Geri Dön

Prostaglandin D2 reseptör antagonist türevlerinin QSAR çalışması

QSAR studies of prostaglandin analogs as D2 receptor antagonist

PDF İndir

  1. Tez No: 309455
  2. Yazar: MEHMET YAKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NURCAN KARACAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 86

Özet

Bu çalışmada, Toda ve ark. Tarafından sentezlenmiş 80 tane indol türevinin QSAR (Kantitatif Yapı Aktivite İlişkisi) analizi yapılmıştır. Bu prostaglandin D2 (PGD2) reseptör antagonistleri, PGD2 reseptörüne kuvvetlice bağlanır ve halkalı adenozin 3', 5'-monofosfat (cAMP) oluşumunu in vitro bloke eder. Oral olarak alındığında bu bileşikler vasküler geçirgenliği arttırarak alerjik inflamatuar etkileri büyük ölçüde baskılayabilirler.Bütün veri seti, uygulama seti (70 bileşik) ve test set (10 bileşik) olarak rastgele bir şekilde ikiye ayrılmıştır. En uygun moleküler diskriptörleri seçmek amacıyla CODESSA 2.7.2 programındaki Heuristic ve Best Multi Linear Regression (BMLR) metotları kullanılmış ve doğrusal QSAR modelleri oluşturulmuştur.Heuristic metot ile elde edilen beş parametreli model denklemin uygulama seti ve test set için çapraz validasyon korelasyon katsayısının karesi (R2CV) değerleri sırasıyla 0.7130 ve 0.6684' tür. Bununla birlikte BMLR metoduyla elde edilen beş parametreli model denklemin uygulama seti ve test set için korelasyon (R2) değerleri sırasıyla 0.7195 ve 0.7227' dir. QSAR analizlerine göre bileşiklerin reseptöre bağlanmasında en önemli faktörler N atomu üzerindeki bağıl negatif yük ve minimum net atomik yüktür. Ayrıca bileşiklerin inhibisyon aktivitesi H-Bağı Yüzey Alanı ile artmaktadır.

Özet (Çeviri)

In this study, a QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) analysis was carried out by using 80 indole derivatives synthesized by Toda et.al.. These prostaglandin D2 (PGD2) receptor antagonists exhibit strong PGD2 receptor binding and blocked cyclic adenosine 3?, 5?-monophosphate (cAMP) formation in vitro. When given orally, these compounds dramatically suppress allergic inflammatory responses via increase of vascular permeability.The whole data set was divided into a training set (70 compounds) and a test set (10 compounds) randomly. Heuristic Method and The Best Multi-Linear Regression (BMLR) method in CODESSA 2.7.2 were used to select the most appropriate molecular descriptors from a large set of descriptors and develop a linear QSAR model.The resulting five-parameter model with Heuristic Method produced squared cross-validation correlation coefficient (R2CV) of 0.7130 and 0.6684 for the training and test sets, respectively. However, five-parameter model with BMLR gave correlation values (R2) of 0.7195 and 0.7227 for the training and test sets, respectively. QSAR analysis revealed that relative negative charge on N atom and the minimum net atomic charge on the compounds were more significant factors for receptor binding. In addition, inhibitor activity of the compounds was also increases with increasing H-Bonding Surface Area.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    768131

    KOAH hastaları arasında astım-KOAH overlap (AKO) sıklığı ve ayırıcı tanıda prostaglandin D2 (PGD2)' nin rolü

    Frequency of asthma-COPD overlap (ACO) in copd patients and the role of prostaglandin d2 (PGD2) in differential diagnosis

    SAADET HAN ASLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyokimyaPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR ENLİ

  2. Tez No

    849471

    Study the role of beta-trace protein and cystatin-c as a biomarkers with some biochemical variables in the early detection of type 2 diabetic nephropathy

    Beta-iz protein ve sistatin-c'nin bazı biyokimyasal değişkenler ile birlikte biyomarker olarak tip 2 diyabetik nefropatinin erken tespitindeki rolünün incelenmesi

    KAMAL AL-DEEN HUSSEIN ALI ALI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞEVKİ ADEM

    PROF. DR. HADAF DHAFIR EL YASSIN

  3. Tez No

    758655

    Nonsteroid anti-inflamatuvar ilaçlarla alevlenen hava yolu hastalığında (N-ERD) platelet-lökosit kümelerinin rolünün araştırılması

    Investigation of the role of platelet-leukocyte aggregates in nonsteroidal anti-inflammatory drug exacerbated respiratory disease (N-ERD)

    SELCAN GENÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Allerji ve İmmünolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM ÇAĞATAY KARAASLAN

    DOÇ. DR. EBRU DAMADOĞLU

  4. Tez No

    704016

    Göğüs hastalıkları polikliniğimizde takip edilen KOAH tanılı hastalarda astım-KOAH overlap sıklığı ve prostoglandin D2'nin tanısal değeri

    Copd followed in our chest diseases polyclinicfrequency of asthma-COPD overlap in diagnosed patients anddiagnostic value of prostoglandin D2

    FATİH ÖZDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Göğüs HastalıklarıErzincan Binali Yıldırım Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA TOSUN

  5. Tez No

    480061

    Kronik astım modelioluşturulan farelerde sinomenin'in akciğerhistopatolojisi ve sitokin düzeyleri üzerine etkinliğinin değerlendirilmesi

    The effect of sinomenine on lung histopathology and cytoki̇ne levels in a murine model of chronic asthma

    SAKİNE IŞIK

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Allerji ve İmmünolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVİN UZUNER

Geri Dön