Evaluating the interactions between neurofilament promoters and the ETS transcription factor PEA3 by using different cell lines
Nörofilament promoterları ve bir ETS transkripsiyon faktörü olan PEA3 ilişkisinin farklı hücre dizileri kullanılarak değerlendirilmesi
- Tez No: 305871
- Danışmanlar: DOÇ. DR. IŞIL AKSAN KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Nöroloji, Biotechnology, Neurology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 127
Özet
Ets transkripsiyon faktörü ailesinin bir üyesi olan PEA3 proliferasyon, farklılaşma, apoptoz ve transformasyon gibi pek çok hücresel olayda rol oynamaktadır. Ailenin diğer üyelerinden farklı olarak, PEA3 ile yapılan çalışmaların çoğu bu proteinin karsinojenezdeki görevlerine odaklanmaktadır. Nörofilamentler, sinir hücresi iskeletinin kurulmasında yer alırlar ve üç farklı boyuttaki alt ünitelerden (hafif NF-L, orta NF-M ve ağır NF-H) oluşurlar. Bu tezde, NF-L ve NF-M alt unite promoterlarında mPEA3 transkripsiyon faktörünün transaktivitesine göre oluşacak anlatım farklılıkları ile mPEA3'nin varsayılan fosforilasyon bölgeleri üzerinde çalışmalar yapılmıştır. Bunun için, nörofilament promoterları üzerindeki varsayılan mPEA3 bağlanma motiflerinde ve MAPK yolağının fosforile ettiği düşünülen mPEA3 kısımlarında mutasyonlar oluşturulmuştur. Yabani türler ile mutant formlar arasındaki farklılığı ölçmek için yönlendirilmiş mutasyon, lusiferaz assay, kromatin immünopresipitasyon (ChIP) ve Western blot yöntemleri kullanılmıştır. NF-L promoter aktivitesi için ikincil ets bağlanma motifi önemliyken, NF-M promoter aktivitesi için varolan tek ets bağlanma motifinin Pea3 ile ilişkide etkili olduğu görülmüştür. Sonuçlar farklı yöntemlerle desteklenip genişletilmelidir.
Özet (Çeviri)
PEA3, a member of the widely-known Ets transcription factor family, takes role in many of the cellular processes including proliferation, differentiation, apoptosis and transformation. Apart from other members of the family, the studies on PEA3 are usually focused on its function in carcinogenesis. Neurofilaments are well-known for taking part in constitution of neuronal cytoskeleton and are made up of three subunits that different in size, namely light (NF-L), medium (NF-M) and heavy (NF-H) subunits. In this thesis, the relationship between expression of NF-L and NF-M subunit promoters and transactivity of mPEA3 transcription factor were assessed together with investigating the putative phosphorylation sites for mPEA3. For this, mutations were created at putative binding motifs for mPEA3 on neurofilament promoters and at putative sites for mPEA3 phosphorylation by MAPK. Site directed mutagenesis (SDM), luciferase assay, chromatin immunoprecipitation (ChIP) and Western blot were used for measuring differences in transactivation wild type and mutant promoter or transcription factors on NF-L and NF-M promoters in SH-SY5Y and HEK 293 cell lines. For NF-L promoter activity the secondary ets binding motif was crucial while for NF-M promoter activity the mere ets binding motif was found to be in interaction with Pea3. The results have to be further proved and expanded with other methods.
Benzer Tezler
- Otizm spektrum bozukluğu tanılı çocuklarda periferik dolaşımda nörofilaman hafif zinciri, glial fibriller asidik protein, tau proteini, s 100b düzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of neurofilament light chain, glial filaments acidic protein, tau protein, s100b levels in the peripheral circulation of children with autism spectrum disorder
ZEYNEP NUR YILANCI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
PsikiyatriNecmettin Erbakan ÜniversitesiÇocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NECATİ UZUN
- OECD ülkelerinin insani gelişmişlik performanslarının veri zarflama analiziyle değerlendirilmesi
Evaluating the human development performance of OECD countries via data envelopment analysis
HAKAN KILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGÜR KABAK
- Canlılık deneyimleri kapsamında biyo sanat ve heykel
Bio art and sculpture within the scope of vitality experiences
DENİZ ERGUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Güzel SanatlarAnadolu ÜniversitesiHeykel Ana Sanat Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SELÇUK YILMAZ
- Computing the effect of antenna locations on the radiation pattern on board complex platforms
Kompleks platformların üzerindeki antenlerin yerleşimlerinin ışıma paternlerine etkisi
SONER KARACA
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiDeniz Harp Okulu KomutanlığıElektronik ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ARİF ERGİN
- Kentsel ulaşım planlamasında (KUP) arazi kullanımı-ulaşım etkileşiminin modellenmesi: İstanbul üzerine bir değerlendirme
Başlık çevirisi yok
AZİME TEZER