diferansiye karaciğer kanseri hücre hatlarındaki mRNA ve protein seviyelerini analiz ettik. Sonuçlara göre, FAM134B ifadesi karaciğer kanserinin daha ileri aşamasını ve metastatik karakteristiğini temsil eden kötü diferansiye hücre hatlarında daha yüksektir. Diğer taraftan, FAM134B ve endoplazmik retikulum stres ilişkisi üzerinde yaptığımız araştırmalar, FAM134B'nin tapsigargin, tunikamisin ve DTT gibi endoplazmik retikulum stresine neden olan kimyasallarla gen ifadesinde artışla yanıt verdiğini tespit ettik. Bu nedenle, FAM134B'nin endoplazmik retikulum stresine yanıt veren bir gen olduğunu gösterdik. Bu sonuçla birlikte, kötü diferansiye hücre hatlarındaki yüksek FAM134B protein ve mRNA miktarlarını bu hücrelerdeki bazal seviyede endoplazmik retikulum stres yanıtıyla ilişkilendirdik. Ayrıca, bu geni yüksek seviyede ifade eden Huh7 hücrelerinde yaptığımız deneyler sonucunda FAM134B'nin kendi başına endoplazmik retikulum stres yanıtı ve otofajiye neden olamayacağını gösterdik. Ancak, tapsigargin ve tunikamisin kullanarak yapılan yapay endoplazmik retikulum stresi durumunda FAM134B'nin hücre yanıtında etkili olduğunu gördük. Huh7 hücrelerinde FAM134B geninin yüksek ifadesi tapsigargin ve tunikamisinin neden olduğu kontrollü hücre ölümü yanıtına duyarlılığı artırdığı sonucuna vardık. Ayrıca bu genin yüksek ifadesinin yine aynı şekilde endoplazmik retikulum stresi uygulandığı durumda hücrelerin çoğalma yeteneğini daha çok azalttığını gösterdik. Buna bağlı olarak, FAM134B, dışarıdan endoplazmik retikulum stresinin başlatıldığı durumlarda stresin şiddetinin artmasında rol oynadığını düşünmekteyiz. Bununla birlikte, dokular üzerinde yaptığımız çalışmada FAM134B ifadesinin beyin ve karaciğerde yoğun olduğunu gösterdik. Tüm bunlar göz önüne alındığında, FAM134B'nin karaciğer dokusunda biriken hasara ve böylece karaciğer kanserinin gelişimine etkili olma ihtimali vardır.

Özet (Çeviri)

Family with sequence similarity 134, member B (FAM134B) is a replicative senescence associated gene, previously identified in studies of our group as a result of microarray analysis in spontaneously senescent clones of Huh7 hepatocellular carcinoma cell line and their immortal counterparts. Originating from this finding, this study primarily focused on characterization of FAM134B in the context of hepatocellular carcinoma and endoplasmic reticulum stress. At the beginning, the relationship between senescence and FAM134B was experimented by inducing premature senescence in Huh7 cells. Adriamycin or TGF-ß induced premature senescence did not result in amplification of FAM134B gene expression, suggesting that upregulation of FAM134B expression in spontaneous replicative senescence is not directly associated with a senescence phenotype. Then, FAM134B mRNA and protein levels were analyzed in both well- and poorly-differentiated HCC cell lines. Results showed that FAM134B expression is greater in poorly-differentiated cell lines, which represent advanced and metastatic HCC in vitro. On the other hand, our studies on the relationship between FAM134B and endoplasmic reticulum (ER) stress showed that FAM134B is an ER stress response gene, whose expression is upregulated by induction of ER stress with chemicals, such as thapsigargin, tunicamycin or DTT. Therefore, high protein and mRNA levels of FAM134B in poorly-differentiated cell lines are linked to the presence of a basal level ER stress response in this group of cell lines. Furthermore, overexpression studies in Huh7 cells indicated that FAM134B cannot trigger an ER stress response or autophagic response in these cells. However, FAM134B was detected as an effector in cellular response, when ER stress is artificially induced by thapsigargin or tunicamycin treatments. FAM13B4 overexpression in Huh7 resulted in increased sensitivity to thapsigargin or tunicamycin induced apoptosis. Moreover, increased FAM134B expression was also associated with decreased proliferative capacity in response to ER stress induction with the same chemicals. Consequently, FAM134B was suggested to affect the severity of stress in the ER when ER stress is started with an inducer. In addition, our tissue based experiments revealed that FAM134B is expressed in the brain and liver. Taken together, FAM134B might be an important protein contributing to the liver tissue damage and pathogenesis of HCC.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    652771

    Biological functions of FAM134B and its associaction with cancer

    FAM134B'nin biyolojik işlevleri ve kanserle ilişkisi

    UMUR KELEŞ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyokimyaDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  2. Tez No

    177221

    Identification and characterisation of two endoplasmic reticulum protein isoforms encoded by senescence-associated FAM134B gene

    Hücre yaşlanmasıyla ilintli FAM134B geni tarafından kodlanan iki endoplasmik retikulum protein izoformunun belirlenmesi ve karakterizasyonu

    NİLGÜN TAŞDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  3. Tez No

    80242

    Vankomisin içeren Poli(D,L-laktik-ko-glikolik asit) implantların karakterizasyonu ve in vitro-in vivo salım davranışlarının incelenmesi

    Characterization of vancomycin containing poly(d,l-lactide-co-glycolide) implants and investigation of their in vitro-in vivo release behaviour

    YILDIZ ÖZALP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURTEN ÖZDEMİR

  4. Tez No

    82603

    Characterization of arylamine N-acetyltransferase in tissues from human breast cancer

    İnsan kanserli meme dokusunda arilamin N-asetiltransferaz enziminin karakterizasyonu

    YAŞASIN SENEM GEYLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TÜLİN GÜRAY

  5. Tez No

    82785

    Characterization of Aspergillus oryzae transformed with a plasmid carrying alfa-amylase gene

    (Alfa)-amilaz geni taşıyan bir plazmid ile transforme edilmiş aspergillus aryzae'nin karakterizasyonu

    GÖKHAN TOLUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ

Geri Dön