Geri Dön

Sparıdae (Perciformes, actinopterygii) türlerinde mitokondriyal genom evrimi

Mitochondrial genome evolution in sparidae (Perciformes, actinopterygii) species

  1. Tez No: 299268
  2. Yazar: DENİZ KANCA
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHMET BAKİ YOKEŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Deniz Bilimleri, Genetik, Biology, Marine Science, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Haliç Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 73

Özet

Populasyon çalışmaları ve filogenetik analizler, türler içindeki ve türler arasındaki bağlantıları ortaya koymanın yanı sıra bireylerin kendi aralarındaki ve çevre ile etkileşimlerini de açıklamaya yarar. Farklı coğrafi ve iklimsel koşullara uyum sağlamaya çalışan türlerin gen havuzlarında olan değişimler evrimin temel mekanizmasını oluşturur. Bireylerin genetik yapısındaki değişime sebep olan mutasyonlar, bu mekanizmanın temel direğidir.Tür içinde ve türler arasındaki evrimsel ilişkileri açıklamak için belirli genler kullanılırlar. Bu genler sahip oldukları korunmuşluk derecesi veya hızlı değişim özellikleri ile populasyon çalışmalarının özelleşmesini sağlarlar. Mitokondrinin büyük çoğunlukla anasal kalıtım göstermesi, genomunun küçük olması, mutasyon hızının yüksek olması, aşırı değişken bölgelerdeki kodlayıcı veya düzenleyici bölgelerin eksikliği ve rekombinasyona uğramaması mitokondriyal genlerin markör olarak tercih edilme sebeplerindendir. Evrimsel olarak korunmuş 16S rRNA ve COI genleri türler arası filogenetik analizler ve tür-spesifik çalışmalar için uygundur.Bu çalışmada, Akdeniz'de yaşayan Sparidae (Perciformes, Actinopterygii) türlerinde tür içi ve türler arası evrimsel ilişkileri açıklamak için mitokondriyal 16S rRNA ve COI genleri MrBayes ve PAUP platformlarında incelenmiştir. Spicara cinsi kök atanarak çizilen soy ağaçları Diplodus cinsinin monofiletik olduğunu ve Oblada melanura türünün Diplodus cinsine dahil edilmesi gerektiğini, Dentex ve Pagellus cinslerinin parafiletik kökenlere sahip olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Population studies and phylogenetic analyses exhibit interspecific and intraspecific relations while explaining inter individuals and environmental interactions.The changes in the gene pool of the species which endeavour the adaptation to the different geographical and climatological conditions constitute the fundamental mechanism of evolution. The mutations which cause the changes in the genetic structure of individuals are essential for this mechanism.Certain genes are used to describe interspecific and intraspecific evolutionary relations. These genes provide the specificity of population studies with their conservation degree or rapid change properties. Since mitochondria are generally maternally inherited, have a rapid mutation rate and a small genome along with the lack of coding and noncoding sites in hypervariable regions and nonoccurrence of recombination, mitochondrial genes are preferred markers. Evolutionary conserved 16S rRNA and COI genes are suitable for intraspecific phylogenetic analyses and species specific studies.In this study, mitochondrial 16S rRNA and COI genes have been investigated on MrBayes and PAUP platforms in order to explain interspesific and intraspecific relations in Sparidae (Perciformes, Actinopterygii) members native to Mediterranean Sea. It has been shown that genus Dentex and Pagellus have paraphyletic origin while genus Diplodus has monophyletic origin and that Oblada melanura should be included in Diplodus genus, when genus Spicara are assigned as outgroup on the phylogenetic tree.

Benzer Tezler

  1. Türkiye kıyısal sularında dağılım gösteren Sparidae familyasına ait taksonların mitokondriyal DNA dizilerine dayalı genetik analizi

    Genetic analysis of the taxa belonging to the family Sparidae (Pisces: Perciformes) distributed in Turkish coastal waters based on mitochondrial DNA sequences

    İSMAİL AKSU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. YUSUF BEKTAŞ

  2. Mercan balığı (Pagellus Acarne)' nın stok yoğunluğunun belirlenmesi

    Identification of black spot sea bream's (Pagellus Acarne) density of stock

    SEÇKİN AKIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Su ÜrünleriÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSA BULUT

  3. Karadeniz Bölgesi'ndeki sivriburun karagöz balığının (Diplodus puntazzo Walbaum, 1792) bazı biyolojik parametreleri

    Some biological parameters of the sharpsnout seabream (Diplodus puntazzo Walbaum, 1792) in the Black Sea region

    ÇAĞRI ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Balıkçılık TeknolojisiOrdu Üniversitesi

    Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET AYDIN

  4. Sparidae familyasına ait balıklarda yetiştiricilik koşularında gözlenen kemik ve kıkırdak deformasyonlarının belirlenmesi

    Determination of bone and cartilage deformation in culture condition in sparidae

    DENİZ ÇOBAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. ŞAHİN SAKA

  5. Ağ kafeslerde alternatif sparıdae türlerinin; sinagrit (Dentex dentex L., 1758), sivriburun karagöz (Diplodus puntazzo cetti, 1777), kırma mercan (Pagellus erythrinus L., 1758), mırmır (Lithognathus mormyrus L., 1758), çipuraya (sparus aurata L., 1758) göre gelişim parametrelerinin karşılaştırılması

    Comparison of growth performance; alternative sparidae species common dentex (Dentex dentex L., 1758), sharpsnout seabream (Diplodus puntazzo cetti, 1777), common pandora (Pagellus erythrinus L., 1758), striped seabream (Lithognathus mormyrus L.,1758) with gilthead seabream (sparus aurata L.,1758) in net cages

    SAİT CENK SERT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği Bölümü

    YRD. DOÇ. DR. ALİ YILDIRIM KORKUT