Türk toplumunda prostat kanseri proteom profillerinin ve androjen reseptör, PSA, RNASEL gen polimorfizmlerinin incelenmesi
Investigation of proteome profiles and androgen receptor, PSA, RNASEL gene polymorphisms related to prostate cancer in Turkish population
- Tez No: 288685
- Danışmanlar: PROF. DR. ABDULLAH EKMEKÇİ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Genetik, Medical Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler-tümör, Polimorfizm-genetik, Prostat, Prostat hiperplazisi, Prostat neoplazmları, Prostat spesifik antijeni, Reseptörler-androjen, Testosteron, Türk toplumu, Biomarkers-tumor, Polymorphism-genetic, Prostate, Prostatic hyperplasia, Prostatic neoplasms, Prostate specific antigen, Receptors-androgens, Testosterone, Turkish society
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kanserin erken tanısı, kontrol ve önlenmesinde en önem taşıyan basamaktır. Proteom ve genom çalışmaları, kanser tanısı, prognoz takibi ve tedavi planlanmasını aydınlatacak veriler sağlamaktadır. Kanserin proteomik analizi aday biyobelirleyicilerin saptanması konusunda yeni fırsatlar sunmaktadır.Bu çalışmanın amacı Türk toplumunda prostat kanseri protein profillerinin proteomiklerle belirlenmesi, Türk toplumuna ait prostat kanseri serum çoklu biyobelirleyicilerin tanımlanması ve prostat kanseri ile ilişkili sıklıkla üzerinde çalışılan gen polimorfizmlerinin incelenmesidir.Proteom profilleri 47 prostat kanseri, 50 benign prostat hiperplazisi, 20 PSA 0 prostatektomi sonrası hasta ve 20 sağlıklı kişi serumlarında surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight (SELDI-TOF) kütle spektrometresi ile analiz edildi. Moleküler genetik analiz Androjen Reseptör (AR) CAG tekrarları, Prostat Spesifik Antijen (PSA) promoter bölge ve RNASEL gen polimorfizmlerine yönelik yapıldı.Proteom analizi sonucunda kontrol gruplarıyla karşılaştırıldığında prostat kanseri olan grupta 7 farklı serum proteini belirlendi (p<0.01). Prostat kanseri grubunda normal serum seviyesinden düşük olan 4 ve yüksek olan 3 tane protein bulundu. 6628 Da ağırlığındaki protein ayrıcalıklı olarak değerlendirildi (p<0.001). Yapılan moleküler genetik analizler sonucunda ise AR geni ekson 1 bölgesinde (CAG)n tekrarları PSA -158, PSA -252, ve RNASEL D541E polimorfizmleri prostat kanseri ve benign prostat hiperplazisi kontrol grubunda istatistiki olarak anlamlı bulunmadı.Proteom çalışmaları ile prostat kanseri için farklı biyobelirleyiciler tanımlanması mümkün olabilmektedir. Türk toplumu için kesitsel de olsa özellikle prostat kanserinde yeni bir biyobelirleyici (6628 Da) dikkat çekmektedir. AR geni CAG kısa tekrarları, PSA promoter bölge ve RNASEL D541E polimorfizmlerinin prostat kanser riski ile ilişkisi konusunda anlamlı bir sonuç elde edilememiştir. Proteom ve genotip ilişkisinin ortaya konulabilmesi için daha ileri çalışmalara gerek duyulmaktadır. Bu çalışmadan elde edilen sonuçlar proteomik çalışmaların kanser erken tanısında oldukça doğru ve yeni bir yaklaşım yaratabileceğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
The early detection of cancer is crucial for its ultimate control and prevention. Proteome and genome studies provide data and new insights into cancer diagnosis, following the prognosis and treatment plans. Proteomic analysis of cancer provides new opportunities to identification of candidate biomarkers.The aim of this study is to determine protein profilles of prostate cancer patients in Turkish population, identify multiple biomarkers in serum and investigate related frequent gen polymorphisms in prostate cancer.Proteom profilles were analyzed for 47 prostate cancer, 50 benign prostate hiperplazi and 20 post prostatectomy PSA value 0 patients and 20 healthy control group by surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight (SELDI-TOF) mass spectrometry. Molecular genetic analysis were carried out towards the polymorphisms of Androgen Receptor (AR) CAG repeats, Prostate Specific Antigen (PSA) promoter region and RNASEL gene.Seven serum differential proteins were identified in the PCa group compared with the control groups (P < 0.01) in proteome analysis. There were 4 proteins at the lower serum level and 3 proteins at the higher serum level in the PCa group. 6628 Da was evaluated as special and privileged for prostate cancer (p<0.001). According to the molecular genetic analysis there were no statistical difference between prostate cancer and benign prostate hyperplasia groups due to the polymorphisms of (CAG)n repeats in AR gene ekson 1 region. PSA -158, PSA -252 and RNASEL D541E.It is possible to identify different biomarkers for prostate cancer by means of proteomic studies. In this sectional study, a new serum biomarker (6628 Da) of PCa for Turkish population is remarkable. The results show that there is no significant relationship between AR gene short repeats and polymorphisms of promoter region of PSA gene and RNASEL D541E. Further studies should be performed to clarify the proteome and genotype association. Results obtained from this study show that proteomic researches will provide a highly accurate and innovative approach for the early diagnosis of cancer.
Benzer Tezler
- Türk toplumunda steroid redüktaz (SRD5A2) ve 17 hidroksilaz (CYP17) gen polimorfizmleri ile prostat kanseri arasındaki ilişkinin belirlenmesi
Prostat cancer risk and polymorphism in 17 hydroxylase (CYP17) and steroid reductase (SRD5A2) in Turkish population
HACER İLKE ÖNEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Tıbbi BiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ABDULLAH EKMEKÇİ
- Prostat kanseri ile ilişkili olduğu düşünülen bazı gen polimorfizmlerinin Türk hastalarda incelenmesi
Investigation of some gene polymorphisms thought to be associated with prostate cancer in Turkish patients
EBRU ÖZKAN
Doktora
Türkçe
2014
GenetikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK TURGUT BALIK
- Otopsi serilerinde prostat kanseri ve mesane tümörü insidansının araştırılması
The evaluation of the prostate cancer and the bladder tumors incidence in autopsy series
KADİR POLAT
- Prostat kanseri olan hastalarda homeobox protein B13 (hoxb13) geni G84E mutasyonunun değerlendirilmesi
Evaluation of homeobox protein B13 (hoxb13) gene g84e mutation in patients with prostate cancer.
MELİH BIYIKOĞLU
- Prostat kanseri ile ilişkili genlerin yeni nesil dizileme yöntemi ile incelenmesi: Biyoinformatik araçlar ve veritabanları
Investigation of genes associated with prostate cancer bynext generation sequencing: Bioinformatics tools anddatabases
ALİ YAVUZ ÇAKIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
GenetikSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ KUYAŞ HEKİMLER ÖZTÜRK