Geri Dön

Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli suşlarında CTX-M enzimlerinin genomik değerlendirilmesi ve plazmid transformasyonu yoluyla aktırımının incelenmesi

Genomic evaluation of the CTX-M enzymes and investigated for the transferability of resistance by transformation experiment in extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli strains.

PDF İndir

  1. Tez No: 288684
  2. Yazar: ÖZLEM ÜNALDI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MELTEM YALINAY ÇIRAK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz, CTX-M, Escherichia coli, plazmid, Extended-spectrum beta-lactamase, CTX-M, Escherichia coli, plasmid
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia colisuşlarında CTX-M enzimlerinin genomik değerlendirilmesi ve plazmidtransformasyonu yoluyla aktarımının incelenmesi.Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten suşlarhastanelerde sınırlı kalmayıp toplumda da sorun oluşturmaya başlamıştır.Bu nedenle, uygun antimikrobiyal tedavinin seçilebilmesi için GSBL pozitifbakterilerde enzim tiplerinin belirlenmesi önemlidir.Bu çalışmanın amacı Gazi Üniversitesi Tıp FakültesiHastanesi'ne başvuran hastalardan izole edilen Escherichia coli suşlarındaGSBL varlığının araştırılması, CTX-M gen bölgesinin genomik incelenmesive CTX-M pozitif bulunan suşlarda direncin aktarılabilirliğininaraştırılmasıdır.Test edilen 280 suşun antibiyotiklere direnç oranları sefalotiniçin %89, amoksisilin/klavulonik asit için %79.7, siprofloksasin için %71.1,trimetoprim/sulfametaksazol için %67.3, aztreonam için %65.2,seftriakson için %62.2, gentamisin için %42, sefepim için %36.5,seftazidim için %26.8 ve piperasilin/tazobaktam için %5.0 olarak bulundu.Tüm suşlar imipenem duyarlı, ampisiline dirençli bulundu. En etkili betalaktam-beta-laktamaz inhibitör kombinasyonu piperasilin-tazobaktamolarak bulundu.PZR ile 280 suşun 205'i CTX-M pozitif bulundu ve CTX-M-15(89.2%) dizi analizi ile en baskın genotip olarak belirlendi. Bunu sırasıylaCTX-M-1, (6.8%) CTX-M-3 (3.4%) ve CTX-M-33 (0.4%)'ün izlediğigörüldü.CTX-M pozitif bulunan 205 suştan plazmid izolasyonu vetransformasyon ile direncin aktarılabilirliği incelendi. Elde edilen 169transformant PZR ile CTX-M pozitif bulundu. Bu suşlarda direncinplazmidler üzerinde taşındığı gösterildi.Sonuç olarak dünyada olduğu gibi ülkemizde de CTX-M tipiGSBL'lerin prevalansı yüksektir. Özellikle bu gruptaki GSBL'ler plazmidlerüzerinde beta-laktam antibiyotiklerin yanısıra pek çok antibiyotiğe karşıdirenç genlerini de taşımaktadır. Bu nedenle, sadece hastane kaynaklıdeğil, toplum kaynaklı enfeksiyonlarda da gerekli korunma ve kontrolönlemlerinin alınması, tedavide uygun antimikrobiyal seçimine yönverebilmesi açısından bu gibi çalışmalara gerek duyulmaktadır.

Özet (Çeviri)

Genomic evaluation of the CTX-M enzymes and investigated for thetransferability of resistance by transformation experiment inextended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia colistrains.Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing strainsare not limited in hospital settings have spread throughout communitysettings. Thus detection of beta-lactamase enzyme types in ESBL positivebacteria is important for the choice of appropriate antimicrobial agents fortreatment.The aim of this study was to determine the ESBL production,genomic analysis of CTX-M and investigation of the transferability ofresistance in CTX-M-positive Escherichia coli strains which were isolatedfrom patients applied to Gazi University Medical Faculty Hospital.The rates of antibiotic resistance in 280 strains werecephalothin (89%), amoxicillin/clavulanic acid (79.7%), ciprofloxacin(71.1%), trimethoprim/sulfamethoxazole (67.3%), aztreonam (65.2%),ceftriaxone (62.2%), gentamicin (42%), cefepime (36.5%), ceftazidime(26.8%), and piperacillin/tazobactam (5%). All strains were sensitive toimipenem, resistant to ampicilin. Piperacillin/tazobactam was the mosteffective combination of beta-lactam/beta-lactamase inhibitory.Analysis of these isolates by PCR revealed that 205 of 280were positive for the CTX-M gene. CTX-M-15 (89.2%) was the mostprevalent genotype. This was followed by CTX-M-1, (6.8%) CTX-M-3(3.4%) and CTX-M-33 (0.4%).Plasmid isolation and transformation were performed forCTX-M-positive 205 strains. CTX-M gene has been shown by PCR in 169transformants. This findings demonstrate that resistance genes are carriedon plasmids.As a result, there is a high prevalence of CTX-M-type ESBLsin our country. ESBLs, especially in this group, have also resistanceagainst many other antibiotics beside beta-lactam antibiotics. Therefore,similar researches are needed in order to take measures for preventionand control and for select appropriate antimicrobial agent in treatment notonly for nosocomial infections but also for community-acquired infections.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    310061

    Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten nozokomiyal Escherichia coli izolatlarında beta-laktamaz genleri ve klonal ilişkinin araştırılması

    Investigation of beta lactamases genes and clonal relatedness among the extended-spectrum beta lactamase producing-nosocomial Escherichia coli isolates

    SÜNDÜZ GÖRGEÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİnönü Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇİĞDEM KUZUCU

  2. Tez No

    310196

    Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında beta laktamaz direncinin polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılması

    Investigation of beta lactamase resistance in extended spectrum beta lactamase producing escherichia coli and klebsiella spp. isolates with polimerase chain reaction

    AHU KAMBUROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CELAL KURTULUŞ BURUK

  3. Tez No

    281821

    Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarında CTX-M enzim tiplerinin belirlenmesi

    Detection of CTX-M enzymes in ESBLs (Extended-spectrum beta-lactamases)-producing Escherichia coli and Klebsiella spp. strains

    ESRA DENİZ ÖGEDEY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiZonguldak Karaelmas Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FÜSUN CÖMERT

  4. Tez No

    195345

    Farklı şehirlerde izole edilen enterobacterıaceae üyelerinde CTX-M tipi genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretimi ve moleküler epidemiyolojisinin incelenmesi

    Investigation of the prevalence and molecular epidemiology of CTX-M type extended spectrum beta-lactamase producers among enterobacteriaceae family isolated in different cities

    GÜLFEM TEREK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP GÜLAY

  5. Tez No

    826410

    Üriner sistem enfeksiyon etkeni e. coli suşlarında fosfomisin direnç genleri, ctx-m, shv ve tem genlerinin araştırılması

    Investigation of fosfomycin resistance genes, ctx-m, shv, and tem genes in e coli strains as the causative agent of urinary system i̇nfections

    İPEK OMAY BEŞER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAL CEVAHİR

Geri Dön