İki foton uyartım temelli mikroskopik hücre görüntülerinden üç boyutlu yapının modellenmesi
3D modelling of two photon excitation based microscopic cell images
- Tez No: 301880
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET ENGİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği, Electrical and Electronics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 93
Özet
Bu tez kapsamında; konfokal floresans ve iki foton floresans mikroskopi yöntemleri kullanılarak floresans proteinler ile işaretlenmiş kanser hücreleri incelenmiştir. Bağ dokusu taklitleri de konfokal yansıma ve ikinci harmonik üretimi mikroskopi yöntemleri ile incelenmiştir. Yöntemler, bağ dokusu taklitlerinin optik nüfuz derinliği ve kontrastı, floresans proteinlerinin fotobeyazlatma dayanıklılığı ve nüfuz derinliği açısından karşılaştırılmıştır.Son olarakta hücre görüntüleri, görüntü işleme yöntemleri ile iyileştirilmiş ve üç boyutlu şekilde geriçatılmıştır. Dalgacık Dönüşümü tabanlı bir ters evrişim yöntemi ve referans görüntünün bilinmediği durumlar için görüntü kalitesi ölçütü önerilmiştir. Sonuçlarımız, önerdiğimiz yöntemlerin floresans mikroskopi görüntülerine uygulanabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Within the scope of this dissertation; fluorescent proteins labeled cancer cells were investigated using Confocal Fluorescence and Two Photon Fluorescence microscopy methods. Also Extracellular Matrix mimics were investigated using Confocal Reflection and Second Harmonic Genaration microscopy methods. Methods were compared with regard to penetration depth and contrast of ECM mimics, photobleaching and penetration depth of fluorescent proteins.Finally, cell images were enhanced using image processing techniques and reconstructed three dimensionally. A Wavelet Transform based deconvolution method and a non-reference image quality metric were proposed. Our results show that our methods are applicable to fluorescence microscopy images.
Benzer Tezler
- Flexible optoelectronic biointerfaces using quantum dots and pseudocapacitive materials for photoelectric stimulation of neurons
Nöronların fotoelektrik uyarımı için kuantum nokta ve pseudokapasitör malzeme tabanlı esnek optoelektronik biyoarayüzler
ONURALP KARATÜM
Doktora
İngilizce
2023
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiKoç ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEDAT NİZAMOĞLU
- Three-photon electromagnetically induced transparency in Rydberg atoms
Rydberg atomlarında üç-foton uyarımlı elektromanyetik olarak indüklenmiş şeffaflık
YAĞIZ OYUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüFotonik Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVİLAY SEVİNÇLİ
DOÇ. DR. ÖZGÜR ÇAKIR
- Monolayer-thick light-sensitive nanocrystal skins of oriented colloidal quantum wells
Tek katman kalınlığında yönlendirilmiş koloidal kuantum kuyuları tabanlı ışığa duyarlı nanokristal yüzeyleri
TAYLAN BOZKAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Bilim ve Teknolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİLMİ VOLKAN DEMİR
- Towards fully 3D-printed miniaturized confocal imager
Üç boyutlu yazıcı ile üretilmiş minyatürize konfokal görüntüleyici
JANSET SAVAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ONUR FERHANOĞLU
YRD. DOÇ. DR. YİĞİT DAĞHAN GÖKDEL
- Tayf çizgilerinin oluşumları ve şekilleri
Başlık çevirisi yok
ELMAS KÖROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1993
Astronomi ve Uzay BilimleriEge ÜniversitesiAstronomi ve Uzay Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMÜR GÜLMEN